GC_ID:1 ncbi_taxonomy all NCBITaxon:1 root all GC_ID:1 PMID:15371245 ncbi_taxonomy NCBITaxon:10066 Muridae GC_ID:1 Mus mice mouse ncbi_taxonomy NCBITaxon:10088 Mus <genus> Mus mice mouse NCBITaxon:85055 GC_ID:1 house mouse mouse ncbi_taxonomy NCBITaxon:10090 Mus musculus house mouse mouse GC_ID:1 rat rats ncbi_taxonomy NCBITaxon:10114 Rattus rat rats NCBITaxon:36465 GC_ID:1 Norway rat brown rat rat rats ncbi_taxonomy Mus norvegicus NCBITaxon:10116 Rattus norvegicus brown rat rat rats Mus norvegicus Norway rat GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:10128 Apodemus GC_ID:1 Acanthocephala acanthocephalans spiny-headed worms thorny-headed worms ncbi_taxonomy thorny-headed worms NCBITaxon:10232 Acanthocephala <thorny-headed worms> Acanthocephala acanthocephalans spiny-headed worms thorny-headed worms thorny-headed worms GC_ID:1 ncbi_taxonomy Vira Viridae viruses NCBITaxon:10239 Viruses Vira Viridae viruses GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:10240 Poxviridae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:10241 Chordopoxvirinae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:10242 Orthopoxvirus CPXV GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:10243 Cowpox virus CPXV NCBITaxon:130669 NCBITaxon:130670 GC_ID:1 monkey pox virus ncbi_taxonomy NCBITaxon:10244 Monkeypox virus monkey pox virus GC_ID:1 vaccinia virus VV ncbi_taxonomy NCBITaxon:10245 Vaccinia virus vaccinia virus VV NCBITaxon:12871 GC_ID:1 small pox virus smallpox smallpox virus variola virus VAR ncbi_taxonomy NCBITaxon:10255 Variola virus small pox virus smallpox smallpox virus variola virus VAR GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:10257 Parapoxvirus GC_ID:1 Contagious pustular dermatitis virus ncbi_taxonomy NCBITaxon:10258 Orf virus Contagious pustular dermatitis virus GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:10278 Molluscipoxvirus MOCV GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:10279 Molluscum contagiosum virus MOCV GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:10292 Herpesviridae GC_ID:1 Alphaherpesviruses ncbi_taxonomy NCBITaxon:10293 Alphaherpesvirinae Alphaherpesviruses GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:10294 Simplexvirus HSV-1 HSV1 GC_ID:1 Herpes simplex virus type 1 Human herpesvirus type 1 herpes simplex virus 1 HSV-1 herpes simplex virus HSV-1 herpes simplex virus type 1 HSV-1 herpes simplex virus type 1 HSV1 herpes simplex virus type-1 HSV-1 ncbi_taxonomy Herpes simplex virus 1 Human herpesvirus 1 NCBITaxon:10298 Human alphaherpesvirus 1 HSV-1 HSV1 Herpes simplex virus type 1 Human herpesvirus type 1 herpes simplex virus 1 HSV-1 herpes simplex virus HSV-1 herpes simplex virus type 1 HSV-1 herpes simplex virus type 1 HSV1 herpes simplex virus type-1 HSV-1 Herpes simplex virus 1 Human herpesvirus 1 HSV2 GC_ID:1 Herpes simplex virus (type 2) Herpes simplex virus II Herpes simplex virus type 2 Herpes simplex virus type 2 (HSV-2) Human herpesvirus 2 ncbi_taxonomy Herpes simplex virus 2 herpes simplex virus type 2 HSV-2 NCBITaxon:10310 Human alphaherpesvirus 2 HSV2 Herpes simplex virus (type 2) Herpes simplex virus II Herpes simplex virus type 2 Herpes simplex virus type 2 (HSV-2) Human herpesvirus 2 Herpes simplex virus 2 herpes simplex virus type 2 HSV-2 GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:10319 Varicellovirus HHV-3 VZV GC_ID:1 Human herpes virus 3 Human herpesvirus 3 Varicella Zoster Virus Varicella-zoster virus varicella zoster virus VZV varicella-zoster virus VZV ncbi_taxonomy NCBITaxon:10335 Human alphaherpesvirus 3 HHV-3 VZV Human herpes virus 3 Human herpesvirus 3 Varicella Zoster Virus Varicella-zoster virus varicella zoster virus VZV varicella-zoster virus VZV GC_ID:1 Betaherpesviruses ncbi_taxonomy NCBITaxon:10357 Betaherpesvirinae Betaherpesviruses GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:10358 Cytomegalovirus HHV-5 GC_ID:1 Human cytomegalovirus Human herpesvirus 5 human herpesvirus type 5 ncbi_taxonomy NCBITaxon:10359 Human betaherpesvirus 5 HHV-5 Human cytomegalovirus Human herpesvirus 5 human herpesvirus type 5 NCBITaxon:41670 HHV-6 HHV6 GC_ID:1 Herpesvirus type 6 Human herpesvirus 6 Human herpesvirus type 6 herpes simplex virus type 6 herpesvirus 6 HHV-6 human herpesvirus 6 HHV-6 human herpesvirus type 6 HHV-6 ncbi_taxonomy NCBITaxon:10368 Human betaherpesvirus 6 HHV-6 HHV6 Herpesvirus type 6 Human herpesvirus 6 Human herpesvirus type 6 herpes simplex virus type 6 herpesvirus 6 HHV-6 human herpesvirus 6 HHV-6 human herpesvirus type 6 HHV-6 NCBITaxon:57277 HHV-7 GC_ID:1 Herpes simplex virus 7 Human herpesvirus 7 Human herpesvirus type 7 human herpesvirus 7 HHV-7 ncbi_taxonomy NCBITaxon:10372 Human betaherpesvirus 7 HHV-7 Herpes simplex virus 7 Human herpesvirus 7 Human herpesvirus type 7 human herpesvirus 7 HHV-7 GC_ID:1 Gammaherpesviruses lymphoproliferative virus group ncbi_taxonomy NCBITaxon:10374 Gammaherpesvirinae Gammaherpesviruses lymphoproliferative virus group GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:10375 Lymphocryptovirus NCBITaxon:47902 EPV HHV-4 GC_ID:1 Epstein Barr virus Epstein-Barr virus Epstein-Barr virus EBV Human herpesvirus 4 Human herpesvirus type 4 ncbi_taxonomy NCBITaxon:10376 Human gammaherpesvirus 4 EPV HHV-4 Epstein Barr virus Epstein-Barr virus Epstein-Barr virus EBV Human herpesvirus 4 Human herpesvirus type 4 GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:10379 Rhadinovirus GC_ID:1 eyeworms ncbi_taxonomy NCBITaxon:103826 Thelazia eyeworms GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:103828 Thelaziidae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:103829 Thelazioidea GC_ID:1 hepatitis B-type viruses ncbi_taxonomy NCBITaxon:10404 Hepadnaviridae hepatitis B-type viruses GC_ID:1 mammalian hepatitis B-type viruses ncbi_taxonomy NCBITaxon:10405 Orthohepadnavirus mammalian hepatitis B-type viruses HBV GC_ID:1 Human hepatitis B virus hepatitis B virus (HBV) hepatitis B virus HBV hepatitis B virus, HBV human hepatitis B virus HBV ncbi_taxonomy NCBITaxon:10407 Hepatitis B virus HBV Human hepatitis B virus hepatitis B virus (HBV) hepatitis B virus HBV hepatitis B virus, HBV human hepatitis B virus HBV GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:104454 Heterophyes GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:10508 Adenoviridae GC_ID:1 Human Papilloma Virus human papillomavirus HPV ncbi_taxonomy NCBITaxon:10566 Human papillomavirus Human Papilloma Virus human papillomavirus HPV GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:1056966 Aedini GC_ID:11 ncbi_taxonomy NCBITaxon:106178 canis group GC_ID:11 phagocytophila group ncbi_taxonomy NCBITaxon:106179 phagocytophilum group phagocytophila group GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:10780 Parvoviridae GC_ID:1 B19 virus Erythrovirus B19 Human erythrovirus B19 Parvovirus B19 ncbi_taxonomy NCBITaxon:10798 Human parvovirus B19 Erythrovirus B19 Human erythrovirus B19 Parvovirus B19 B19 virus true GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:10911 Coltivirus GC_ID:1 Rotaviruses ncbi_taxonomy NCBITaxon:10912 Rotavirus Rotaviruses GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:11018 Togaviridae GC_ID:1 Alphaviridae arboviruses group A ncbi_taxonomy NCBITaxon:11019 Alphavirus Alphaviridae arboviruses group A GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:11020 Barmah Forest virus RRV GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:11029 Ross River virus RRV VEE VEEV GC_ID:1 Venezuelan equine encephalitis VEE Venezuelan equine encephalitis virus VEE Venezuelan equine encephalomyelitis virus ncbi_taxonomy NCBITaxon:11036 Venezuelan equine encephalitis virus VEE VEEV Venezuelan equine encephalitis VEE Venezuelan equine encephalitis virus VEE Venezuelan equine encephalomyelitis virus GC_ID:1 ncbi_taxonomy Western equine encephalomyelitis virus NCBITaxon:11039 Western equine encephalitis virus Western equine encephalomyelitis virus GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:11040 Rubivirus GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:11041 Rubella virus GC_ID:1 Flavivirus (arbovirus group B) ncbi_taxonomy NCBITaxon:11050 Flaviviridae Flavivirus (arbovirus group B) GC_ID:1 arboviruses group B ncbi_taxonomy NCBITaxon:11051 Flavivirus arboviruses group B GC_ID:1 Dengue viruses ncbi_taxonomy NCBITaxon:11052 Dengue virus group Dengue viruses GC_ID:1 Dengue virus 1 Dengue virus type 1 dengue type 1 D1 virus dengue virus type 1 DEN1 dengue virus-1 DEN-1 type 1 dengue virus DEN-1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:11053 dengue virus type I Dengue virus 1 Dengue virus type 1 dengue type 1 D1 virus dengue virus type 1 DEN1 dengue virus-1 DEN-1 type 1 dengue virus DEN-1 NCBITaxon:307520 GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:110618 Nectriaceae GC_ID:1 Japanese encephalitis viruses ncbi_taxonomy NCBITaxon:11071 Japanese encephalitis virus group Japanese encephalitis viruses GC_ID:1 Japanese encephalitis (JE) virus Japanese encephalitis virus JE Japanese encephalitis virus JEV ncbi_taxonomy NCBITaxon:11072 Japanese encephalitis virus Japanese encephalitis (JE) virus Japanese encephalitis virus JE Japanese encephalitis virus JEV GC_ID:1 West Nile virus - Kunjin ncbi_taxonomy NCBITaxon:11077 Kunjin virus West Nile virus - Kunjin GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:11079 Murray Valley encephalitis virus NCBITaxon:64321 GC_ID:1 St. Louis encephalitis virus ncbi_taxonomy NCBITaxon:11080 Saint Louis encephalitis virus St. Louis encephalitis virus WNV GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:11082 West Nile virus WNV GC_ID:1 Flavivirus powassan ncbi_taxonomy NCBITaxon:11083 Powassan virus Flavivirus powassan TBEV GC_ID:1 FSME virus Tick born encephalitis virus tick-borne encephalitis virus TBE virus tick-borne encephalitis virus TBEV ncbi_taxonomy NCBITaxon:11084 Tick-borne encephalitis virus TBEV FSME virus Tick born encephalitis virus tick-borne encephalitis virus TBE virus tick-borne encephalitis virus TBEV LI GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:11086 Louping ill virus LI YFV GC_ID:1 Flavivirus febricis yellow fever virus YFV ncbi_taxonomy NCBITaxon:11089 Yellow fever virus YFV Flavivirus febricis yellow fever virus YFV GC_ID:1 PMID:12832207 PMID:7747470 ncbi_taxonomy NCBITaxon:11095 Pestivirus GC_ID:1 Hepatitis C virus group Hepatitis C viruses Hepatitis C-like viruses ncbi_taxonomy NCBITaxon:11102 Hepacivirus Hepatitis C virus group Hepatitis C viruses Hepatitis C-like viruses HCV GC_ID:1 Hepatitis C virus hepatitis C virus HCV human hepatitis C virus human hepatitis C virus HCV human hepatitis virus C HCV post-transfusion hepatitis non A non B virus ncbi_taxonomy NCBITaxon:11103 Hepacivirus C HCV Hepatitis C virus hepatitis C virus HCV human hepatitis C virus human hepatitis C virus HCV human hepatitis virus C HCV post-transfusion hepatitis non A non B virus GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:11118 Coronaviridae FIPV GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:11135 Feline infectious peritonitis virus FIPV GC_ID:11 PMID:10319462 PMID:11211265 PMID:21048221 PMID:21048222 PMID:23620152 ncbi_taxonomy NCBITaxon:1113537 Chlamydia/Chlamydophila group GC_ID:1 porcine respiratory coronavirus PRCV porcine respiratory virus ncbi_taxonomy NCBITaxon:11146 Porcine respiratory coronavirus porcine respiratory coronavirus PRCV porcine respiratory virus NCBITaxon:12859 TGEV GC_ID:1 Porcine transmissable gastroenteritis coronavirus Porcine transmissible gastroenteritis coronavirus porcine transmissible gastroenteritis virus transmissible gastroenteritis coronavirus transmissible gastroenteritis virus TGEV ncbi_taxonomy NCBITaxon:11149 Transmissible gastroenteritis virus TGEV Porcine transmissable gastroenteritis coronavirus Porcine transmissible gastroenteritis coronavirus porcine transmissible gastroenteritis virus transmissible gastroenteritis coronavirus transmissible gastroenteritis virus TGEV TCV GC_ID:1 Turkey enteric coronavirus ncbi_taxonomy NCBITaxon:11152 Turkey coronavirus TCV Turkey enteric coronavirus GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:111520 Penaeoidea GC_ID:11 ncbi_taxonomy NCBITaxon:111527 pseudomallei group GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:11155 Torovirus GC_ID:1 negative-sense genome single-stranded RNA viruses ncbi_taxonomy NCBITaxon:11157 Mononegavirales negative-sense genome single-stranded RNA viruses GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:11158 Paramyxoviridae true true NCBITaxon:11202 HPIV-3 HPIV3 GC_ID:1 Human parainfluenza 3 virus Human parainfluenza virus 3 Human parainfluenza virus type 3 Parainfluenza virus type 3 human parainfluenza virus 3 HPIV3 human parainfluenza virus type 3 PIV3 parainfluenza virus type 3 PIV-3 ncbi_taxonomy human parainfluenza virus NCBITaxon:11216 Human respirovirus 3 HPIV-3 HPIV3 Human parainfluenza 3 virus Human parainfluenza virus 3 Human parainfluenza virus type 3 Parainfluenza virus type 3 human parainfluenza virus 3 HPIV3 human parainfluenza virus type 3 PIV3 parainfluenza virus type 3 PIV-3 human parainfluenza virus NCBITaxon:451834 GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:112252 Fungi incertae sedis GC_ID:1 Morbilliviruses ncbi_taxonomy NCBITaxon:11229 Morbillivirus Morbilliviruses CDV GC_ID:1 Canine distemper virus canine distemper virus CDV ncbi_taxonomy NCBITaxon:11232 Canine morbillivirus CDV Canine distemper virus canine distemper virus CDV NCBITaxon:11230 GC_ID:1 Cell-associated subacute sclerosing panencephalitis Measles virus Subacute sclerosing panencephalitis virus measles virus MV rougeole virus rubeola virus subacute sclerose panencephalitis virus subacute sclerosing panencephalitis virus, SSPEV ncbi_taxonomy NCBITaxon:11234 Measles morbillivirus Cell-associated subacute sclerosing panencephalitis Measles virus Subacute sclerosing panencephalitis virus measles virus MV rougeole virus rubeola virus subacute sclerose panencephalitis virus subacute sclerosing panencephalitis virus, SSPEV GC_ID:1 Pneumovirinae ncbi_taxonomy NCBITaxon:11244 Pneumoviridae Pneumovirinae HRSV GC_ID:1 Human respiratory syncytial virus human RSV ncbi_taxonomy NCBITaxon:11250 Human orthopneumovirus HRSV Human respiratory syncytial virus human RSV NCBITaxon:11267 GC_ID:1 Filovirus ncbi_taxonomy NCBITaxon:11266 Filoviridae Filovirus GC_ID:1 PMID:16186241 ncbi_taxonomy NCBITaxon:11270 Rhabdoviridae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:11286 Lyssavirus GC_ID:1 Rabies lyssavirus Rabies virus ncbi_taxonomy NCBITaxon:11292 Lyssavirus rabies Rabies lyssavirus Rabies virus GC_ID:11 ncbi_taxonomy NCBITaxon:1129771 Leptotrichiaceae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:11308 Orthomyxoviridae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:1131492 Aspergillaceae FLUAV GC_ID:1 Human Influenza A Virus Influenza virus type A influenza A virus ncbi_taxonomy NCBITaxon:11320 Influenza A virus FLUAV Human Influenza A Virus Influenza virus type A influenza A virus GC_ID:11 PMID:9734038 ncbi_taxonomy NCBITaxon:114277 spotted fever group GC_ID:11 ncbi_taxonomy NCBITaxon:114292 typhus group GC_ID:1 primary screw-worm ncbi_taxonomy NCBITaxon:115425 Cochliomyia hominivorax primary screw-worm GC_ID:1 Bunyavirus Bunyaviruses ncbi_taxonomy NCBITaxon:11572 Orthobunyavirus Bunyavirus Bunyaviruses GC_ID:1 Bunyavirus la crosse ncbi_taxonomy NCBITaxon:11577 La Crosse virus Bunyavirus la crosse GC_ID:1 Phleboviruses ncbi_taxonomy NCBITaxon:11584 Phlebovirus Phleboviruses RVFV GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:11588 Rift Valley fever virus RVFV GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:11617 Arenaviridae true GC_ID:1 Lassa virus ncbi_taxonomy NCBITaxon:11620 Lassa mammarenavirus Lassa virus NCBITaxon:12748 LCMV GC_ID:1 Lymphocytic choriomeningitis virus lymphocytic choriomeningitis virus LCMV ncbi_taxonomy NCBITaxon:11623 Lymphocytic choriomeningitis mammarenavirus LCMV Lymphocytic choriomeningitis virus lymphocytic choriomeningitis virus LCMV GC_ID:1 Machupo virus ncbi_taxonomy NCBITaxon:11628 Machupo mammarenavirus Machupo virus GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:11632 Retroviridae GC_ID:1 Lentivirinae ncbi_taxonomy NCBITaxon:11646 Lentivirus Lentivirinae GC_ID:1 Primate immunodeficiency viruses ncbi_taxonomy NCBITaxon:11652 Primate lentivirus group Primate immunodeficiency viruses NCBITaxon:6795 GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:116704 Eubrachyura NCBITaxon:29963 NCBITaxon:6773 NCBITaxon:6803 GC_ID:1 ncbi_taxonomy Brachyrhyncha NCBITaxon:116706 Heterotremata Brachyrhyncha FIV GC_ID:1 feline immunodeficiency virus FIV ncbi_taxonomy NCBITaxon:11673 Feline immunodeficiency virus FIV feline immunodeficiency virus FIV HIV HIV-1 HIV1 LAV-1 GC_ID:1 human immunodeficiency virus 1 HIV-1 human immunodeficiency virus HIV-1 human immunodeficiency virus type 1 HIV 1 human immunodeficiency virus type 1 HIV1 human immunodeficiency virus type 1, HIV-1 human immunodeficiency virus type I HIV-1 human immunodeficiency virus type-1 HIV-1 human immunodeficiency virus-1 HIV-1 ncbi_taxonomy AIDS virus Human immunodeficiency virus type 1 human immunodeficiency virus type 1 HIV-1 NCBITaxon:11676 Human immunodeficiency virus 1 HIV HIV-1 HIV1 LAV-1 human immunodeficiency virus 1 HIV-1 human immunodeficiency virus HIV-1 human immunodeficiency virus type 1 HIV 1 human immunodeficiency virus type 1 HIV1 human immunodeficiency virus type 1, HIV-1 human immunodeficiency virus type I HIV-1 human immunodeficiency virus type-1 HIV-1 human immunodeficiency virus-1 HIV-1 AIDS virus Human immunodeficiency virus type 1 human immunodeficiency virus type 1 HIV-1 GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:116925 Troglotremata GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:116926 Philophthalmidae HIV HIV-2 HIV2 LAV-2 GC_ID:1 HIV type 2 Human immunodeficiency virus type 2 Human immunodeficiency virus-2 human immunodeficiency virus type 2 HIV-2 human immunodeficiency virus type 2, HIV-2 ncbi_taxonomy AIDS virus NCBITaxon:11709 Human immunodeficiency virus 2 HIV HIV-2 HIV2 LAV-2 HIV type 2 Human immunodeficiency virus type 2 Human immunodeficiency virus-2 human immunodeficiency virus type 2 HIV-2 human immunodeficiency virus type 2, HIV-2 AIDS virus NCBITaxon:11677 NCBITaxon:11739 NCBITaxon:11740 CIV SIV GC_ID:1 Chimpanzee immunodeficiency virus Chimpanzee immunodeficiency virus (SIV(CPZ)) Simian immunodeficiency virus SIVcpz simian immunodeficiency virus SIV simian immunodeficiency virus, SIV simian immunodeficiency viruses SIV ncbi_taxonomy NCBITaxon:11723 Simian immunodeficiency virus CIV SIV Chimpanzee immunodeficiency virus Chimpanzee immunodeficiency virus (SIV(CPZ)) Simian immunodeficiency virus SIVcpz simian immunodeficiency virus SIV simian immunodeficiency virus, SIV simian immunodeficiency viruses SIV NCBITaxon:1081645 NCBITaxon:2282360 NCBITaxon:27317 NCBITaxon:426520 NCBITaxon:426521 GC_ID:1 ncbi_taxonomy Dipodascus geotrichum Endomyces geotrichum Galactomyces candidus Galactomyces candidus de Hoog & M.T. Smith, 2004 Galactomyces geotrichum (E.E. Butler & L.J. Petersen) Redhead & Malloch, 1977 Oospora lactis NCBITaxon:1173061 Geotrichum candidum Dipodascus geotrichum Endomyces geotrichum Galactomyces candidus Galactomyces candidus de Hoog & M.T. Smith, 2004 Galactomyces geotrichum (E.E. Butler & L.J. Petersen) Redhead & Malloch, 1977 Oospora lactis GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:117570 Teleostomi NCBITaxon:40673 GC_ID:1 bony vertebrates ncbi_taxonomy NCBITaxon:117571 Euteleostomi bony vertebrates GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:118655 Oropouche virus GC_ID:11 ncbi_taxonomy NCBITaxon:118882 Brucellaceae GC_ID:11 ncbi_taxonomy Coxiella group NCBITaxon:118968 Coxiellaceae Coxiella group GC_ID:11 ncbi_taxonomy Legionellaceae group NCBITaxon:118969 Legionellales Legionellaceae group NCBITaxon:119063 GC_ID:11 PMID:16403855 ncbi_taxonomy Burkholderia group NCBITaxon:119060 Burkholderiaceae Burkholderia group GC_ID:11 ncbi_taxonomy Spirillum group NCBITaxon:119068 Spirillaceae Spirillum group NCBITaxon:28331 HTLV-1 HTLV-I GC_ID:1 Human T cell leukemia virus type 1 Human T-cell leukemia virus type 1 Human T-cell leukemia virus type I HTLV-I Human T-cell leukemia virus-1 Human T-cell lymphotropic virus 1 Human T-cell lymphotropic virus type I Human T-lymphotropic virus 1 Human T-lymphotropic virus type 1 Human adult T-cell leukemia virus Human lymphotropic virus type I human T cell leukemia virus type 1 HTLV-1 human T cell lymphotropic virus type I HTLV-I human T-cell leukemia virus I human T-cell leukemia virus type 1 HTLV-1 human T-cell leukemia/lymphoma virus type I HTLV-I human T-cell leukemia/lymphotropic virus type I HTLV-I human T-cell lymphoma/leukemia virus type I HTLV-I human T-cell lymphotropic virus type 1, HTLV-1 human T-lymphotropic virus type 1 HTLV-1 human T-lymphotropic virus type I HTLV-I ncbi_taxonomy Human T-cell lymphotropic virus type 1 NCBITaxon:11908 Human T-cell leukemia virus type I HTLV-1 HTLV-I Human T cell leukemia virus type 1 Human T-cell leukemia virus type 1 Human T-cell leukemia virus type I HTLV-I Human T-cell leukemia virus-1 Human T-cell lymphotropic virus 1 Human T-cell lymphotropic virus type I Human T-lymphotropic virus 1 Human T-lymphotropic virus type 1 Human adult T-cell leukemia virus Human lymphotropic virus type I human T cell leukemia virus type 1 HTLV-1 human T cell lymphotropic virus type I HTLV-I human T-cell leukemia virus I human T-cell leukemia virus type 1 HTLV-1 human T-cell leukemia/lymphoma virus type I HTLV-I human T-cell leukemia/lymphotropic virus type I HTLV-I human T-cell lymphoma/leukemia virus type I HTLV-I human T-cell lymphotropic virus type 1, HTLV-1 human T-lymphotropic virus type 1 HTLV-1 human T-lymphotropic virus type I HTLV-I Human T-cell lymphotropic virus type 1 GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:119088 Enoplea NCBITaxon:27837 GC_ID:1 ncbi_taxonomy Adenophorea NCBITaxon:119089 Chromadorea Adenophorea HTLV-2 HTLV-II GC_ID:1 Human T-Cell leukemia virus type 2 Human T-cell leukemia virus type II Human T-cell lymphotropic virus type 2 Human T-cell lymphotropic virus type II Human T-lymphotropic virus Type II Human lymphotropic virus type 2 Human lymphotropic virus type II human T cell leukemia virus II HTLV-II human T lymphotropic virus type II HTLV-II human T-cell leukemia virus II human T-cell lymphotropic virus type II HTLV-II ncbi_taxonomy NCBITaxon:11909 Human T-lymphotropic virus 2 HTLV-2 HTLV-II Human T-Cell leukemia virus type 2 Human T-cell leukemia virus type II Human T-cell lymphotropic virus type 2 Human T-cell lymphotropic virus type II Human T-lymphotropic virus Type II Human lymphotropic virus type 2 Human lymphotropic virus type II human T cell leukemia virus II HTLV-II human T lymphotropic virus type II HTLV-II human T-cell leukemia virus II human T-cell lymphotropic virus type II HTLV-II GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:119093 Trichuridae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:119095 Capillaria GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:119225 Protomacleaya GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:11974 Caliciviridae GC_ID:1 skunks ncbi_taxonomy NCBITaxon:119825 Mephitidae skunks GC_ID:1 ncbi_taxonomy Picornavirus NCBITaxon:12058 Picornaviridae Picornavirus NCBITaxon:12128 GC_ID:1 Enteroviruses ncbi_taxonomy NCBITaxon:12059 Enterovirus Enteroviruses GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:12066 Coxsackievirus GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:1206794 Ecdysozoa GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:1206795 Lophotrochozoa MAC GC_ID:11 PMID:1581195 PMID:30231956 PMID:8347508 PMID:9103630 ncbi_taxonomy NCBITaxon:120793 Mycobacterium avium complex (MAC) MAC HPV-1 PV1 GC_ID:1 Human poliovirus 1 Human poliovirus type 1 Polio virus 1 Poliovirus type 1 poliovirus type 1 PV1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:12080 Poliovirus 1 HPV-1 PV1 Human poliovirus 1 Human poliovirus type 1 Polio virus 1 Poliovirus type 1 poliovirus type 1 PV1 HPV-2 GC_ID:1 Human Poliovirus type 2 Human poliovirus 2 Poliovirus type 2 ncbi_taxonomy NCBITaxon:12083 Poliovirus 2 HPV-2 Human Poliovirus type 2 Human poliovirus 2 Poliovirus type 2 HPV-3 GC_ID:1 Human poliovirus 3 Human poliovirus type 3 Polio virus 3 ncbi_taxonomy Poliovirus serotype 3 Poliovirus type 3 NCBITaxon:12086 Poliovirus 3 HPV-3 Human poliovirus 3 Human poliovirus type 3 Polio virus 3 Poliovirus serotype 3 Poliovirus type 3 CV-A24 GC_ID:1 Coxsackievirus A-24 Human coxsackievirus A24 Human enterovirus CVA24 ncbi_taxonomy NCBITaxon:12089 Coxsackievirus A24 CV-A24 Coxsackievirus A-24 Human coxsackievirus A24 Human enterovirus CVA24 NCBITaxon:36405 GC_ID:1 Enterovirus 70 Enterovirus type 70 ncbi_taxonomy Human enterovirus 70 NCBITaxon:12090 enterovirus D70 Enterovirus 70 Enterovirus type 70 Human enterovirus 70 GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:12091 Hepatovirus HAV GC_ID:1 Hepatitis A virus ncbi_taxonomy NCBITaxon:12092 Hepatovirus A HAV Hepatitis A virus GC_ID:1 Cardioviruses ncbi_taxonomy NCBITaxon:12103 Cardiovirus Cardioviruses GC_ID:1 body lice primate body lice ncbi_taxonomy NCBITaxon:121221 Pediculidae body lice primate body lice GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:121222 Pediculus NCBITaxon:121223 GC_ID:1 PMID:18434207 PMID:23049889 human body lice human body louse ncbi_taxonomy Pediculus humanus humanus NCBITaxon:121224 Pediculus humanus corporis human body lice human body louse Pediculus humanus humanus GC_ID:1 PMID:18434207 PMID:23049889 body lice head lice human lice human louse ncbi_taxonomy NCBITaxon:121225 Pediculus humanus body lice head lice human lice human louse GC_ID:1 PMID:18434207 PMID:23049889 human head lice human head louse ncbi_taxonomy Pediculus capitis NCBITaxon:121226 Pediculus humanus capitis human head lice human head louse Pediculus capitis GC_ID:1 ncbi_taxonomy Phthirus Phtirus NCBITaxon:121227 Pthirus Phthirus Phtirus GC_ID:1 crab louse genital louse public louse ncbi_taxonomy Phthirus pubis Phtirus pubis NCBITaxon:121228 Pthirus pubis crab louse genital louse public louse Phthirus pubis Phtirus pubis GC_ID:1 pubic lice ncbi_taxonomy Phthiridae NCBITaxon:121229 Pthiridae pubic lice Phthiridae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:121739 Lacazia NCBITaxon:38947 GC_ID:1 Paracoccidioides loboi Paracoccidioides loboi (nom. inval.) ncbi_taxonomy NCBITaxon:121752 Lacazia loboi Paracoccidioides loboi Paracoccidioides loboi (nom. inval.) NCBITaxon:70254 NCBITaxon:71432 GC_ID:1 ncbi_taxonomy Loboa loboi Zymonema brasiliensis NCBITaxon:121759 Paracoccidioides brasiliensis Loboa loboi Zymonema brasiliensis GC_ID:1 Nipah virus Nipah-virus ncbi_taxonomy NCBITaxon:121791 Nipah henipavirus Nipah virus Nipah-virus GC_ID:11 PMID:11155980 PMID:9779605 ncbi_taxonomy NCBITaxon:122277 Pectobacterium GC_ID:1 ncbi_taxonomy Mansonella (Mansonella) ozzardi NCBITaxon:122354 Mansonella ozzardi Mansonella (Mansonella) ozzardi GC_ID:1 white shrimp ncbi_taxonomy Litopenaeus schmitti Penaeus (Litopenaeus) schmitti NCBITaxon:122378 Penaeus schmitti white shrimp Litopenaeus schmitti Penaeus (Litopenaeus) schmitti GC_ID:11 PMID:11321122 PMID:11837318 purple photosynthetic bacteria and relatives ncbi_taxonomy "Alphaproteobacteriota" Whitman et al. 2018 Alphaproteobacteriota Proteobacteria Proteobacteriota proteobacteria NCBITaxon:1224 Pseudomonadota purple photosynthetic bacteria and relatives "Alphaproteobacteriota" Whitman et al. 2018 Alphaproteobacteriota Proteobacteria Proteobacteriota proteobacteria GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:1224679 Diphyllobothriidea GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:123365 Neoteleostei GC_ID:1 ncbi_taxonomy Eurypterygii NCBITaxon:123366 Eurypterygia Eurypterygii GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:123367 Ctenosquamata GC_ID:1 ncbi_taxonomy Acanthomorpha NCBITaxon:123368 Acanthomorphata Acanthomorpha GC_ID:11 PMID:23334881 ncbi_taxonomy Proteobacteria gamma subdivision Purple bacteria, gamma subdivision g-proteobacteria gamma proteobacteria gamma subdivision gamma subgroup NCBITaxon:1236 Gammaproteobacteria Proteobacteria gamma subdivision Purple bacteria, gamma subdivision g-proteobacteria gamma proteobacteria gamma subdivision gamma subgroup GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:123736 Oestrus GC_ID:1 sheep bot fly ncbi_taxonomy NCBITaxon:123737 Oestrus ovis sheep bot fly NCBITaxon:31968 GC_ID:11 PMID:10555317 PMID:11034484 PMID:11542017 PMID:15143038 PMID:25403554 Firmicutes low G+C Gram-positive bacteria low GC Gram+ ncbi_taxonomy "Firmicutes" corrig. Gibbons and Murray 1978 (Approved Lists 1980) Bacillaeota Bacillota corrig. Gibbons and Murray 2021 Bacillus/Clostridium group Clostridium group firmicutes Firmicuteota Low G+C firmicutes clostridial firmicutes firmicutes NCBITaxon:1239 Bacillota Firmicutes low G+C Gram-positive bacteria low GC Gram+ "Firmicutes" corrig. Gibbons and Murray 1978 (Approved Lists 1980) Bacillaeota Bacillota corrig. Gibbons and Murray 2021 Bacillus/Clostridium group Clostridium group firmicutes Firmicuteota Low G+C firmicutes clostridial firmicutes firmicutes BDV GC_ID:1 PMID:25449305 Borna disease virus BDV ncbi_taxonomy NCBITaxon:12455 Borna disease virus BDV Borna disease virus BDV true NCBITaxon:12682 HDV GC_ID:1 Hepatitis D virus hepatitis delta virus HDV ncbi_taxonomy NCBITaxon:12475 Hepatitis delta virus HDV Hepatitis D virus hepatitis delta virus HDV GC_ID:1 Omsk haemorrhagic fever virus Omsk haemorrhagic fever virus OHF ncbi_taxonomy NCBITaxon:12542 Omsk hemorrhagic fever virus Omsk haemorrhagic fever virus Omsk haemorrhagic fever virus OHF GC_ID:11 PMID:11491354 ncbi_taxonomy NCBITaxon:1257 Peptostreptococcus GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:1262365 Tabanoidea GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:12637 Dengue virus NCBITaxon:451824 GC_ID:1 PMID:17051209 PMID:17572334 PMID:27738200 ncbi_taxonomy Entomophthoromycota Zygomycota NCBITaxon:1264859 Entomophthoromycotina Entomophthoromycota Zygomycota GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:1264872 Basidiobolales FECV GC_ID:1 Feline enteric coronavirus Feline enteric coronavirus FECV ncbi_taxonomy NCBITaxon:12663 Feline coronavirus FECV Feline enteric coronavirus Feline enteric coronavirus FECV HIV GC_ID:1 ncbi_taxonomy AIDS virus NCBITaxon:12721 Human immunodeficiency virus HIV AIDS virus NCBITaxon:11209 HPIV-1 HPIV1 GC_ID:1 Human parainfluenza 1 virus Human parainfluenza virus 1 Human parainfluenza virus type 1 Parainfluenza virus type 1 human parainfluenza virus type 1 HPIV-1 human parainfluenza virus type 1 hPIV1 ncbi_taxonomy human parainfluenza virus NCBITaxon:12730 Human respirovirus 1 HPIV-1 HPIV1 Human parainfluenza 1 virus Human parainfluenza virus 1 Human parainfluenza virus type 1 Parainfluenza virus type 1 human parainfluenza virus type 1 HPIV-1 human parainfluenza virus type 1 hPIV1 human parainfluenza virus GC_ID:11 PMID:10319469 PMID:10319495 PMID:10425778 PMID:10758876 PMID:12656157 PMID:17220435 PMID:9734063 ncbi_taxonomy Aurococcus NCBITaxon:1279 Staphylococcus Aurococcus GC_ID:1 PMID:10449446 PMID:12142489 PMID:8876236 ncbi_taxonomy DRIP clade Mesomycetozoa Mesomycetozoea NCBITaxon:127916 Ichthyosporea DRIP clade Mesomycetozoa Mesomycetozoea NCBITaxon:325213 NCBITaxon:46170 NCBITaxon:72759 GC_ID:11 PMID:31023808 PMID:8573498 ncbi_taxonomy Micrococcus aureus Micrococcus pyogenes Staphlococcus pyogenes citreus Staphylococcus aureus subsp. anaerobius Staphylococcus pyogenes aureus NCBITaxon:1280 Staphylococcus aureus Micrococcus aureus Micrococcus pyogenes Staphlococcus pyogenes citreus Staphylococcus aureus subsp. anaerobius Staphylococcus pyogenes aureus GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:1280412 Conoidasida GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:12845 Swine influenza virus NCBITaxon:12869 GC_ID:1 variola major virus VAR ncbi_taxonomy NCBITaxon:12870 Variola major virus variola major virus VAR GC_ID:11 PMID:14742484 PMID:27270136 ncbi_taxonomy Erysipelothrix group NCBITaxon:128827 Erysipelotrichaceae Erysipelothrix group GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:129369 Pulicoidea NCBITaxon:148571 GC_ID:1 Anemia, the fern with tired blood ncbi_taxonomy Mohria NCBITaxon:12939 Anemia Anemia, the fern with tired blood Mohria GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:12967 Blastocystis GC_ID:1 Pseudocowpoxvirus ncbi_taxonomy NCBITaxon:129726 Pseudocowpox virus Pseudocowpoxvirus GC_ID:11 ncbi_taxonomy NCBITaxon:1300 Streptococcaceae GC_ID:11 PMID:10555340 PMID:14657115 PMID:1720654 PMID:19620365 PMID:19880633 PMID:7537076 PMID:8995803 ncbi_taxonomy NCBITaxon:1301 Streptococcus GC_ID:1 charophyte/embryophyte group ncbi_taxonomy Charophyta/Embryophyta group NCBITaxon:131221 Streptophytina charophyte/embryophyte group Charophyta/Embryophyta group GC_ID:11 ncbi_taxonomy Diplococcus pneumoniae Micrococcus pneumoniae NCBITaxon:1313 Streptococcus pneumoniae Diplococcus pneumoniae Micrococcus pneumoniae GC_ID:11 ncbi_taxonomy Micrococcus scarlatinae Streptococcus erysipelatos Streptococcus hemolyticus Streptococcus scarlatinae NCBITaxon:1314 Streptococcus pyogenes Micrococcus scarlatinae Streptococcus erysipelatos Streptococcus hemolyticus Streptococcus scarlatinae GC_ID:1 ncbi_taxonomy biota NCBITaxon:131567 cellular organisms biota GC_ID:11 ncbi_taxonomy Streptococcus sp. (group B) Streptococcus sp. group B group B streptococcus NCBITaxon:1319 Streptococcus sp. 'group B' Streptococcus sp. (group B) Streptococcus sp. group B group B streptococcus GC_ID:1 PMID:9835021 Phlebotomus ncbi_taxonomy NCBITaxon:13203 Phlebotomus <genus> Phlebotomus GC_ID:1 PMID:22839753 PMID:25450099 ncbi_taxonomy Archosauria-Testudines Testudines + Archosauria group NCBITaxon:1329799 Archelosauria Archosauria-Testudines Testudines + Archosauria group GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:133423 Batillus MERS MERS-CoV GC_ID:1 MERS coronavirus MERS virus Middle East Respiratory Syndrome Coronavirus (MERS-CoV) Middle East respiratory syndrome coronavirus ncbi_taxonomy NCBITaxon:1335626 Middle East respiratory syndrome-related coronavirus MERS MERS-CoV MERS coronavirus MERS virus Middle East Respiratory Syndrome Coronavirus (MERS-CoV) Middle East respiratory syndrome coronavirus GC_ID:11 PMID:12734250 PMID:1283774 PMID:16558776 ncbi_taxonomy Acinetobacter mallei Actinobacillus mallei Bacillus mallei Loefferella mallei Malleomyces mallei Pfeifferella mallei Pseudomonas mallei NCBITaxon:13373 Burkholderia mallei Acinetobacter mallei Actinobacillus mallei Bacillus mallei Loefferella mallei Malleomyces mallei Pfeifferella mallei Pseudomonas mallei GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:1338369 Dipnotetrapodomorpha NCBITaxon:122377 NCBITaxon:133896 NCBITaxon:133898 NCBITaxon:133900 NCBITaxon:85653 GC_ID:1 ncbi_taxonomy Farfantepenaeus Fenneropenaeus Litopenaeus Marsupenaeus Melicertus NCBITaxon:133894 Penaeus Farfantepenaeus Fenneropenaeus Litopenaeus Marsupenaeus Melicertus GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:134362 Capnodiales GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:134742 Sigmodon alstoni GC_ID:11 PMID:8427810 PMID:9103648 ncbi_taxonomy NCBITaxon:1350 Enterococcus NCBITaxon:1219670 NCBITaxon:1796631 NCBITaxon:657310 GC_ID:11 ncbi_taxonomy Enterococcus proteiformis Enterocoque Micrococcus ovalis Micrococcus zymogenes Streptococcus faecalis Streptococcus glycerinaceus Streptococcus liquefaciens NCBITaxon:1351 Enterococcus faecalis Enterococcus proteiformis Enterocoque Micrococcus ovalis Micrococcus zymogenes Streptococcus faecalis Streptococcus glycerinaceus Streptococcus liquefaciens GC_ID:11 ncbi_taxonomy NCBITaxon:135621 Pseudomonadaceae GC_ID:11 ncbi_taxonomy 'Vibrionales' Vibrionaceae group NCBITaxon:135623 Vibrionales 'Vibrionales' Vibrionaceae group GC_ID:11 ncbi_taxonomy Aeromonadaceae/Succinivibrionaceae group NCBITaxon:135624 Aeromonadales Aeromonadaceae/Succinivibrionaceae group GC_ID:11 ncbi_taxonomy Pasteruellaceae group NCBITaxon:135625 Pasteurellales Pasteruellaceae group GC_ID:11 PMID:11075904 PMID:11542017 PMID:16558735 PMID:1917844 PMID:23908650 ncbi_taxonomy spirochetes NCBITaxon:136 Spirochaetales spirochetes GC_ID:11 ncbi_taxonomy NCBITaxon:136841 Pseudomonas aeruginosa group GC_ID:11 PMID:23908650 ncbi_taxonomy Treponemataceae NCBITaxon:137 Spirochaetaceae Treponemataceae NCBITaxon:29121 GC_ID:1 ncbi_taxonomy Oligoryzomys longicaudus NCBITaxon:137207 Oligoryzomys longicaudatus Oligoryzomys longicaudus GC_ID:11 PMID:24744012 PMID:27930271 PMID:28141502 PMID:30154058 PMID:30586413 PMID:31454394 PMID:31722850 PMID:31836459 PMID:32320380 PMID:35816828 PMID:36748499 PMID:8863409 PMID:8863416 ncbi_taxonomy Relapsing Fever Borrelia NCBITaxon:138 Borrelia Relapsing Fever Borrelia NCBITaxon:2954866 GC_ID:11 ncbi_taxonomy Bacillus/Staphylococcus group Caryophanales NCBITaxon:1385 Bacillales Bacillus/Staphylococcus group Caryophanales GC_ID:11 PMID:10843090 PMID:11491334 PMID:1742196 PMID:2223602 PMID:23475340 PMID:7727277 PMID:8138135 PMID:8863420 Bacillus Bacillus rRNA group 1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:1386 Bacillus <firmicutes> Bacillus Bacillus rRNA group 1 NCBITaxon:29269 GC_ID:1 Coxsackievirus A Enterovirus EV-A Human coxsackievirus A Human enterovirus A ncbi_taxonomy NCBITaxon:138948 Enterovirus A Coxsackievirus A Enterovirus EV-A Human coxsackievirus A Human enterovirus A GC_ID:1 Enterovirus EV-B Human enterovirus B ncbi_taxonomy NCBITaxon:138949 Enterovirus B Enterovirus EV-B Human enterovirus B NCBITaxon:138953 GC_ID:1 Enterovirus EV-C Human enterovirus C Poliovirus ncbi_taxonomy NCBITaxon:138950 Enterovirus C Enterovirus EV-C Human enterovirus C Poliovirus GC_ID:1 Enterovirus EV-D Human enterovirus D ncbi_taxonomy NCBITaxon:138951 Enterovirus D Enterovirus EV-D Human enterovirus D GC_ID:11 PMID:1380285 PMID:1503971 PMID:24744012 PMID:7699027 PMID:7981102 PMID:8995796 PMID:9336916 Lyme disease spirochete ncbi_taxonomy Borrelia burgdorferi NCBITaxon:139 Borreliella burgdorferi Lyme disease spirochete Borrelia burgdorferi NCBITaxon:1494525 NCBITaxon:1494531 NCBITaxon:1494577 GC_ID:11 PMID:8123566 anthrax anthrax bacterium ncbi_taxonomy Bacillus cereus var. anthracis Bacteridium anthracis NCBITaxon:1392 Bacillus anthracis anthrax anthrax bacterium Bacillus cereus var. anthracis Bacteridium anthracis GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:1399768 Basidiobolomycetes GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:1399770 Entomophthoromycetes GC_ID:11 ncbi_taxonomy NCBITaxon:1402491 Pseudomonas aeruginosa CF5 GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:140564 Ornithodoros parkeri GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:140693 Pulicomorpha GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:140713 Tunga GC_ID:1 Norwalk-like viruses ncbi_taxonomy NCBITaxon:142786 Norovirus Norwalk-like viruses GC_ID:1 PMID:11743200 PMID:11791233 ncbi_taxonomy Boreotheria NCBITaxon:1437010 Boreoeutheria Boreotheria GC_ID:1 PMID:25249442 ncbi_taxonomy NCBITaxon:1437183 Mesangiospermae GC_ID:1 PMID:26350789 ncbi_taxonomy NCBITaxon:1437197 Petrosaviidae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:1437201 Pentapetalae GC_ID:1 Cricket paralysis-like viruses ncbi_taxonomy NCBITaxon:144051 Cripavirus Cricket paralysis-like viruses GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:1457286 Dorylaimia GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:1463974 Cryptostroma GC_ID:1 ncbi_taxonomy Coniosporium corticale NCBITaxon:1463975 Cryptostroma corticale Coniosporium corticale GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:147368 Pooideae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:147387 Poeae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:147389 Triticeae GC_ID:1 true yeasts ncbi_taxonomy NCBITaxon:147537 Saccharomycotina true yeasts GC_ID:1 filamentous ascomycetes ncbi_taxonomy Euascomycota NCBITaxon:147538 Pezizomycotina filamentous ascomycetes Euascomycota GC_ID:1 ncbi_taxonomy Loculoascomycetes bitunicate ascomycetes NCBITaxon:147541 Dothideomycetes Loculoascomycetes bitunicate ascomycetes NCBITaxon:147540 GC_ID:1 ncbi_taxonomy Loculoascomycetes Plectomycetes bitunicate ascomycetes NCBITaxon:147545 Eurotiomycetes Loculoascomycetes Plectomycetes bitunicate ascomycetes GC_ID:1 ncbi_taxonomy Pyrenomycetes NCBITaxon:147550 Sordariomycetes Pyrenomycetes GC_ID:1 ncbi_taxonomy Archiascomycota NCBITaxon:147553 Pneumocystidomycetes Archiascomycota GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:147571 Piedraiaceae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:147572 Piedraia GC_ID:1 ncbi_taxonomy Piedraia hortae var. hortae NCBITaxon:147573 Piedraia hortae Piedraia hortae var. hortae NCBITaxon:69207 GC_ID:11 PMID:26643615 PMID:27488356 ncbi_taxonomy Anaerobacter NCBITaxon:1485 Clostridium Anaerobacter GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:1485168 Longamoebia GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:1489341 Osteoglossocephalai GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:1489388 Euteleosteomorpha GC_ID:1 ncbi_taxonomy Paracanthomorphacea NCBITaxon:1489838 Paracanthopterygii Paracanthomorphacea GC_ID:1 ncbi_taxonomy Zeiogadiformes NCBITaxon:1489841 Zeiogadaria Zeiogadiformes GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:1489843 Gadariae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:1489845 Gadoidei NCBITaxon:29368 GC_ID:11 PMID:10028279 PMID:15244052 ncbi_taxonomy Bacillus botulinus Bacillus putrificus Botulobacillus botulinus Clostridium putrificum Ermengemillus botulinus Pacinia putrifica NCBITaxon:1491 Clostridium botulinum Bacillus botulinus Bacillus putrificus Botulobacillus botulinus Clostridium putrificum Ermengemillus botulinus Pacinia putrifica GC_ID:1 ncbi_taxonomy Histoplasma duboisii NCBITaxon:149546 Histoplasma capsulatum var. duboisii Histoplasma duboisii NCBITaxon:1440055 NCBITaxon:1581190 GC_ID:11 PMID:23834245 PMID:27370902 PMID:27902176 ncbi_taxonomy Bacillus difficilis Clostridium difficile Peptoclostridium difficile NCBITaxon:1496 Clostridioides difficile Bacillus difficilis Clostridium difficile Peptoclostridium difficile NCBITaxon:1683536 GC_ID:11 PMID:1374625 PMID:184898 ncbi_taxonomy 'Clostridium plagarum' Bacillus perfringens Bacterium welchii Clostridium plagarum NCBITaxon:1502 Clostridium perfringens 'Clostridium plagarum' Bacillus perfringens Bacterium welchii Clostridium plagarum GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:1511862 Carnivore amdoparvovirus 1 GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:1511900 Primate erythroparvovirus 1 GC_ID:11 ncbi_taxonomy Bacillus tetani NCBITaxon:1513 Clostridium tetani Bacillus tetani GC_ID:1 PMID:20206957 Papillomavirus ncbi_taxonomy NCBITaxon:151340 Papillomaviridae Papillomavirus GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:151341 Polyomaviridae GC_ID:1 PMID:21652310 Polypodiidae ncbi_taxonomy NCBITaxon:1521262 Polypodiidae <ferns> Polypodiidae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:153136 Deltaretrovirus GC_ID:12 ncbi_taxonomy NCBITaxon:1535325 Candida/Lodderomyces clade true GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:1538075 Malasseziomycetes GC_ID:1 ncbi_taxonomy Galloanseri ducks, geese, chickens, fowl, quail, currasows and allies NCBITaxon:1549675 Galloanserae Galloanseri ducks, geese, chickens, fowl, quail, currasows and allies NCBITaxon:165804 NCBITaxon:165805 GC_ID:1 PMID:26955199 Tremellomycetidae ncbi_taxonomy Heterobasidiomycetes NCBITaxon:155616 Tremellomycetes Tremellomycetidae Heterobasidiomycetes GC_ID:11 PMID:23961314 PMID:9019153 PMID:9734025 ncbi_taxonomy "Spironema" Vuillemin 1905 Microspironema NCBITaxon:157 Treponema "Spironema" Vuillemin 1905 Microspironema GC_ID:1 ncbi_taxonomy Aureobasidiaceae Saccotheciei NCBITaxon:1570301 Saccotheciaceae Aureobasidiaceae Saccotheciei GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:157540 Zygodontomys GC_ID:1 ncbi_taxonomy Oryzomys brevicauda NCBITaxon:157541 Zygodontomys brevicauda Oryzomys brevicauda NCBITaxon:34383 GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:1593277 Onygenales incertae sedis GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:15956 Phleum GC_ID:1 timothy timothy grass ncbi_taxonomy NCBITaxon:15957 Phleum pratense timothy timothy grass GC_ID:11 ncbi_taxonomy Microspironema pallidum Spirillum pallidum Spirochaeta pallida Spironema pallidum NCBITaxon:160 Treponema pallidum Microspironema pallidum Spirillum pallidum Spirochaeta pallida Spironema pallidum GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:162474 Malasseziales GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:162997 Culex annulirostris GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:163158 Xenopsylla GC_ID:1 oriental rat flea ncbi_taxonomy NCBITaxon:163159 Xenopsylla cheopis oriental rat flea GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:163343 Trichostomatia GC_ID:11 PMID:10408878 PMID:15709360 PMID:1713054 PMID:1899799 PMID:8427807 PMID:8782674 PMID:9226919 PMID:9542083 ncbi_taxonomy Listerella NCBITaxon:1637 Listeria Listerella NCBITaxon:1634566 NCBITaxon:2293539 NCBITaxon:2293540 NCBITaxon:2293541 NCBITaxon:2293542 NCBITaxon:2293543 NCBITaxon:2293544 NCBITaxon:2293545 NCBITaxon:2293546 NCBITaxon:2293547 NCBITaxon:2364651 NCBITaxon:2364652 NCBITaxon:2364653 NCBITaxon:2364654 NCBITaxon:2364655 NCBITaxon:2364656 NCBITaxon:2364657 NCBITaxon:2364658 NCBITaxon:2364659 NCBITaxon:2364660 NCBITaxon:2482733 NCBITaxon:2482734 NCBITaxon:2482735 NCBITaxon:2482736 NCBITaxon:2482737 NCBITaxon:2482738 NCBITaxon:2482739 NCBITaxon:2482740 NCBITaxon:2482741 NCBITaxon:2482742 NCBITaxon:2482743 NCBITaxon:2482744 NCBITaxon:2482745 NCBITaxon:2482746 NCBITaxon:2482747 NCBITaxon:2482748 NCBITaxon:2482749 NCBITaxon:2484857 NCBITaxon:2484858 NCBITaxon:2485082 NCBITaxon:2485083 NCBITaxon:2485084 NCBITaxon:2485085 NCBITaxon:2485086 NCBITaxon:2485087 NCBITaxon:2485088 NCBITaxon:2485089 NCBITaxon:2485090 NCBITaxon:2485091 NCBITaxon:2485092 NCBITaxon:2485093 NCBITaxon:2485094 NCBITaxon:2485095 NCBITaxon:2485096 NCBITaxon:2486732 NCBITaxon:2486733 NCBITaxon:2486734 NCBITaxon:2486735 NCBITaxon:2486736 NCBITaxon:2486737 NCBITaxon:2486738 NCBITaxon:2486739 NCBITaxon:2486740 NCBITaxon:2486741 GC_ID:11 PMID:17773427 PMID:1906732 PMID:8782698 ncbi_taxonomy Bacterium monocytogenes Bacterium monocytogenes hominis Corynebacterium infantisepticum Corynebacterium parvulum Erysipelothrix monocytogenes Listerella hepatolytica NCBITaxon:1639 Listeria monocytogenes Bacterium monocytogenes Bacterium monocytogenes hominis Corynebacterium infantisepticum Corynebacterium parvulum Erysipelothrix monocytogenes Listerella hepatolytica GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:1639119 Plasmodiidae GC_ID:11 PMID:23908650 ncbi_taxonomy NCBITaxon:1643685 Borreliaceae GC_ID:11 PMID:23908650 ncbi_taxonomy Leptospiriales NCBITaxon:1643688 Leptospirales Leptospiriales GC_ID:11 PMID:7537073 ncbi_taxonomy NCBITaxon:1647 Erysipelothrix GC_ID:11 PMID:1503975 PMID:8427802 ncbi_taxonomy Bacillus insidiosus Bacillus rhusiopathiae suis Bacterium rhusiopathiae Erysipelothrix erysipeloides Erysipelothrix insidiosa Erysipelothrix murisepticus Erysipelothrix porci NCBITaxon:1648 Erysipelothrix rhusiopathiae Bacillus insidiosus Bacillus rhusiopathiae suis Bacterium rhusiopathiae Erysipelothrix erysipeloides Erysipelothrix insidiosa Erysipelothrix murisepticus Erysipelothrix porci GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:1648030 Triticinae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:1648037 Poodae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:1648038 Triticodae GC_ID:11 ncbi_taxonomy NCBITaxon:1649845 Yersinia pseudotuberculosis complex GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:1652081 Poeae Chloroplast Group 2 (Poeae type) GC_ID:11 PMID:19244447 PMID:27864136 PMID:30186281 Coryneform bacteria ncbi_taxonomy NCBITaxon:1653 Corynebacteriaceae Coryneform bacteria GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:1653394 Mammarenavirus GC_ID:11 PMID:30186281 ncbi_taxonomy Actinocladothrix Discomyces NCBITaxon:1654 Actinomyces Actinocladothrix Discomyces NCBITaxon:163162 GC_ID:1 ncbi_taxonomy Tungidae Tunginae NCBITaxon:1658400 Hectopsyllidae Tungidae Tunginae GC_ID:11 PMID:30186281 ncbi_taxonomy Actinobacterium israeli Brevistreptothrix israeli Cohnistreptothrix israeli Corynebacterium israeli Discomyces israeli Nocardia israeli Oospora israeli Proactinomyces israeli Streptothrix israeli NCBITaxon:1659 Actinomyces israelii Actinobacterium israeli Brevistreptothrix israeli Cohnistreptothrix israeli Corynebacterium israeli Discomyces israeli Nocardia israeli Oospora israeli Proactinomyces israeli Streptothrix israeli GC_ID:11 PMID:11594590 PMID:17158978 PMID:1742200 PMID:20061504 PMID:8573484 ncbi_taxonomy Bifidibacterium Tissieria NCBITaxon:1678 Bifidobacterium Bifidibacterium Tissieria GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:1678141 Orthohepevirus NCBITaxon:12461 NCBITaxon:2953663 GC_ID:1 ncbi_taxonomy Orthohepevirus A NCBITaxon:1678143 Paslahepevirus balayani Orthohepevirus A GC_ID:11 Treponema pallidum pertenue yaws treponeme ncbi_taxonomy Treponema pertenue NCBITaxon:168 Treponema pallidum subsp. pertenue Treponema pallidum pertenue yaws treponeme Treponema pertenue GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:169418 Mustelinae GC_ID:1 kelp flies seaweed flies ncbi_taxonomy NCBITaxon:169440 Coelopidae kelp flies seaweed flies GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:169449 Coelopinae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:169455 Coelopellini GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:169495 This GC_ID:11 PMID:16014471 ncbi_taxonomy NCBITaxon:170 Leptospiraceae NCBITaxon:29512 NCBITaxon:29514 NCBITaxon:29516 GC_ID:11 PMID:10425768 PMID:1581182 PMID:19868121 PMID:9103653 ncbi_taxonomy NCBITaxon:171 Leptospira GC_ID:11 PMID:28905708 ncbi_taxonomy NCBITaxon:171549 Bacteroidales NCBITaxon:144193 GC_ID:11 PMID:10425754 PMID:19661509 PMID:29760685 PMID:30186281 PMID:7547284 PMID:7547291 PMID:7547293 PMID:8186090 ncbi_taxonomy Turicella NCBITaxon:1716 Corynebacterium Turicella NCBITaxon:171636 NCBITaxon:721786 GC_ID:1 PMID:24631854 ncbi_taxonomy Maloideae Spiraeoideae NCBITaxon:171637 Amygdaloideae Maloideae Spiraeoideae GC_ID:11 PMID:7729671 ncbi_taxonomy Bacillus diphtheriae Bacterium diphtheriae Microsporon diphthericum Microsporon diphtheriticum Mycobacterium diphtheriae Pacinia loeffleri NCBITaxon:1717 Corynebacterium diphtheriae Bacillus diphtheriae Bacterium diphtheriae Microsporon diphthericum Microsporon diphtheriticum Mycobacterium diphtheriae Pacinia loeffleri AHFV GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:172148 Alkhumra hemorrhagic fever virus AHFV NCBITaxon:1891753 GC_ID:1 unassigned Polyomaviridae ncbi_taxonomy NCBITaxon:1723728 unclassified Polyomaviridae unassigned Polyomaviridae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:173087 Human papillomavirus types GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:1759442 Trichosporonaceae NCBITaxon:85003 GC_ID:11 PMID:10028260 PMID:11155976 PMID:11321122 PMID:19244447 PMID:28840812 PMID:30186281 high G+C Gram-positive bacteria ncbi_taxonomy Actinobacteria Stackebrandt et al. 1997 Actinomycetia high G+C Gram-positive bacteria NCBITaxon:1760 Actinomycetes high G+C Gram-positive bacteria Actinobacteria Stackebrandt et al. 1997 Actinomycetia high G+C Gram-positive bacteria GC_ID:11 PMID:19244447 PMID:29497402 PMID:30186281 ncbi_taxonomy NCBITaxon:1762 Mycobacteriaceae GC_ID:11 PMID:1380284 PMID:1581193 PMID:16014496 PMID:1883713 PMID:2275850 PMID:31296783 PMID:31649146 PMID:31649147 PMID:34554081 PMID:7547284 PMID:7547304 PMID:7907223 PMID:8863452 ncbi_taxonomy Mycobacterium Lehmann and Neumann 1896 (Approved Lists 1980) NCBITaxon:1763 Mycobacterium Mycobacterium Lehmann and Neumann 1896 (Approved Lists 1980) GC_ID:11 ncbi_taxonomy Bacillus leprae NCBITaxon:1769 Mycobacterium leprae Bacillus leprae NCBITaxon:2528440 GC_ID:11 PMID:29205127 ncbi_taxonomy Bacillus tuberculosis Bacterium tuberculosis Mycobacterium tuberculosis typus humanus Mycobacterium tuberculosis var. hominis Mycobacterium tuberculosis variant tuberculosis NCBITaxon:1773 Mycobacterium tuberculosis Bacillus tuberculosis Bacterium tuberculosis Mycobacterium tuberculosis typus humanus Mycobacterium tuberculosis var. hominis Mycobacterium tuberculosis variant tuberculosis GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:1776223 Gorgoderoidea GC_ID:11 PMID:12089250 PMID:20668542 ncbi_taxonomy Mycobacterium balnei Mycobacterium platypoecilus NCBITaxon:1781 Mycobacterium marinum Mycobacterium balnei Mycobacterium platypoecilus NCBITaxon:51290 GC_ID:11 PMID:16704931 PMID:23851394 PMID:24185849 ncbi_taxonomy NCBITaxon:1783257 PVC group NCBITaxon:131550 GC_ID:11 ncbi_taxonomy Fibrobacter/Acidobacteria group Fibrobacteres-Chlorobi-Bacteroidetes superphylum Fibrobacteres/Acidobacteria group NCBITaxon:1783270 FCB group Fibrobacter/Acidobacteria group Fibrobacteres-Chlorobi-Bacteroidetes superphylum Fibrobacteres/Acidobacteria group GC_ID:11 PMID:18988685 PMID:23851394 ncbi_taxonomy NCBITaxon:1783272 Terrabacteria group GC_ID:1 PMID:25449305 ncbi_taxonomy NCBITaxon:178830 Bornaviridae GC_ID:11 PMID:13641655 PMID:30186281 ncbi_taxonomy Mycobacterium xenopei Mycobacterium xenopi Schwabacher 1959 (Approved Lists) emend. Nouioui et al. 2018 NCBITaxon:1789 Mycobacterium xenopi Mycobacterium xenopei Mycobacterium xenopi Schwabacher 1959 (Approved Lists) emend. Nouioui et al. 2018 GC_ID:11 PMID:12089250 PMID:20668542 PMID:36651784 ncbi_taxonomy NCBITaxon:1809 Mycobacterium ulcerans GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:181088 Haemaphysalis flava GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:181550 Trichomonadidae GC_ID:11 PMID:7537058 PMID:7547284 ncbi_taxonomy Micropolyspora NCBITaxon:1817 Nocardia Micropolyspora GC_ID:11 ncbi_taxonomy Actinomyces asteroides Actinomyces eppinger Actinomyces eppingeri Asteroides asteroides Cladothrix asteroides Discomyces asteroides Oospora asteroides Proactinomyces asteroides Streptothrix eppingerii Streptotrix asteroides NCBITaxon:1824 Nocardia asteroides Actinomyces asteroides Actinomyces eppinger Actinomyces eppingeri Asteroides asteroides Cladothrix asteroides Discomyces asteroides Oospora asteroides Proactinomyces asteroides Streptothrix eppingerii Streptotrix asteroides GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:1851469 Trichosporonales GC_ID:1 Ebola-like viruses ncbi_taxonomy NCBITaxon:186536 Ebolavirus Ebola-like viruses GC_ID:1 Marburg-like viruses ncbi_taxonomy NCBITaxon:186537 Marburgvirus Marburg-like viruses ZEBOV GC_ID:1 Zaire Ebola virus ncbi_taxonomy NCBITaxon:186538 Zaire ebolavirus ZEBOV Zaire Ebola virus SEBOV SUDV GC_ID:1 Ebolavirus Sudan Sudan Ebola virus ncbi_taxonomy NCBITaxon:186540 Sudan ebolavirus SEBOV SUDV Ebolavirus Sudan Sudan Ebola virus GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:186623 Actinopteri GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:186625 Clupeocephala GC_ID:1 ncbi_taxonomy Otophysa NCBITaxon:186626 Otophysi Otophysa GC_ID:1 ncbi_taxonomy Cypriniphysi NCBITaxon:186627 Cypriniphysae Cypriniphysi GC_ID:1 ncbi_taxonomy Ostarioclupeomorpha Otocephala NCBITaxon:186634 Otomorpha Ostarioclupeomorpha Otocephala GC_ID:11 PMID:26410691 PMID:31076745 PMID:32955149 ncbi_taxonomy Natranaerobiia NCBITaxon:186801 Clostridia Natranaerobiia GC_ID:11 PMID:24480908 ncbi_taxonomy Clostridiales NCBITaxon:186802 Eubacteriales Clostridiales GC_ID:11 ncbi_taxonomy Clostridium cluster XI NCBITaxon:186804 Peptostreptococcaceae Clostridium cluster XI GC_ID:11 ncbi_taxonomy NCBITaxon:186817 Bacillaceae GC_ID:11 ncbi_taxonomy NCBITaxon:186820 Listeriaceae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:1868215 Orthopneumovirus GC_ID:11 ncbi_taxonomy NCBITaxon:186826 Lactobacillales GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:186938 Respirovirus GC_ID:11 PMID:27370902 PMID:27902176 ncbi_taxonomy NCBITaxon:1870884 Clostridioides GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:1884633 Cryptococcaceae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:1884637 Cryptococcus gattii species complex GC_ID:1 follicle mites ncbi_taxonomy NCBITaxon:188543 Demodicidae follicle mites GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:188544 Demodex GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:188547 Cheyletoidea GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:188550 Raphignathae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:1891714 Betapolyomavirus NCBITaxon:10575 NCBITaxon:10629 NCBITaxon:38015 BKV GC_ID:1 BK polyomavirus BK virus BK virus BKV Human polyomavirus (type BK) Human polyomavirus 1 Human polyomavirus BK Human polyomavirus BKV Papovavirus BKV human polyomavirus type BK BKV polyomavirus BK ncbi_taxonomy Polyomavirus hominis 1 NCBITaxon:1891762 Betapolyomavirus hominis BKV BK polyomavirus BK virus BK virus BKV Human polyomavirus (type BK) Human polyomavirus 1 Human polyomavirus BK Human polyomavirus BKV Papovavirus BKV human polyomavirus type BK BKV polyomavirus BK Polyomavirus hominis 1 NCBITaxon:67607 GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:189359 Xylariales incertae sedis GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:1897064 Cryptococcus neoformans species complex GC_ID:11 PMID:27620848 ncbi_taxonomy NCBITaxon:1903410 Pectobacteriaceae GC_ID:11 PMID:27620848 ncbi_taxonomy NCBITaxon:1903411 Yersiniaceae GC_ID:11 PMID:27620848 ncbi_taxonomy Morganellaceae Adeolu et al. 2016 NCBITaxon:1903414 Morganellaceae Morganellaceae Adeolu et al. 2016 GC_ID:1 PMID:15264635 Ochlerotatus ncbi_taxonomy NCBITaxon:190765 Ochlerotatus <genus> Ochlerotatus GC_ID:1 PMID:27738200 ncbi_taxonomy NCBITaxon:1913637 Mucoromycota GC_ID:1 PMID:27738200 ncbi_taxonomy NCBITaxon:1913638 Zoopagomycota GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:1930602 Psocodea GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:1933187 Rift Valley fever phlebovirus GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:1933264 California encephalitis orthobunyavirus GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:1933309 Oropouche orthobunyavirus GC_ID:11 PMID:11542086 PMID:12361288 PMID:16627635 PMID:1704793 PMID:19801389 PMID:29034857 ncbi_taxonomy NCBITaxon:194 Campylobacter GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:194440 Primate T-lymphotropic virus 1 GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:194441 Primate T-lymphotropic virus 2 GC_ID:11 PMID:16403855 ncbi_taxonomy NCBITaxon:194924 Desulfovibrionaceae GC_ID:11 PMID:11321120 PMID:1354478 ncbi_taxonomy Spirillum fetus Vibrio fetus NCBITaxon:196 Campylobacter fetus Spirillum fetus Vibrio fetus GC_ID:1 mice and others ncbi_taxonomy Sciurognathi NCBITaxon:1963758 Myomorpha mice and others Sciurognathi GC_ID:1 PMID:10874751 PMID:11557979 ncbi_taxonomy NCBITaxon:197562 Pancrustacea GC_ID:1 PMID:11557979 PMID:9727836 mandibulates ncbi_taxonomy NCBITaxon:197563 Mandibulata mandibulates GC_ID:1 Influenzavirus A ncbi_taxonomy NCBITaxon:197911 Alphainfluenzavirus Influenzavirus A GC_ID:1 Influenzavirus B ncbi_taxonomy NCBITaxon:197912 Betainfluenzavirus Influenzavirus B GC_ID:1 Influenzavirus C ncbi_taxonomy NCBITaxon:197913 Gammainfluenzavirus Influenzavirus C GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:1980410 Bunyavirales GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:1980413 Hantaviridae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:1980415 Nairoviridae NCBITaxon:11571 GC_ID:1 Bunyaviridae ncbi_taxonomy NCBITaxon:1980416 Peribunyaviridae Bunyaviridae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:1980418 Phenuiviridae NCBITaxon:11598 GC_ID:1 ncbi_taxonomy Hantavirus NCBITaxon:1980442 Orthohantavirus Hantavirus NCBITaxon:46607 GC_ID:1 Andes hantavirus Andes virus ncbi_taxonomy NCBITaxon:1980456 Andes orthohantavirus Andes hantavirus Andes virus NCBITaxon:37962 GC_ID:1 Bayou hantavirus Bayou virus ncbi_taxonomy NCBITaxon:1980459 Bayou orthohantavirus Bayou hantavirus Bayou virus NCBITaxon:12506 GC_ID:1 Dobrava virus Dobrava-Belgrade hantavirus Dobrava-Belgrade virus Dobravavirus ncbi_taxonomy NCBITaxon:1980467 Dobrava-Belgrade orthohantavirus Dobrava virus Dobrava-Belgrade hantavirus Dobrava-Belgrade virus Dobravavirus NCBITaxon:61172 GC_ID:1 Laguna Negra hantavirus Laguna Negra virus ncbi_taxonomy NCBITaxon:1980476 Laguna Negra orthohantavirus Laguna Negra hantavirus Laguna Negra virus NCBITaxon:11604 GC_ID:1 Puumala hantavirus Puumala virus Puumala virus PV Puumalavirus nephropathia epidemica virus ncbi_taxonomy NCBITaxon:1980486 Puumala orthohantavirus Puumala hantavirus Puumala virus Puumala virus PV Puumalavirus nephropathia epidemica virus NCBITaxon:11608 GC_ID:1 Seoul hantavirus Seoul virus epidemic hemorrhagic fever virus ncbi_taxonomy NCBITaxon:1980490 Seoul orthohantavirus Seoul hantavirus Seoul virus epidemic hemorrhagic fever virus NCBITaxon:37705 GC_ID:1 Sin Nombre hantavirus Sin Nombre virus ncbi_taxonomy NCBITaxon:1980491 Sin Nombre orthohantavirus Sin Nombre hantavirus Sin Nombre virus NCBITaxon:11592 GC_ID:1 Nairovirus Nairoviruses ncbi_taxonomy NCBITaxon:1980517 Orthonairovirus Nairovirus Nairoviruses NCBITaxon:11593 CCHFV GC_ID:1 Crimean-Congo haemorrhagic fever virus Crimean-Congo hemorrhagic fever nairovirus Crimean-Congo hemorrhagic virus ncbi_taxonomy Crimean-Congo hemorrhagic fever virus NCBITaxon:1980519 Crimean-Congo hemorrhagic fever orthonairovirus CCHFV Crimean-Congo haemorrhagic fever virus Crimean-Congo hemorrhagic fever nairovirus Crimean-Congo hemorrhagic virus Crimean-Congo hemorrhagic fever virus GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:198624 Dermocystida GC_ID:11 PMID:10425795 PMID:10425796 PMID:10425797 PMID:10490293 PMID:10843050 PMID:10939651 PMID:10939673 PMID:10939677 PMID:11211268 PMID:11321083 PMID:11321113 PMID:11411719 PMID:11540071 PMID:11542017 PMID:11542087 PMID:11760965 PMID:12054223 PMID:2112744 PMID:270744 PMID:7520741 PMID:8123559 PMID:8186100 PMID:8590690 PMID:9103655 PMID:9336922 eubacteria ncbi_taxonomy Monera Procaryotae Prokaryota Prokaryotae bacteria prokaryote prokaryotes NCBITaxon:2 Bacteria eubacteria Monera Procaryotae Prokaryota Prokaryotae bacteria prokaryote prokaryotes GC_ID:11 ncbi_taxonomy Bacteroidetes NCBITaxon:200643 Bacteroidia Bacteroidetes GC_ID:11 PMID:11837318 PMID:16280504 PMID:29458499 ncbi_taxonomy Actinobacteraeota Actinobacteria Actinobacteriota actinobacteria NCBITaxon:201174 Actinomycetota Actinobacteraeota Actinobacteria Actinobacteriota actinobacteria GC_ID:1 ncbi_taxonomy Rotalioidea NCBITaxon:203397 Rotaliacea Rotalioidea GC_ID:11 ncbi_taxonomy Fusobacteria NCBITaxon:203490 Fusobacteriia Fusobacteria GC_ID:11 ncbi_taxonomy NCBITaxon:203491 Fusobacteriales GC_ID:11 ncbi_taxonomy NCBITaxon:203492 Fusobacteriaceae GC_ID:11 PMID:11837318 PMID:29458499 ncbi_taxonomy Spirochaetae Spirochaetaeota Spirochaetes NCBITaxon:203691 Spirochaetota Spirochaetae Spirochaetaeota Spirochaetes GC_ID:11 PMID:11837318 PMID:25288668 PMID:26654112 ncbi_taxonomy "Leptospiria" Cavalier-Smith 2020 Spirochaetes NCBITaxon:203692 Spirochaetia "Leptospiria" Cavalier-Smith 2020 Spirochaetes NCBITaxon:85005 GC_ID:11 PMID:10028252 PMID:16558735 PMID:19244447 PMID:28840812 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2037 Actinomycetales GC_ID:11 PMID:11491348 PMID:1377787 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2038 Tropheryma NCBITaxon:1314886 GC_ID:1 ncbi_taxonomy Neobalantidium NCBITaxon:2038102 Balantioides Neobalantidium GC_ID:11 PMID:10555351 PMID:10843039 PMID:11491348 PMID:1377787 PMID:8863438 ncbi_taxonomy Tropheryma whippelii Whipple's bacillus Whipple's disease-associated bacterium NCBITaxon:2039 Tropheryma whipplei Tropheryma whippelii Whipple's bacillus Whipple's disease-associated bacterium GC_ID:11 PMID:24185849 ncbi_taxonomy Chlamydaeota Chlamydiae NCBITaxon:204428 Chlamydiota Chlamydaeota Chlamydiae GC_ID:11 PMID:26179278 ncbi_taxonomy NCBITaxon:204429 Chlamydiia GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2044726 Dioctophymatida GC_ID:11 PMID:16558803 PMID:19244447 PMID:30186281 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2049 Actinomycetaceae GC_ID:11 PMID:23575986 ncbi_taxonomy NCBITaxon:206351 Neisseriales GC_ID:1 ncbi_taxonomy Diplomonadida group NCBITaxon:207245 Fornicata Diplomonadida group GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2072716 Spiruromorpha GC_ID:1 ncbi_taxonomy Homo/Pan/Gorilla group NCBITaxon:207598 Homininae Homo/Pan/Gorilla group GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2082223 Panagrolaimomorpha GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2082224 Strongyloidoidea NCBITaxon:2091 GC_ID:4 PMID:16350067 ncbi_taxonomy Borrelomycetales Mollicutales Mycoplasmas Paramycetales Pleuropneumoniales The Mycoplasmas NCBITaxon:2085 Mycoplasmatales Borrelomycetales Mollicutales Mycoplasmas Paramycetales Pleuropneumoniales The Mycoplasmas NCBITaxon:28203 GC_ID:11 PMID:11156001 PMID:15143020 PMID:1704793 PMID:17329766 PMID:29034857 ncbi_taxonomy NCBITaxon:209 Helicobacter GC_ID:4 PMID:13403276 PMID:16350067 ncbi_taxonomy Borrelomycetaceae Parasitaceae Pleuropneumoniaceae NCBITaxon:2092 Mycoplasmataceae Borrelomycetaceae Parasitaceae Pleuropneumoniaceae NCBITaxon:29500 NCBITaxon:57371 GC_ID:4 PMID:10826816 PMID:11321109 PMID:11411711 PMID:11931184 PMID:13403276 PMID:15176735 PMID:16350067 PMID:16403858 PMID:25288662 PMID:8863441 PMID:8995799 ncbi_taxonomy Asterococcus Asteromyces Borrelomyces Bovimyces Eperythrozoon Haemobartonella Pleuropneumonia NCBITaxon:2093 Mycoplasma Asterococcus Asteromyces Borrelomyces Bovimyces Eperythrozoon Haemobartonella Pleuropneumonia NCBITaxon:219 GC_ID:11 PMID:11931154 PMID:1995031 PMID:8186097 PMID:8494747 ncbi_taxonomy Campylobacter pylori Campylobacter pylori subsp. pylori Campylobacter pyloridis Helicobacter nemestrinae NCBITaxon:210 Helicobacter pylori Campylobacter pylori Campylobacter pylori subsp. pylori Campylobacter pyloridis Helicobacter nemestrinae GC_ID:4 PMID:19871393 PMID:31385780 PMID:31971499 PMID:4867945 Filterable agent of primary atypical pneumonia ncbi_taxonomy Schizoplasma pneumoniae NCBITaxon:2104 Mycoplasmoides pneumoniae Filterable agent of primary atypical pneumonia Schizoplasma pneumoniae GC_ID:4 PMID:11034506 PMID:1906731 PMID:2223597 PMID:8782697 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2129 Ureaplasma GC_ID:11 PMID:16403855 ncbi_taxonomy NCBITaxon:213115 Desulfovibrionales GC_ID:11 PMID:16403855 ncbi_taxonomy NCBITaxon:213849 Campylobacterales GC_ID:1 chigger chigoe flea ncbi_taxonomy NCBITaxon:214035 Tunga penetrans chigger chigoe flea GC_ID:11 PMID:10425795 PMID:10425796 PMID:10425797 PMID:10490293 PMID:10843050 PMID:10939651 PMID:10939673 PMID:10939677 PMID:11211268 PMID:11321083 PMID:11321113 PMID:11411719 PMID:11540071 PMID:11541975 PMID:11542064 PMID:11542149 PMID:11760965 PMID:12054223 PMID:2112744 PMID:25527841 PMID:270744 PMID:8123559 PMID:8590690 PMID:9103655 PMID:9336922 ncbi_taxonomy Archaebacteria Mendosicutes Metabacteria Monera Procaryotae Prokaryota Prokaryotae archaea prokaryote prokaryotes NCBITaxon:2157 Archaea Archaebacteria Mendosicutes Metabacteria Monera Procaryotae Prokaryota Prokaryotae archaea prokaryote prokaryotes GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:216275 Vetigastropoda NCBITaxon:1756885 NCBITaxon:479458 GC_ID:1 Trochoidea ncbi_taxonomy Phasianelloidea Turbinoidea NCBITaxon:216285 Trochoidea <superfamily> Trochoidea Phasianelloidea Turbinoidea GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2169561 Ortervirales NCBITaxon:11027 ONN GC_ID:1 ncbi_taxonomy O'nyong-nyong virus NCBITaxon:2169701 Onyong-nyong virus ONN O'nyong-nyong virus NCBITaxon:11741 NCBITaxon:31677 GC_ID:1 Maedi visna virus Maedi visna virus MVV Maedi-Visna virus Maedi/Visna virus Visna lentivirus Visna virus Visna/maedi virus ncbi_taxonomy NCBITaxon:2169971 Visna-maedi virus Maedi visna virus Maedi visna virus MVV Maedi-Visna virus Maedi/Visna virus Visna lentivirus Visna virus Visna/maedi virus NCBITaxon:11619 GC_ID:1 Junin arenavirus Junin mammarenavirus Junin virus Junn mammarenavirus ncbi_taxonomy NCBITaxon:2169991 Argentinian mammarenavirus Junin arenavirus Junin mammarenavirus Junin virus Junn mammarenavirus NCBITaxon:45709 GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2169992 Brazilian mammarenavirus GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2172821 Multicrustacea GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2212703 Mucoromycetes GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2212966 Echinococcus granulosus group NCBITaxon:673183 GC_ID:1 PMID:17572334 ncbi_taxonomy NCBITaxon:222543 Hypocreomycetidae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:222544 Sordariomycetidae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:222545 Xylariomycetidae NCBITaxon:261182 GC_ID:1 ncbi_taxonomy Sarcoptidia NCBITaxon:223472 Psoroptidia Sarcoptidia NCBITaxon:131729 GC_ID:11 PMID:10970415 PMID:14662925 ncbi_taxonomy Rickettsia heilongjiangensis Rickettsia heilongjiangii NCBITaxon:226665 Rickettsia conorii subsp. heilongjiangensis Rickettsia heilongjiangensis Rickettsia heilongjiangii GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2267273 Dibothriocephalus true SARS Tor2 GC_ID:1 Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus Tor2 ncbi_taxonomy NCBITaxon:227984 SARS coronavirus Tor2 SARS Tor2 Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus Tor2 GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:229219 Blastomyces GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2315720 Trochida GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:232795 Dicistroviridae GC_ID:11 PMID:28066370 PMID:32373076 PMID:35335701 PMID:8573514 ncbi_taxonomy NCBITaxon:234 Brucella GC_ID:11 Brucella melitensis bv. Abortus ncbi_taxonomy "Bacillus of abortion" Bang 1897 Bacterium abortus Brucella melitensis biovar Abortus NCBITaxon:235 Brucella abortus Brucella melitensis bv. Abortus "Bacillus of abortion" Bang 1897 Bacterium abortus Brucella melitensis biovar Abortus GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:236781 Tineinae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:241475 Dioctophymatoidea NCBITaxon:1204415 NCBITaxon:3263 NCBITaxon:3290 GC_ID:1 PMID:21652310 ncbi_taxonomy Filicopsida Moniliformopses ferns NCBITaxon:241806 Polypodiopsida Filicopsida Moniliformopses ferns GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:242060 Cystoisospora GC_ID:1 Negative-strand RNA viruses ncbi_taxonomy NCBITaxon:2497569 Negarnaviricota Negative-strand RNA viruses GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2497570 Haploviricotina GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2497571 Polyploviricotina GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2497574 Monjiviricetes GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2497576 Ellioviricetes GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2497577 Insthoviricetes GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2499398 Arnidovirineae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2499399 Cornidovirineae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2499403 Tornidovirineae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2499411 Articulavirales GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2501931 Orthocoronavirinae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2508209 Tobaniviridae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2509487 Igacovirus GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2509494 Merbecovirus GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2509511 Sarbecovirus GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2509514 Tegacovirus GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2547934 Blastocystidae GC_ID:1 RNA viruses RNA viruses and viroids ncbi_taxonomy NCBITaxon:2559587 Riboviria RNA viruses RNA viruses and viroids GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2560066 Matonaviridae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2560069 Avulavirinae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2560074 Mammantavirinae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2560076 Orthoparamyxovirinae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2560080 Rubulavirinae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2560194 Orthoavulavirus GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2560195 Orthorubulavirus NCBITaxon:11176 NDV GC_ID:1 Avian Paramyxovirus Serotype I Avian paramyxovirus type 1 Avian paramyxovirus type-1 Newcastle disease virus Newcastle disease virus NDV avian paramyxovirus 1 ncbi_taxonomy Avian avulavirus 1 NCBITaxon:2560319 Avian orthoavulavirus 1 NDV Avian Paramyxovirus Serotype I Avian paramyxovirus type 1 Avian paramyxovirus type-1 Newcastle disease virus Newcastle disease virus NDV avian paramyxovirus 1 Avian avulavirus 1 NCBITaxon:11199 NCBITaxon:11212 NCBITaxon:1979160 HPIV-2 HPIV2 PIV-2 GC_ID:1 Human parainfluenza 2 virus Human parainfluenza virus 2 Human parainfluenza virus type 2 Parainfluenza virus type 2 ncbi_taxonomy Human rubulavirus 2 human parainfluenza virus NCBITaxon:2560525 Human orthorubulavirus 2 HPIV-2 HPIV2 PIV-2 Human parainfluenza 2 virus Human parainfluenza virus 2 Human parainfluenza virus type 2 Parainfluenza virus type 2 Human rubulavirus 2 human parainfluenza virus NCBITaxon:11203 NCBITaxon:1979161 HPIV4 GC_ID:1 HPIV type 4 Human parainfluenza virus 4 Human parainfluenza virus type 4 Parainfluenza virus type 4 ncbi_taxonomy Human rubulavirus 4 human parainfluenza virus NCBITaxon:2560526 Human orthorubulavirus 4 HPIV4 HPIV type 4 Human parainfluenza virus 4 Human parainfluenza virus type 4 Parainfluenza virus type 4 Human rubulavirus 4 human parainfluenza virus GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2560547 La Crosse orthobunyavirus NCBITaxon:11161 NCBITaxon:1979165 GC_ID:1 Mumps virus ncbi_taxonomy Mumps rubulavirus NCBITaxon:2560602 Mumps orthorubulavirus Mumps virus Mumps rubulavirus GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2572478 Oesophagostominae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2572558 Ancylostomatoidea NCBITaxon:1922347 GC_ID:1 unclassified RNA viruses ncbi_taxonomy NCBITaxon:2585030 unclassified Riboviria unclassified RNA viruses GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2601529 Tetramitia GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2601530 Eutetramitia GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2605435 Evosea GC_ID:11 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2608887 unclassified Streptococcus GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:260963 Avulavirus GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:260964 Henipavirus GC_ID:1 PMID:30257078 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2611341 Metamonada GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2611352 Discoba GC_ID:11 PMID:19783615 PMID:8123561 ncbi_taxonomy NCBITaxon:262 Francisella GC_ID:11 ncbi_taxonomy Bacterium tularense Brucella tularensis Francisella tularense Pasteurella tularensis NCBITaxon:263 Francisella tularensis Bacterium tularense Brucella tularensis Francisella tularense Pasteurella tularensis GC_ID:11 ncbi_taxonomy NCBITaxon:266068 Rickettsia sibirica subgroup GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2662056 Retaria GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2682482 Mastigamoebida GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2683628 Bigyra GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2683629 Opalozoa GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2692248 core chlorophytes SARS-CoV-2 GC_ID:1 2019-nCoV COVID-19 virus HCoV-19 Human coronavirus 2019 SARS-2 SARS-CoV2 SARS2 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2697049 Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 SARS-CoV-2 2019-nCoV COVID-19 virus HCoV-19 Human coronavirus 2019 SARS-2 SARS-CoV2 SARS2 GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2697495 Spiralia GC_ID:1 ncbi_taxonomy SAR supergroup NCBITaxon:2698737 Sar SAR supergroup GC_ID:11 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2701 Gardnerella GC_ID:11 PMID:14361525 PMID:8782675 ncbi_taxonomy Corynebacterium vaginale Haemophilus hemolyticus vaginalis Haemophilus vaginalis NCBITaxon:2702 Gardnerella vaginalis Corynebacterium vaginale Haemophilus hemolyticus vaginalis Haemophilus vaginalis GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2704647 Metakinetoplastina GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2704949 Trypanosomatida GC_ID:1 PMID:28082760 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2720871 Aspergillus subgen. Circumdati GC_ID:11 Chlamydia trachomatis str. D/UW-3/CX Chlamydia trachomatis strain D/UW-3/CX ncbi_taxonomy NCBITaxon:272561 Chlamydia trachomatis D/UW-3/CX Chlamydia trachomatis str. D/UW-3/CX Chlamydia trachomatis strain D/UW-3/CX GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2726946 Cladosporiales GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2731341 Duplodnaviria GC_ID:1 single-stranded DNA viruses ncbi_taxonomy NCBITaxon:2731342 Monodnaviria single-stranded DNA viruses GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2731360 Heunggongvirae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2731361 Peploviricota GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2731363 Herviviricetes GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2732004 Varidnaviria GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2732005 Bamfordvirae GC_ID:1 NCLDV nucleocytoplasmic large DNA viruses ncbi_taxonomy NCBITaxon:2732007 Nucleocytoviricota NCLDV nucleocytoplasmic large DNA viruses GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2732008 Preplasmiviricota GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2732092 Shotokuvirae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2732396 Orthornavirae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2732397 Pararnavirae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2732405 Duplornaviricota GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2732406 Kitrinoviricota GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2732408 Pisuviricota GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2732409 Artverviricota GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2732415 Cossaviricota GC_ID:1 eukaryotic Rep-encoding ssDNA viruses ncbi_taxonomy NCBITaxon:2732416 Cressdnaviricota eukaryotic Rep-encoding ssDNA viruses GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2732421 Papovaviricetes GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2732422 Quintoviricetes GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2732423 Arfiviricetes GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2732459 Resentoviricetes GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2732461 Alsuviricetes GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2732462 Flasuviricetes GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2732506 Pisoniviricetes GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2732507 Stelpaviricetes GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2732514 Revtraviricetes GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2732515 Blubervirales GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2732525 Pokkesviricetes GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2732527 Chitovirales GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2732529 Tectiliviricetes GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2732532 Sepolyvirales GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2732533 Zurhausenvirales GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2732534 Piccovirales GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2732536 Cirlivirales NCBITaxon:10880 GC_ID:1 ncbi_taxonomy Reoviridae NCBITaxon:2732541 Reovirales Reoviridae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2732543 Hepelivirales GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2732544 Martellivirales GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2732545 Amarillovirales GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2732551 Stellavirales GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2732559 Rowavirales GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2743694 Cyprininae GC_ID:1 deer flies ncbi_taxonomy NCBITaxon:27458 Chrysops deer flies GC_ID:1 assassin bugs ncbi_taxonomy NCBITaxon:27479 Reduviidae assassin bugs GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2748762 Colorado tick fever coltivirus GC_ID:11 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2750822 unclassified Mycobacterium avium complex (MAC) GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2752537 Talaromyces sect. Talaromyces GC_ID:1 PMID:23020233 PMID:30257078 eucaryotes eukaryotes ncbi_taxonomy Eucarya Eucaryotae Eukarya Eukaryotae eukaryotes NCBITaxon:2759 Eukaryota eucaryotes eukaryotes Eucarya Eucaryotae Eukarya Eukaryotae eukaryotes GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:27592 Bovinae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:27829 Strongyloidea GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:27841 Echinostomata GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:27871 Plagiorchiida GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:27872 Xiphidiata GC_ID:4 PMID:31385780 PMID:31971499 PMID:35947640 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2790996 Mycoplasmoidales GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:279271 Leptotrombidium GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:27973 Encephalitozoon hellem GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:27994 Theileriidae GC_ID:11 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2805591 Tropherymataceae GC_ID:11 PMID:11541974 PMID:11837318 PMID:16166687 PMID:16403855 PMID:19060069 ncbi_taxonomy Alphabacteria Proteobacteria alpha subdivision Purple bacteria, alpha subdivision a-proteobacteria alpha proteobacteria alpha subdivision alpha subgroup NCBITaxon:28211 Alphaproteobacteria Alphabacteria Proteobacteria alpha subdivision Purple bacteria, alpha subdivision a-proteobacteria alpha proteobacteria alpha subdivision alpha subgroup GC_ID:11 PMID:16403855 PMID:28581923 ncbi_taxonomy Proteobacteria beta subdivision Purple bacteria, beta subdivision b-proteobacteria beta proteobacteria beta subdivision beta subgroup NCBITaxon:28216 Betaproteobacteria Proteobacteria beta subdivision Purple bacteria, beta subdivision b-proteobacteria beta proteobacteria beta subdivision beta subgroup NCBITaxon:32015 GC_ID:11 PMID:11837318 PMID:16403855 PMID:27453056 PMID:28771119 PMID:33151140 ncbi_taxonomy "Deltabacteria" Cavalier-Smith 1992 Deltabacteria Cavalier-Smith 2002 Myxococcia Proteobacteria delta subdivision Purple bacteria, delta subdivision d-proteobacteria delta proteobacteria delta subdivision delta subgroup NCBITaxon:28221 Deltaproteobacteria "Deltabacteria" Cavalier-Smith 1992 Deltabacteria Cavalier-Smith 2002 Myxococcia Proteobacteria delta subdivision Purple bacteria, delta subdivision d-proteobacteria delta proteobacteria delta subdivision delta subgroup GC_ID:11 PMID:32373076 PMID:35335701 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2826938 Brucella/Ochrobactrum group AMDV GC_ID:1 Aleutian disease virus Aleutian mink disease parvovirus ncbi_taxonomy NCBITaxon:28314 Aleutian mink disease virus AMDV Aleutian disease virus Aleutian mink disease parvovirus NCBITaxon:12796 NCBITaxon:70172 PRRSV GC_ID:1 Porcine reproductive and respiratory syndrome virus (PRRSV) Porcine respiratory and reproductive syndrome virus porcine reproductive and respiratory syndrome virus PRRSV porcine reproductive and respiratory syndrome virus, PRRSV ncbi_taxonomy NCBITaxon:28344 Porcine reproductive and respiratory syndrome virus PRRSV Porcine reproductive and respiratory syndrome virus (PRRSV) Porcine respiratory and reproductive syndrome virus porcine reproductive and respiratory syndrome virus PRRSV porcine reproductive and respiratory syndrome virus, PRRSV GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2842242 Ribozyviria GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2842321 Kolmioviridae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2842407 Alpharhabdovirinae NCBITaxon:1435366 NCBITaxon:1435368 NCBITaxon:1435988 NCBITaxon:1439853 NCBITaxon:1487954 NCBITaxon:1487955 GC_ID:11 PMID:12734250 PMID:1283774 ncbi_taxonomy Bacillus pseudomallei Bacterium whitmori Loefflerella pseudomallei Malleomyces pseudomallei Pseudomonas pseudomallei NCBITaxon:28450 Burkholderia pseudomallei Bacillus pseudomallei Bacterium whitmori Loefflerella pseudomallei Malleomyces pseudomallei Pseudomonas pseudomallei GC_ID:11 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2845253 Treponemataceae RuV GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2846071 Rubivirus rubellae RuV NCBITaxon:117568 GC_ID:1 ncbi_taxonomy Pyrenophoraceae NCBITaxon:28556 Pleosporaceae Pyrenophoraceae NCBITaxon:34380 GC_ID:1 ncbi_taxonomy Eurotiaceae NCBITaxon:28568 Trichocomaceae Eurotiaceae NCBITaxon:212745 GC_ID:11 PMID:10758879 PMID:10939664 PMID:15950132 PMID:18048745 PMID:23918787 PMID:7727274 PMID:9103607 ncbi_taxonomy "Chlorobacterium" Guillebeau 1890, nom. rejic. Opin. 6 (not "Chlorobacterium" Lauterborn 1916) Liquidomonas Loefflerella RNA similarity group I NCBITaxon:286 Pseudomonas "Chlorobacterium" Guillebeau 1890, nom. rejic. Opin. 6 (not "Chlorobacterium" Lauterborn 1916) Liquidomonas Loefflerella RNA similarity group I NCBITaxon:1224290 NCBITaxon:1437768 NCBITaxon:1437769 NCBITaxon:1437770 NCBITaxon:1508364 NCBITaxon:1607811 NCBITaxon:1607813 NCBITaxon:1683559 NCBITaxon:1683561 NCBITaxon:1851858 NCBITaxon:1851865 NCBITaxon:1860124 NCBITaxon:665948 NCBITaxon:912077 NCBITaxon:931955 NCBITaxon:931956 NCBITaxon:931957 NCBITaxon:931958 NCBITaxon:932477 GC_ID:11 ncbi_taxonomy Bacillus aeruginosus Bacillus pyocyaneus Bacterium aeruginosum Bacterium pyocyaneum Micrococcus pyocyaneus Pseudomonas polycolor Pseudomonas pyocyanea probable synonym or variety: "Pseudomonas polycolor" Clara 1930 NCBITaxon:287 Pseudomonas aeruginosa Bacillus aeruginosus Bacillus pyocyaneus Bacterium aeruginosum Bacterium pyocyaneum Micrococcus pyocyaneus Pseudomonas polycolor Pseudomonas pyocyanea probable synonym or variety: "Pseudomonas polycolor" Clara 1930 NCBITaxon:1256674 NCBITaxon:94843 GC_ID:1 ncbi_taxonomy Ligulidae NCBITaxon:28843 Diphyllobothriidae Ligulidae GC_ID:1 broad tapeworm broad tapeworms fish tapeworms ncbi_taxonomy NCBITaxon:28844 Diphyllobothrium broad tapeworm broad tapeworms fish tapeworms GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:28845 Dibothriocephalus dendriticus GC_ID:11 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2887326 Moraxellales NCBITaxon:2303554 NCBITaxon:2303555 NCBITaxon:2303556 NCBITaxon:2303557 NCBITaxon:2303558 NCBITaxon:2303559 NCBITaxon:2303560 NCBITaxon:2303561 NCBITaxon:2303562 NCBITaxon:2303563 NCBITaxon:2303564 NCBITaxon:2303565 NCBITaxon:2303566 NCBITaxon:2303567 NCBITaxon:2303568 NCBITaxon:2303569 NCBITaxon:2303570 NCBITaxon:2303572 NCBITaxon:2303573 NCBITaxon:2303574 NCBITaxon:2303575 NCBITaxon:2305020 NCBITaxon:2305021 NCBITaxon:2305022 NCBITaxon:2305023 NCBITaxon:2305024 NCBITaxon:2305025 NCBITaxon:2305026 NCBITaxon:2305027 NCBITaxon:2305028 NCBITaxon:2305029 NCBITaxon:2305030 NCBITaxon:2305031 NCBITaxon:2305032 NCBITaxon:2305033 NCBITaxon:2305034 NCBITaxon:2305451 NCBITaxon:2305460 NCBITaxon:2305461 NCBITaxon:2306016 NCBITaxon:2306017 NCBITaxon:2306987 NCBITaxon:2306988 NCBITaxon:2306989 NCBITaxon:2306999 NCBITaxon:2307000 NCBITaxon:2307001 NCBITaxon:2315835 NCBITaxon:2320429 NCBITaxon:2320430 NCBITaxon:2339222 NCBITaxon:2339223 NCBITaxon:2339224 NCBITaxon:2339225 NCBITaxon:2339226 NCBITaxon:2340790 NCBITaxon:2340792 NCBITaxon:2364662 NCBITaxon:2364671 NCBITaxon:2364672 NCBITaxon:2364674 NCBITaxon:2364675 NCBITaxon:2364676 NCBITaxon:2364677 NCBITaxon:2364680 NCBITaxon:2364681 NCBITaxon:2364682 NCBITaxon:2364685 NCBITaxon:2364686 NCBITaxon:2364690 NCBITaxon:2364691 NCBITaxon:2364692 NCBITaxon:2364693 NCBITaxon:2364694 NCBITaxon:2364696 NCBITaxon:2364698 NCBITaxon:2364699 NCBITaxon:2364700 NCBITaxon:2364701 NCBITaxon:2364706 NCBITaxon:2364707 NCBITaxon:2364708 NCBITaxon:2364709 NCBITaxon:2364710 NCBITaxon:2364711 NCBITaxon:2364712 NCBITaxon:2364714 NCBITaxon:2364715 NCBITaxon:2364716 NCBITaxon:2364717 NCBITaxon:2364718 NCBITaxon:2364720 NCBITaxon:2364722 NCBITaxon:2364724 NCBITaxon:2364725 NCBITaxon:2364726 NCBITaxon:2364727 NCBITaxon:2364728 NCBITaxon:2364729 NCBITaxon:2364730 NCBITaxon:2364731 NCBITaxon:2364732 NCBITaxon:2364733 NCBITaxon:2364734 NCBITaxon:2364735 NCBITaxon:2364738 NCBITaxon:2364739 NCBITaxon:2364740 NCBITaxon:2364746 NCBITaxon:2364750 NCBITaxon:2364751 NCBITaxon:2364753 NCBITaxon:2364754 NCBITaxon:2364760 NCBITaxon:2364761 NCBITaxon:2364765 NCBITaxon:2364767 NCBITaxon:2364768 NCBITaxon:2419811 NCBITaxon:2419812 NCBITaxon:2419813 NCBITaxon:2419814 NCBITaxon:2419815 NCBITaxon:2419816 NCBITaxon:2419817 NCBITaxon:2419818 NCBITaxon:2419819 NCBITaxon:2419820 NCBITaxon:2419821 NCBITaxon:2419822 NCBITaxon:2419823 NCBITaxon:2419824 NCBITaxon:2447895 NCBITaxon:2478510 NCBITaxon:2478511 NCBITaxon:2478512 NCBITaxon:2478513 NCBITaxon:2478514 NCBITaxon:2478515 NCBITaxon:2478516 NCBITaxon:2478517 NCBITaxon:2478518 NCBITaxon:2478519 NCBITaxon:2478520 NCBITaxon:2478521 NCBITaxon:2478522 NCBITaxon:2478523 NCBITaxon:2478525 NCBITaxon:2478526 NCBITaxon:2478527 NCBITaxon:2478528 NCBITaxon:2479845 NCBITaxon:2483348 NCBITaxon:2483349 NCBITaxon:2483350 NCBITaxon:2485240 NCBITaxon:2485241 NCBITaxon:2485242 NCBITaxon:2485243 NCBITaxon:2485244 NCBITaxon:2485246 NCBITaxon:2485247 NCBITaxon:2485248 NCBITaxon:2485249 NCBITaxon:2485251 NCBITaxon:2485252 NCBITaxon:2485253 NCBITaxon:2485256 NCBITaxon:2485986 NCBITaxon:2485987 NCBITaxon:2485988 NCBITaxon:2485989 NCBITaxon:2485990 NCBITaxon:2485991 NCBITaxon:2485992 NCBITaxon:2485993 NCBITaxon:2485994 NCBITaxon:2485995 NCBITaxon:2485996 NCBITaxon:2486723 NCBITaxon:2486724 NCBITaxon:2486725 NCBITaxon:2486726 NCBITaxon:2486727 NCBITaxon:2486728 NCBITaxon:2486729 NCBITaxon:2486730 NCBITaxon:2486731 NCBITaxon:2486973 NCBITaxon:2516332 NCBITaxon:2516333 NCBITaxon:2516334 NCBITaxon:2516335 NCBITaxon:2516336 NCBITaxon:2516337 NCBITaxon:2516338 NCBITaxon:2516339 NCBITaxon:2516340 NCBITaxon:2516341 NCBITaxon:2516342 NCBITaxon:2516343 NCBITaxon:2516344 NCBITaxon:2516345 NCBITaxon:2516346 NCBITaxon:2516347 NCBITaxon:2516348 NCBITaxon:2516349 NCBITaxon:2516350 NCBITaxon:591 GC_ID:11 PMID:10319519 PMID:10939679 PMID:15653929 PMID:15653930 ncbi_taxonomy Bacillus cholerae-suis Salmonella cholerae-suis Salmonella choleraesuis Salmonella enterica ser. choleraesuis NCBITaxon:28901 Salmonella enterica Bacillus cholerae-suis Salmonella cholerae-suis Salmonella choleraesuis Salmonella enterica ser. choleraesuis GC_ID:11 PMID:34186167 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2890311 Klebsiella/Raoultella group GC_ID:4 PMID:31385780 PMID:31971499 PMID:35947640 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2895623 Metamycoplasmataceae SARS-CoV GC_ID:1 SARS coronavirus SARS virus ncbi_taxonomy NCBITaxon:2901879 Severe acute respiratory syndrome coronavirus SARS-CoV SARS coronavirus SARS virus GC_ID:1 ncbi_taxonomy Phlebotomus (Phlebotomus) papatasi Phlebotomus papatasii NCBITaxon:29031 Phlebotomus papatasi Phlebotomus (Phlebotomus) papatasi Phlebotomus papatasii GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:29105 Calomys GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:29120 Oligoryzomys GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:29122 Oryzomys GC_ID:1 Hepatitis E virus Hepatitis E virus HEV ncbi_taxonomy NCBITaxon:291484 Hepeviridae Hepatitis E virus Hepatitis E virus HEV GC_ID:12 PMID:29760453 PMID:33607033 CTG clade ncbi_taxonomy NCBITaxon:2916678 CUG-Ser1 clade CTG clade GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:29169 Ancylostoma GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:29171 Dictyocaulus GC_ID:1 foraminifers ncbi_taxonomy Foraminiferida forams NCBITaxon:29178 Foraminifera foraminifers Foraminiferida forams GC_ID:1 ncbi_taxonomy Rotaliina NCBITaxon:29185 Rotaliida Rotaliina GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:29189 Ammonia GC_ID:1 Tick-borne encephalitis viruses ncbi_taxonomy NCBITaxon:29263 tick-borne encephalitis virus group Tick-borne encephalitis viruses GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2945031 Ornithodorinae GC_ID:11 Brucella melitensis bv. Suis ncbi_taxonomy Brucella melitensis biovar Suis NCBITaxon:29461 Brucella suis Brucella melitensis bv. Suis Brucella melitensis biovar Suis NCBITaxon:689832 GC_ID:1 ncbi_taxonomy Sedoreovirinae NCBITaxon:2946186 Sedoreoviridae Sedoreovirinae NCBITaxon:689831 GC_ID:1 ncbi_taxonomy Spinareovirinae NCBITaxon:2946187 Spinareoviridae Spinareovirinae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2946627 Caphthovirinae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2946630 Ensavirinae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2946633 Heptrevirinae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2946639 Orthohepevirinae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2948570 Poodinae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2948857 Paslahepevirus GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2948964 Phleinae GC_ID:11 PMID:11837318 PMID:16403855 PMID:28484436 PMID:29720974 ncbi_taxonomy Campylobacterota Epsilonbacteraeota Proteobacteria epsilon subdivision Purple bacteria, epsilon subdivision e-proteobacteria epsilon proteobacteria epsilon subdivision epsilon subgroup NCBITaxon:29547 Epsilonproteobacteria Campylobacterota Epsilonbacteraeota Proteobacteria epsilon subdivision Purple bacteria, epsilon subdivision e-proteobacteria epsilon proteobacteria epsilon subdivision epsilon subgroup GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:297308 Ixodoidea GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:29907 Sporothrix GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:299071 Ajellomycetaceae GC_ID:1 ncbi_taxonomy Rhinocladium schenckii Sporotrichum schenckii NCBITaxon:29908 Sporothrix schenckii Rhinocladium schenckii Sporotrichum schenckii GC_ID:1 California black legged tick western blacklegged tick ncbi_taxonomy NCBITaxon:29930 Ixodes pacificus California black legged tick western blacklegged tick GC_ID:11 PMID:20668542 Mycobacterium ulcerans complex ncbi_taxonomy NCBITaxon:2993898 Mycobacterium ulcerans group Mycobacterium ulcerans complex GC_ID:1 scrub typhus mite ncbi_taxonomy NCBITaxon:299467 Leptotrombidium deliense scrub typhus mite GC_ID:4 PMID:31385780 PMID:31971499 PMID:35947640 ncbi_taxonomy NCBITaxon:2995234 Mycoplasmoides GC_ID:1 ncbi_taxonomy Fenneropenaeus indicus Penaeus (Fenneropenaeus) indicus NCBITaxon:29960 Penaeus indicus Fenneropenaeus indicus Penaeus (Fenneropenaeus) indicus GC_ID:1 sucking lice ncbi_taxonomy NCBITaxon:30005 Anoplura sucking lice GC_ID:11 PMID:15766388 ncbi_taxonomy NCBITaxon:302011 Rickettsia conorii subsp. caspia GC_ID:1 PMID:23020233 green algae ncbi_taxonomy Chlorophycota Chlorophyta sensu Bremer 1985 algae green algae NCBITaxon:3041 Chlorophyta green algae Chlorophycota Chlorophyta sensu Bremer 1985 algae green algae GC_ID:1 ncbi_taxonomy Cyprinoidea NCBITaxon:30727 Cyprinoidei Cyprinoidea GC_ID:1 Amdovirus ncbi_taxonomy NCBITaxon:310911 Amdoparvovirus Amdovirus GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:3110 Prototheca GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:31244 Schistosomatoidea GC_ID:1 blood flukes ncbi_taxonomy NCBITaxon:31245 Schistosomatidae blood flukes GC_ID:1 ncbi_taxonomy Trypanosoma (Trypanozoon) brucei gambiense Trypanosoma brucei subsp. gambiense Trypanosoma gambiense NCBITaxon:31285 Trypanosoma brucei gambiense Trypanosoma (Trypanozoon) brucei gambiense Trypanosoma brucei subsp. gambiense Trypanosoma gambiense GC_ID:1 ncbi_taxonomy Trypanosoma (Trypanozoon) brucei rhodesiense Trypanosoma brucei subsp. rhodesiense NCBITaxon:31286 Trypanosoma brucei rhodesiense Trypanosoma (Trypanozoon) brucei rhodesiense Trypanosoma brucei subsp. rhodesiense GC_ID:1 PMID:11214318 PMID:11214319 PMID:12878460 ncbi_taxonomy NCBITaxon:314145 Laurasiatheria GC_ID:1 PMID:11214319 PMID:12082125 PMID:12878460 PMID:15522813 ncbi_taxonomy NCBITaxon:314146 Euarchontoglires GC_ID:1 PMID:11214319 PMID:12082125 PMID:15522813 Rodents and rabbits ncbi_taxonomy NCBITaxon:314147 Glires Rodents and rabbits GC_ID:1 ncbi_taxonomy Anthropoidea NCBITaxon:314293 Simiiformes Anthropoidea GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:314294 Cercopithecoidea GC_ID:1 ape apes ncbi_taxonomy NCBITaxon:314295 Hominoidea ape apes GC_ID:1 Pseudorinderpest virus ncbi_taxonomy NCBITaxon:31604 Small ruminant morbillivirus Pseudorinderpest virus CV-A16 CVA-16 CVA16 GC_ID:1 Coxsackie A virus type 16 Coxsackie virus A-16 Human coxsackievirus A16 Human enterovirus CVA16 ncbi_taxonomy NCBITaxon:31704 Coxsackievirus A16 CV-A16 CVA-16 CVA16 Coxsackie A virus type 16 Coxsackie virus A-16 Human coxsackievirus A16 Human enterovirus CVA16 GC_ID:11 PMID:15766388 ncbi_taxonomy NCBITaxon:317865 Rickettsia conorii subsp. indica GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:318477 Dracunculidae GC_ID:1 Dracunculus ncbi_taxonomy NCBITaxon:318478 Dracunculus <nematodes> Dracunculus GC_ID:1 Guinea worm Guinea worm disease nematode dracunculiasis worm ncbi_taxonomy NCBITaxon:318479 Dracunculus medinensis Guinea worm Guinea worm disease nematode dracunculiasis worm GC_ID:1 higher plants land plants plants ncbi_taxonomy land plants NCBITaxon:3193 Embryophyta higher plants land plants plants land plants GC_ID:11 PMID:19244447 ncbi_taxonomy NCBITaxon:31953 Bifidobacteriaceae GC_ID:11 PMID:15766388 ncbi_taxonomy NCBITaxon:319546 Rickettsia conorii subsp. conorii GC_ID:11 PMID:11321122 PMID:15143038 PMID:17978244 PMID:23606477 PMID:2592342 PMID:31385780 PMID:31971499 PMID:35947640 PMID:8123554 PMID:8863413 PMID:8863414 ncbi_taxonomy Mycoplasmas and walled relatives Paramycetes mycoplasmas NCBITaxon:31969 Mollicutes Mycoplasmas and walled relatives Paramycetes mycoplasmas GC_ID:11 ncbi_taxonomy NCBITaxon:31979 Clostridiaceae NCBITaxon:1559979 NCBITaxon:206350 NCBITaxon:713636 GC_ID:11 PMID:10028253 PMID:11760943 PMID:16403855 PMID:25017294 PMID:25701846 PMID:28581923 ncbi_taxonomy Ammonia oxidizing bacteria Ammonia-oxidizing bacteria NCBITaxon:32003 Nitrosomonadales Ammonia oxidizing bacteria Ammonia-oxidizing bacteria GC_ID:11 PMID:10555347 PMID:1283774 PMID:25566316 ncbi_taxonomy Pseudomonas RNA homology group II NCBITaxon:32008 Burkholderia Pseudomonas RNA homology group II GC_ID:11 PMID:24969840 PMID:29458499 ncbi_taxonomy Fusobacteraeota Fusobacteria fusobacteria NCBITaxon:32066 Fusobacteriota Fusobacteraeota Fusobacteria fusobacteria GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:32341 Sophophora GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:32346 melanogaster group GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:32351 melanogaster subgroup GC_ID:1 teleost fishes ncbi_taxonomy NCBITaxon:32443 Teleostei teleost fishes GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:32519 Ostariophysi GC_ID:1 tetrapods ncbi_taxonomy NCBITaxon:32523 Tetrapoda tetrapods GC_ID:1 amniotes ncbi_taxonomy NCBITaxon:32524 Amniota amniotes GC_ID:1 Theria ncbi_taxonomy NCBITaxon:32525 Theria <mammals> Theria GC_ID:1 diapsids ncbi_taxonomy Diapsida NCBITaxon:32561 Sauria diapsids Diapsida GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:325675 unclassified Arteriviridae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:32594 Babesiidae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:327045 Orthoretrovirinae GC_ID:1 ncbi_taxonomy Entamoebida NCBITaxon:33084 Entamoebidae Entamoebida GC_ID:1 PMID:16248873 PMID:30257078 Chlorophyta/Embryophyta group chlorophyte/embryophyte group green plants ncbi_taxonomy Chlorobionta Chloroplastida green plants NCBITaxon:33090 Viridiplantae Chlorophyta/Embryophyta group chlorophyte/embryophyte group green plants Chlorobionta Chloroplastida green plants GC_ID:1 ncbi_taxonomy Fungi/Metazoa group opisthokonts NCBITaxon:33154 Opisthokonta Fungi/Metazoa group opisthokonts NCBITaxon:259362 NCBITaxon:36053 NCBITaxon:5102 GC_ID:1 PMID:17486980 ncbi_taxonomy Arachnomycetales Ascosphaerales Gymnoascales NCBITaxon:33183 Onygenales Arachnomycetales Ascosphaerales Gymnoascales NCBITaxon:108979 GC_ID:1 ncbi_taxonomy Amauroascaceae NCBITaxon:33184 Onygenaceae Amauroascaceae GC_ID:1 metazoans multicellular animals ncbi_taxonomy Animalia animals NCBITaxon:33208 Metazoa metazoans multicellular animals Animalia animals GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:33213 Bilateria GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:33256 Ascaridoidea GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:33259 Toxocaridae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:33264 Dictyocaulidae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:33265 Dictyocaulinae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:33278 Ancylostomatidae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:33317 Protostomia GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:33340 Neoptera GC_ID:1 ncbi_taxonomy Hemipteroidea hemipteroid assemblage NCBITaxon:33342 Paraneoptera Hemipteroidea hemipteroid assemblage GC_ID:1 bugs ncbi_taxonomy Heteropterodea NCBITaxon:33343 Prosorrhyncha bugs Heteropterodea GC_ID:1 true bugs ncbi_taxonomy NCBITaxon:33345 Heteroptera true bugs GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:33347 Euheteroptera GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:33349 Neoheteroptera GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:33351 Panheteroptera GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:33354 Cimicomorpha GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:33356 Reduvioidea GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:333774 unclassified Papillomaviridae GC_ID:1 ncbi_taxonomy Holometabola NCBITaxon:33392 Endopterygota Holometabola GC_ID:1 deuterostomes ncbi_taxonomy NCBITaxon:33511 Deuterostomia deuterostomes GC_ID:1 carnivores ncbi_taxonomy carnivores NCBITaxon:33554 Carnivora carnivores carnivores GC_ID:1 alveolates ncbi_taxonomy NCBITaxon:33630 Alveolata alveolates GC_ID:1 heterokonts ncbi_taxonomy Chromophyta Heterokonta Straminipila NCBITaxon:33634 Stramenopiles heterokonts Chromophyta Heterokonta Straminipila GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:33677 Acanthamoebidae GC_ID:1 ncbi_taxonomy Euglenozoans NCBITaxon:33682 Euglenozoa Euglenozoans GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:33743 Kyasanur Forest disease virus GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:33758 Echovirus GC_ID:1 PMID:15371245 ncbi_taxonomy NCBITaxon:337677 Cricetidae GC_ID:1 PMID:15019624 PMID:15371245 ncbi_taxonomy NCBITaxon:337687 Muroidea GC_ID:1 PMID:15371245 ncbi_taxonomy NCBITaxon:337963 Neotominae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:338152 Felinae GC_ID:1 ncbi_taxonomy Vestibulifera NCBITaxon:33833 Vestibuliferida Vestibulifera GC_ID:1 PMID:25249442 angiosperms flowering plants ncbi_taxonomy Angiospermae Magnoliophyta flowering plants NCBITaxon:3398 Magnoliopsida angiosperms flowering plants Angiospermae Magnoliophyta flowering plants GC_ID:11 PMID:11760958 PMID:8240958 ncbi_taxonomy NCBITaxon:33988 Rickettsieae NCBITaxon:106180 GC_ID:11 PMID:11760958 PMID:7537065 ncbi_taxonomy NCBITaxon:33993 Neorickettsia GC_ID:11 PMID:22939414 PMID:26747442 ncbi_taxonomy Francisella group NCBITaxon:34064 Francisellaceae Francisella group GC_ID:11 PMID:24912824 PMID:25858245 PMID:26438009 ncbi_taxonomy Haverhillia NCBITaxon:34104 Streptobacillus Haverhillia GC_ID:11 PMID:24912824 PMID:25858245 ncbi_taxonomy "Actinobacillus muris" (de Mello and Pais 1918) Wilson and Miles 1955 Actinomyces muris Actinomyces muris ratti Asterococcus muris Haverhillia moniliformis Haverhillia multiformis Nocardia muris Proactinomyces muris Streptothrix muris ratti NCBITaxon:34105 Streptobacillus moniliformis "Actinobacillus muris" (de Mello and Pais 1918) Wilson and Miles 1955 Actinomyces muris Actinomyces muris ratti Asterococcus muris Haverhillia moniliformis Haverhillia multiformis Nocardia muris Proactinomyces muris Streptothrix muris ratti NCBITaxon:118261 GC_ID:1 ncbi_taxonomy anamorphic Dipodascaceae NCBITaxon:34353 Dipodascaceae anamorphic Dipodascaceae NCBITaxon:34385 GC_ID:1 dermatophytes ncbi_taxonomy Arthrodermataceae anamorphs anamorphic Arthrodermataceae NCBITaxon:34384 Arthrodermataceae dermatophytes Arthrodermataceae anamorphs anamorphic Arthrodermataceae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:34390 Epidermophyton GC_ID:1 black yeasts ncbi_taxonomy NCBITaxon:34395 Chaetothyriales black yeasts GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:34486 Ancylistaceae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:34487 Conidiobolus NCBITaxon:99728 GC_ID:1 ncbi_taxonomy Paragonimidae NCBITaxon:34502 Troglotrematidae Paragonimidae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:34503 Paragonimus GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:34504 Paragonimus westermani NCBITaxon:59639 GC_ID:1 Cayenne tick ncbi_taxonomy Acarus cajennensis NCBITaxon:34607 Amblyomma cajennense Cayenne tick Acarus cajennensis GC_ID:1 Gulf Coast tick ncbi_taxonomy NCBITaxon:34609 Amblyomma maculatum Gulf Coast tick GC_ID:1 castor bean tick ncbi_taxonomy NCBITaxon:34613 Ixodes ricinus castor bean tick NCBITaxon:139398 GC_ID:1 ncbi_taxonomy Anocentor NCBITaxon:34619 Dermacentor Anocentor GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:34620 Dermacentor andersoni GC_ID:1 American dog tick ncbi_taxonomy NCBITaxon:34621 Dermacentor variabilis American dog tick GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:34622 Haemaphysalis GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:34625 Hyalomma GC_ID:1 PMID:14707501 Rhipicephalus ncbi_taxonomy NCBITaxon:34630 Rhipicephalus <genus> Rhipicephalus NCBITaxon:2138176 NCBITaxon:59657 GC_ID:1 brown dog tick ncbi_taxonomy Ixodes sanguineus Rhipicephalus rutilus NCBITaxon:34632 Rhipicephalus sanguineus brown dog tick Ixodes sanguineus Rhipicephalus rutilus GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:348386 unclassified Lentivirus GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:35082 Cryptosporidiidae NCBITaxon:38173 GC_ID:1 ssRNA positive-strand viruses ssRNA positive-strand viruses, no DNA stage unclassified ssRNA positive-strand viruses, no DNA stage ncbi_taxonomy NCBITaxon:35278 unclassified ssRNA positive-strand viruses ssRNA positive-strand viruses ssRNA positive-strand viruses, no DNA stage unclassified ssRNA positive-strand viruses, no DNA stage GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:35324 unclassified Orthomyxoviridae GC_ID:1 dsRNA nonenveloped viruses ncbi_taxonomy NCBITaxon:35325 dsRNA viruses dsRNA nonenveloped viruses GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:35460 Chlorellales GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:35461 Chlorellaceae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:35493 Streptophyta GC_ID:1 ncbi_taxonomy Suiformes NCBITaxon:35497 Suina Suiformes GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:35500 Pecora GC_ID:11 PMID:1854635 ncbi_taxonomy Rhizobiaceae group Rhizobiales alpha-2 proteobacteria rhizobacteria NCBITaxon:356 Hyphomicrobiales Rhizobiaceae group Rhizobiales alpha-2 proteobacteria rhizobacteria GC_ID:11 PMID:7902843 PMID:8934912 ncbi_taxonomy NCBITaxon:35788 Rickettsia africae GC_ID:11 PMID:8102245 ncbi_taxonomy NCBITaxon:35789 Rickettsia helvetica GC_ID:11 PMID:1581190 PMID:2516664 ncbi_taxonomy NCBITaxon:35790 Rickettsia japonica GC_ID:11 ncbi_taxonomy NCBITaxon:35792 Rickettsia parkeri GC_ID:11 PMID:17114787 ncbi_taxonomy NCBITaxon:35793 Rickettsia sibirica GC_ID:1 BEP clade ncbi_taxonomy NCBITaxon:359160 BOP clade BEP clade GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:36086 Trichuris GC_ID:1 human whipworm ncbi_taxonomy NCBITaxon:36087 Trichuris trichiura human whipworm GC_ID:1 PMID:20380562 malaria parasite P. ovale ncbi_taxonomy NCBITaxon:36330 Plasmodium ovale malaria parasite P. ovale NCBITaxon:10624 GC_ID:1 Polyomavirus Polyomaviruses ncbi_taxonomy NCBITaxon:36362 Polyomavirus sp. Polyomavirus Polyomaviruses NCBITaxon:262400 GC_ID:1 apricot ncbi_taxonomy Armeniaca vulgaris Armeniaca vulgaris var. glabra Armeniaca vulgaris var. vulgaris NCBITaxon:36596 Prunus armeniaca apricot Armeniaca vulgaris Armeniaca vulgaris var. glabra Armeniaca vulgaris var. vulgaris GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:36734 Unikaryonidae GC_ID:11 PMID:8863443 ncbi_taxonomy NCBITaxon:36826 Clostridium botulinum A GC_ID:11 PMID:8863443 ncbi_taxonomy NCBITaxon:36827 Clostridium botulinum B GC_ID:11 ncbi_taxonomy NCBITaxon:36830 Clostridium botulinum E GC_ID:11 PMID:8863443 ncbi_taxonomy NCBITaxon:36831 Clostridium botulinum F GC_ID:11 Brucella melitensis bv. Canis ncbi_taxonomy Brucella melitensis biovar Canis NCBITaxon:36855 Brucella canis Brucella melitensis bv. Canis Brucella melitensis biovar Canis GC_ID:1 marsh rice rat ncbi_taxonomy NCBITaxon:37020 Oryzomys palustris marsh rice rat GC_ID:1 PMID:20093080 trichomonads ncbi_taxonomy trichomonads NCBITaxon:37104 Trichomonadida trichomonads trichomonads GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:37124 Chikungunya virus GC_ID:11 ncbi_taxonomy Mycobacterium avium complex bacterium NCBITaxon:37162 Mycobacterium avium complex sp. Mycobacterium avium complex bacterium GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:372083 Diphyllobothrium cordatum NCBITaxon:435896 HHV8 KSHV GC_ID:1 Human herpesvirus 8 Human herpesvirus 8 type P Kaposi's sarcoma herpesvirus Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus - Human herpesvirus 8 ncbi_taxonomy Kaposi's sarcoma-associated herpes-like virus Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus NCBITaxon:37296 Human gammaherpesvirus 8 HHV8 KSHV Human herpesvirus 8 Human herpesvirus 8 type P Kaposi's sarcoma herpesvirus Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus - Human herpesvirus 8 Kaposi's sarcoma-associated herpes-like virus Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus NCBITaxon:3473 NCBITaxon:3601 NCBITaxon:4266 GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:3744 Rosales GC_ID:1 PMID:14654427 ncbi_taxonomy NCBITaxon:374468 Nakaseomyces GC_ID:1 rose family ncbi_taxonomy Malaceae NCBITaxon:3745 Rosaceae rose family Malaceae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:3749 Malus GC_ID:1 apple apple tree cultivated apple ncbi_taxonomy Malus communis Malus pumila auct. Malus pumila var. domestica Malus sylvestris var. domestica Malus x domestica Pyrus malus Pyrus malus var. domestica NCBITaxon:3750 Malus domestica apple apple tree cultivated apple Malus communis Malus pumila auct. Malus pumila var. domestica Malus sylvestris var. domestica Malus x domestica Pyrus malus Pyrus malus var. domestica NCBITaxon:140650 NCBITaxon:203800 GC_ID:1 PMID:24631854 ncbi_taxonomy Prunus subg. Amygdalus Prunus subg. Armeniaca Prunus subg. Cerasus NCBITaxon:3754 Prunus Prunus subg. Amygdalus Prunus subg. Armeniaca Prunus subg. Cerasus GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:37567 Ditrysia NCBITaxon:114938 GC_ID:1 plum ncbi_taxonomy Prunus domestica subsp. intermedia NCBITaxon:3758 Prunus domestica plum Prunus domestica subsp. intermedia NCBITaxon:203801 GC_ID:1 peach ncbi_taxonomy Amygdalus persica Persica vulgaris Prunus persica var. densa NCBITaxon:3760 Prunus persica peach Amygdalus persica Persica vulgaris Prunus persica var. densa GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:376913 Haplorrhini GC_ID:1 ncbi_taxonomy Penicillium marneffei NCBITaxon:37727 Talaromyces marneffei Penicillium marneffei NCBITaxon:45259 GC_ID:11 PMID:8735110 PMID:9828442 ncbi_taxonomy Flinders Island spotted fever rickettsia Thai tick typhus rickettsia NCBITaxon:37816 Rickettsia honei Flinders Island spotted fever rickettsia Thai tick typhus rickettsia GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:379583 Feliformia GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:379584 Caniformia GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:37987 Pneumocystidales GC_ID:1 ncbi_taxonomy Sphaeriales NCBITaxon:37989 Xylariales Sphaeriales NCBITaxon:806 GC_ID:11 PMID:1371515 PMID:8240958 ncbi_taxonomy Rochalimaea henselae NCBITaxon:38323 Bartonella henselae Rochalimaea henselae NCBITaxon:4478 NCBITaxon:4727 GC_ID:1 PMID:26350789 ncbi_taxonomy NCBITaxon:38820 Poales GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:38946 Paracoccidioides GC_ID:1 Eurasian field mouse Old World field mouse striped field mouse ncbi_taxonomy Apodemus pratensis Mus agrarius NCBITaxon:39030 Apodemus agrarius Eurasian field mouse Old World field mouse striped field mouse Apodemus pratensis Mus agrarius EV-71 EV-A71 EV71 GC_ID:1 Enterovirus 71 Enterovirus EV-A71 Human enterovirus 71 Human enterovirus A71 Human enterovirus type 71 enterovirus type 71 ncbi_taxonomy NCBITaxon:39054 Enterovirus A71 EV-71 EV-A71 EV71 Enterovirus 71 Enterovirus EV-A71 Human enterovirus 71 Human enterovirus A71 Human enterovirus type 71 enterovirus type 71 GC_ID:1 ncbi_taxonomy Microtinae NCBITaxon:39087 Arvicolinae Microtinae NCBITaxon:109679 GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:39107 Murinae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:39700 Trypanozoon GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:39724 Circoviridae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:39725 Circovirus GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:39733 Astroviridae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:39744 Rubulavirus GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:39759 Deltavirus GC_ID:11 PMID:10555350 ncbi_taxonomy Calymmatobacterium granulomatis Donovania granulomatis Encapsulatus inguinalis NCBITaxon:39824 Klebsiella granulomatis Calymmatobacterium granulomatis Donovania granulomatis Encapsulatus inguinalis GC_ID:1 Yellow fever viruses ncbi_taxonomy NCBITaxon:40005 Yellow fever virus group Yellow fever viruses GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:400053 Sylvaemus group GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:40119 Parvovirinae GC_ID:1 Erythrovirus ncbi_taxonomy NCBITaxon:40121 Erythroparvovirus Erythrovirus GC_ID:1 PMID:15019624 PMID:15371245 ncbi_taxonomy NCBITaxon:40141 Sigmodontinae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:40272 Roseolovirus GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:40411 Chrysosporium NCBITaxon:27842 GC_ID:1 ncbi_taxonomy Cyclocoeloidea Fascioloidea NCBITaxon:404429 Echinostomatoidea Cyclocoeloidea Fascioloidea GC_ID:1 mammals ncbi_taxonomy mammals NCBITaxon:40674 Mammalia mammals mammals NCBITaxon:41936 GC_ID:1 ncbi_taxonomy Solananae NCBITaxon:4069 Solanales Solananae NCBITaxon:40319 GC_ID:1 nightshade family ncbi_taxonomy NCBITaxon:4070 Solanaceae nightshade family NCBITaxon:195582 GC_ID:1 tomato ncbi_taxonomy Lycopersicon esculentum Lycopersicon esculentum var. esculentum Solanum esculentum Solanum lycopersicum var. humboldtii NCBITaxon:4081 Solanum lycopersicum tomato Lycopersicon esculentum Lycopersicon esculentum var. esculentum Solanum esculentum Solanum lycopersicum var. humboldtii NCBITaxon:98969 GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:41011 Tineoidea GC_ID:1 clothes moths clothes-moths fungus moths ncbi_taxonomy NCBITaxon:41012 Tineidae clothes moths clothes-moths fungus moths GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:41013 Tinea NCBITaxon:4080 NCBITaxon:49275 GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:4107 Solanum GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:41165 Schizopyrenida GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:41191 Glossata GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:41196 Neolepidoptera NCBITaxon:37583 GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:41197 Heteroneura GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:41283 Chrysosporium parvum GC_ID:1 ncbi_taxonomy Neopterygi NCBITaxon:41665 Neopterygii Neopterygi NCBITaxon:66829 GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:41687 Scedosporium GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:41705 Protacanthopterygii GC_ID:1 ncbi_taxonomy Plasmodium NCBITaxon:418103 Plasmodium (Plasmodium) Plasmodium GC_ID:1 ncbi_taxonomy Laverania NCBITaxon:418107 Plasmodium (Laverania) Laverania GC_ID:1 biting midges no-see-ums ncbi_taxonomy NCBITaxon:41819 Ceratopogonidae biting midges no-see-ums GC_ID:1 Culicoides punkies ncbi_taxonomy NCBITaxon:41820 Culicoides <genus> Culicoides punkies GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:41827 Culicoidea GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:41828 Chironomoidea GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:41831 Psychodoidea GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:42068 Pneumocystis jirovecii GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:42113 Clitellata GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:42230 Mansonella GC_ID:1 ncbi_taxonomy Dipetalonema perstans NCBITaxon:42231 Mansonella perstans Dipetalonema perstans GC_ID:1 ncbi_taxonomy Hematozoa Vivier 1982 NCBITaxon:422676 Aconoidasida Hematozoa Vivier 1982 GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:423054 Eimeriorina GC_ID:1 pack rats trade rats wood rats ncbi_taxonomy NCBITaxon:42407 Neotoma pack rats trade rats wood rats GC_ID:1 white-throated woodrat ncbi_taxonomy NCBITaxon:42408 Neotoma albigula white-throated woodrat GC_ID:1 cotton rats ncbi_taxonomy NCBITaxon:42414 Sigmodon cotton rats NCBITaxon:89247 GC_ID:1 hispid cotton rat ncbi_taxonomy Sigmodon hispiedis NCBITaxon:42415 Sigmodon hispidus hispid cotton rat Sigmodon hispiedis GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:424551 Solanoideae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:424574 Solaneae GC_ID:1 ncbi_taxonomy Fungi/Metazoa incertae sedis NCBITaxon:42461 Opisthokonta incertae sedis Fungi/Metazoa incertae sedis GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:426437 Rhipicephalinae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:426438 Hyalomminae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:426439 Haemaphysalinae GC_ID:1 ncbi_taxonomy Eschatocephalinae NCBITaxon:426441 Amblyomminae Eschatocephalinae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:426442 Ixodinae GC_ID:1 PMID:14707501 Rhipicephalus ncbi_taxonomy Rhipicephalus (Rhipicephalus) NCBITaxon:426455 Rhipicephalus <subgenus> Rhipicephalus Rhipicephalus (Rhipicephalus) GC_ID:1 ncbi_taxonomy Slopalinida NCBITaxon:42740 Opalinata Slopalinida NCBITaxon:135271 NCBITaxon:147578 GC_ID:11 PMID:11321078 PMID:12508865 PMID:8904435 ncbi_taxonomy Rickettsia azadi NCBITaxon:42862 Rickettsia felis Rickettsia azadi GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:43075 Trichomonas tenax GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:431037 unclassified Roseolovirus GC_ID:6 ncbi_taxonomy NCBITaxon:431838 Intramacronucleata NCBITaxon:82104 GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:43219 Herpotrichiellaceae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:43351 Dientamoeba GC_ID:1 dinosaur dinosaurs ncbi_taxonomy NCBITaxon:436486 Dinosauria dinosaur dinosaurs GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:436489 Saurischia GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:436491 Theropoda GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:436492 Coelurosauria NCBITaxon:43732 GC_ID:1 ncbi_taxonomy Asilomorpha NCBITaxon:43733 Muscomorpha Asilomorpha GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:43735 Tabanomorpha GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:43738 Schizophora GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:43741 Acalyptratae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:43742 Calyptratae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:43746 Ephydroidea GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:43750 Sciomyzoidea GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:43755 Oestroidea GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:43786 Culicomorpha GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:43787 Psychodomorpha GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:43801 Ceratopogoninae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:43816 Anophelinae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:43817 Culicinae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:43845 Drosophilinae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:43913 Chrysomyinae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:43920 Chrysopsinae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:439488 ssRNA viruses GC_ID:1 unassigned ssRNA viruses ncbi_taxonomy NCBITaxon:439490 unclassified ssRNA viruses unassigned ssRNA viruses GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:43987 Geotrichum GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:44281 Pneumocystidaceae GC_ID:11 PMID:434652 ncbi_taxonomy NCBITaxon:444 Legionellaceae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:44417 Cyclospora GC_ID:1 PMID:25249442 monocots monocotyledons ncbi_taxonomy Monocotyledoneae monocots NCBITaxon:4447 Liliopsida monocots monocotyledons Monocotyledoneae monocots NCBITaxon:29550 GC_ID:11 PMID:16166707 PMID:434652 PMID:8573522 PMID:9734026 ncbi_taxonomy Sarcobium NCBITaxon:445 Legionella Sarcobium GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:44534 Cellia GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:44537 Pyretophorus GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:44542 gambiae species complex GC_ID:1 Phlebotomus ncbi_taxonomy NCBITaxon:44556 Phlebotomus <subgenus> Phlebotomus GC_ID:11 PMID:434652 ncbi_taxonomy NCBITaxon:446 Legionella pneumophila NCBITaxon:13014 GC_ID:1 ncbi_taxonomy Clethrionomys NCBITaxon:447134 Myodes Clethrionomys NCBITaxon:51090 GC_ID:1 Bank vole bank vole ncbi_taxonomy Clethrionomys glareolus Mus glareolus NCBITaxon:447135 Myodes glareolus Bank vole bank vole Clethrionomys glareolus Mus glareolus NCBITaxon:1661618 GC_ID:1 grass family ncbi_taxonomy Bambusaceae Gramineae NCBITaxon:4479 Poaceae grass family Bambusaceae Gramineae GC_ID:1 PMID:14715234 PMID:17010206 PMID:17051209 PMID:17572334 PMID:27738200 ncbi_taxonomy Zygomycota NCBITaxon:451507 Mucoromycotina Zygomycota GC_ID:1 PMID:15689432 PMID:16151185 PMID:17010206 PMID:17051209 PMID:17572334 ncbi_taxonomy NCBITaxon:451864 Dikarya GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:451866 Taphrinomycotina GC_ID:1 PMID:17486979 ncbi_taxonomy NCBITaxon:451867 Dothideomycetidae GC_ID:1 PMID:17486979 ncbi_taxonomy NCBITaxon:451868 Pleosporomycetidae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:451870 Chaetothyriomycetidae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:451871 Eurotiomycetidae GTOV GC_ID:1 Guanarito arenavirus Guanarito virus ncbi_taxonomy NCBITaxon:45219 Guanarito mammarenavirus GTOV Guanarito arenavirus Guanarito virus GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:452284 Ustilaginomycotina NCBITaxon:452564 GC_ID:1 PMID:17486979 ncbi_taxonomy Davidiellaceae NCBITaxon:452563 Cladosporiaceae Davidiellaceae NCBITaxon:317864 GC_ID:11 PMID:15766388 Israeli tick typhus rickettsia ncbi_taxonomy NCBITaxon:45258 Rickettsia conorii subsp. israelensis Israeli tick typhus rickettsia GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:455381 Capillariidae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:4564 Triticum true GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:464095 Picornavirales GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:46580 Spirometra GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:466552 Meleagridinae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:46682 Heterakoidea GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:46683 Ascaridiidae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:46684 Ascaridia GC_ID:11 PMID:9542079 ncbi_taxonomy Acinetobacteraceae Branhamaceae NCBITaxon:468 Moraxellaceae Acinetobacteraceae Branhamaceae CTFV GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:46839 Colorado tick fever virus CTFV GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:46877 Drosophilini GC_ID:11 PMID:10028249 PMID:7520730 PMID:8934907 PMID:9226915 PMID:9336926 ncbi_taxonomy NCBITaxon:469 Acinetobacter GC_ID:1 Whitewater Arroyo virus ncbi_taxonomy NCBITaxon:46919 Whitewater Arroyo mammarenavirus Whitewater Arroyo virus GC_ID:11 Chlamydia trachomatis str. 434/Bu Chlamydia trachomatis strain 434/Bu ncbi_taxonomy NCBITaxon:471472 Chlamydia trachomatis 434/Bu Chlamydia trachomatis str. 434/Bu Chlamydia trachomatis strain 434/Bu GC_ID:1 PMID:26350789 ncbi_taxonomy Commelinidae Commeliniflorae NCBITaxon:4734 commelinids Commelinidae Commeliniflorae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:474019 Sarcoptinae GC_ID:1 PMID:11062127 PMID:12684019 ncbi_taxonomy Mycota fungi NCBITaxon:4751 Fungi Mycota fungi GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:4753 Pneumocystis GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:47570 Schizotrypanum GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:476427 Xenopsyllinae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:480117 Cyclorrhapha GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:480118 Eremoneura GC_ID:11 PMID:19019760 PMID:25831531 PMID:35467405 ncbi_taxonomy NCBITaxon:480418 Mycobacterium lepromatosis GC_ID:11 PMID:13983561 PMID:16350128 PMID:23575986 PMID:8347509 ncbi_taxonomy Vitreoscillaceae NCBITaxon:481 Neisseriaceae Vitreoscillaceae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:481310 Demodex folliculorum GC_ID:11 PMID:7520730 ncbi_taxonomy "Merismopedia" Zopf 1885 Gonococcus NCBITaxon:482 Neisseria "Merismopedia" Zopf 1885 Gonococcus NCBITaxon:59309 GC_ID:1 ncbi_taxonomy Isospora belli NCBITaxon:482538 Cystoisospora belli Isospora belli GC_ID:1 PMID:12684019 PMID:14715234 PMID:17051209 PMID:17486964 PMID:17572334 pin molds ncbi_taxonomy NCBITaxon:4827 Mucorales pin molds GC_ID:11 ncbi_taxonomy Diplococcus gonorrhoeae Gonococcus neisseri Merismopedia gonorrhoeae Micrococcus der gonorrhoe Micrococcus gonococcus Micrococcus gonorrhoeae NCBITaxon:485 Neisseria gonorrhoeae Diplococcus gonorrhoeae Gonococcus neisseri Merismopedia gonorrhoeae Micrococcus der gonorrhoe Micrococcus gonococcus Micrococcus gonorrhoeae GC_ID:1 PMID:17051209 PMID:17572334 ncbi_taxonomy NCBITaxon:4857 Entomophthorales GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:4858 Basidiobolaceae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:4859 Basidiobolus GC_ID:11 ncbi_taxonomy Diplokokkus intracellularis meningitidis Micrococcus intracellularis Micrococcus meningitidis Micrococcus meningitidis cerebrospinalis Neisseria weichselbaumii NCBITaxon:487 Neisseria meningitidis Diplokokkus intracellularis meningitidis Micrococcus intracellularis Micrococcus meningitidis Micrococcus meningitidis cerebrospinalis Neisseria weichselbaumii GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:48791 Setariidae GC_ID:1 Setaria ncbi_taxonomy NCBITaxon:48796 Setaria <nematodes> Setaria GC_ID:1 PMID:17572334 ascomycetes sac fungi ncbi_taxonomy ascomycete fungi NCBITaxon:4890 Ascomycota ascomycetes sac fungi ascomycete fungi GC_ID:1 ncbi_taxonomy Hemiascomycetes NCBITaxon:4891 Saccharomycetes Hemiascomycetes GC_ID:1 ncbi_taxonomy Endomycetales budding yeasts NCBITaxon:4892 Saccharomycetales Endomycetales budding yeasts NCBITaxon:221665 NCBITaxon:44280 GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:4893 Saccharomycetaceae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:49202 Dermacentor marginatus GC_ID:1 ncbi_taxonomy Lycopersicon NCBITaxon:49274 Solanum subgen. Lycopersicon Lycopersicon GC_ID:1 PMID:17997297 ncbi_taxonomy Mycocladaceae Mycocladiaceae NCBITaxon:499202 Lichtheimiaceae Mycocladaceae Mycocladiaceae GC_ID:1 Chapare virus ncbi_taxonomy NCBITaxon:499556 Chapare mammarenavirus Chapare virus GC_ID:1 ncbi_taxonomy Pyrenomycetes NCBITaxon:5014 Dothideales Pyrenomycetes GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:5036 Histoplasma NCBITaxon:61255 GC_ID:1 ncbi_taxonomy Ajellomyces capsulatus (Kwon-Chung) McGinnis & Katz, 1979 Cryptococcus capsulatus Emmonsiella capsulata NCBITaxon:5037 Histoplasma capsulatum Ajellomyces capsulatus (Kwon-Chung) McGinnis & Katz, 1979 Cryptococcus capsulatus Emmonsiella capsulata GC_ID:1 ncbi_taxonomy Ajellomyces dermatitidis Blastomycoides dermatitidis NCBITaxon:5039 Blastomyces dermatitidis Ajellomyces dermatitidis Blastomycoides dermatitidis NCBITaxon:36045 GC_ID:1 green and blue molds ncbi_taxonomy Elaphomycetales NCBITaxon:5042 Eurotiales green and blue molds Elaphomycetales GC_ID:1 trouts, salmons & chars ncbi_taxonomy NCBITaxon:504568 Salmoninae trouts, salmons & chars NCBITaxon:1131475 NCBITaxon:36632 NCBITaxon:36634 NCBITaxon:37503 NCBITaxon:5071 NCBITaxon:743109 GC_ID:1 PMID:20141373 PMID:28082760 ncbi_taxonomy Chaetosartorya Emericella Petromyces Phialosimplex Polypaecilum NCBITaxon:5052 Aspergillus Chaetosartorya Emericella Petromyces Phialosimplex Polypaecilum GC_ID:1 true insects ncbi_taxonomy insects NCBITaxon:50557 Insecta true insects insects GC_ID:11 ncbi_taxonomy NCBITaxon:506 Alcaligenaceae NCBITaxon:319628 GC_ID:1 PMID:21892240 ncbi_taxonomy Aspergillus lacticoffeatus Aspergillus lacticoffeatus Frisvad & Samson, 2004 NCBITaxon:5061 Aspergillus niger Aspergillus lacticoffeatus Aspergillus lacticoffeatus Frisvad & Samson, 2004 NCBITaxon:28577 GC_ID:1 ncbi_taxonomy Eupenicillium NCBITaxon:5073 Penicillium Eupenicillium GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:5094 Talaromyces GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:51025 Oxyuroidea GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:51026 Oxyuridae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:51027 Enterobius GC_ID:1 human pinworm ncbi_taxonomy NCBITaxon:51028 Enterobius vermicularis human pinworm GC_ID:1 ncbi_taxonomy Pyrenomycetes NCBITaxon:5125 Hypocreales Pyrenomycetes GC_ID:11 PMID:10319462 PMID:10826799 PMID:11211265 PMID:16079343 PMID:25634949 PMID:26179278 ncbi_taxonomy chlamydias NCBITaxon:51291 Chlamydiales chlamydias GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:513040 Dioctophymatidae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:513042 Dioctophyme GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:513045 Dioctophyme renale GC_ID:1 ncbi_taxonomy Pyrenomycetes NCBITaxon:5151 Ophiostomatales Pyrenomycetes NCBITaxon:117573 GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:5152 Ophiostomataceae GC_ID:11 PMID:11491321 ncbi_taxonomy NCBITaxon:517 Bordetella GC_ID:11 PMID:8240949 PMID:8782670 ncbi_taxonomy Acinetobacter parapertussis Bacillus parapertussis Haemophilus parapertussis NCBITaxon:519 Bordetella parapertussis Acinetobacter parapertussis Bacillus parapertussis Haemophilus parapertussis GC_ID:11 PMID:8240949 ncbi_taxonomy Bacterium tussis-convulsivae Haemophilus pertussis Hemophilus pertussis Microbe de la coqueluche NCBITaxon:520 Bordetella pertussis Bacterium tussis-convulsivae Haemophilus pertussis Hemophilus pertussis Microbe de la coqueluche GC_ID:1 basidiomycetes ncbi_taxonomy basidiomycete fungi NCBITaxon:5204 Basidiomycota basidiomycetes basidiomycete fungi NCBITaxon:107441 NCBITaxon:192653 NCBITaxon:5415 GC_ID:1 PMID:34380577 Cryptococcus ncbi_taxonomy Filobasidiella NCBITaxon:5206 Cryptococcus <basidiomycete fungi> Cryptococcus Filobasidiella GC_ID:1 ncbi_taxonomy Blastomyces neoformans Debaryomyces neoformans Filobasidiella neoformans Lipomyces neoformans Saccharomyces neoformans Torula neoformans Torulopsis neoformans NCBITaxon:5207 Cryptococcus neoformans Blastomyces neoformans Debaryomyces neoformans Filobasidiella neoformans Lipomyces neoformans Saccharomyces neoformans Torula neoformans Torulopsis neoformans GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:52281 Sarcoptidae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:52282 Sarcoptes NCBITaxon:197185 NCBITaxon:198574 NCBITaxon:268761 NCBITaxon:268762 NCBITaxon:268763 NCBITaxon:337908 GC_ID:1 ncbi_taxonomy Sarcoptes scabiei type canis Sarcoptes scabiei type chimp Sarcoptes scabiei type hominis Sarcoptes scabiei type suis Sarcoptes scabiei type wallaby Sarcoptes scabiei type wombati Sarcoptes scabiei var. canis Sarcoptes scabiei var. chimp Sarcoptes scabiei var. hominis Sarcoptes scabiei var. nyctereutis Sarcoptes scabiei var. suis Sarcoptes scabiei var. wallaby Sarcoptes scabiei var. wombati NCBITaxon:52283 Sarcoptes scabiei Sarcoptes scabiei type canis Sarcoptes scabiei type chimp Sarcoptes scabiei type hominis Sarcoptes scabiei type suis Sarcoptes scabiei type wallaby Sarcoptes scabiei type wombati Sarcoptes scabiei var. canis Sarcoptes scabiei var. chimp Sarcoptes scabiei var. hominis Sarcoptes scabiei var. nyctereutis Sarcoptes scabiei var. suis Sarcoptes scabiei var. wallaby Sarcoptes scabiei var. wombati GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:523089 Haemaphysalis concinna NCBITaxon:63407 GC_ID:1 ncbi_taxonomy Arthroderma vanbreuseghemii Ctenomyces mentagrophytes Ectotrichophyton mentagrophytes Microides mentagrophytes Microsporon mentagrophytes Microsporum mentagrophytes Spiralia mentagrophytes NCBITaxon:523103 Trichophyton mentagrophytes Arthroderma vanbreuseghemii Ctenomyces mentagrophytes Ectotrichophyton mentagrophytes Microides mentagrophytes Microsporon mentagrophytes Microsporum mentagrophytes Spiralia mentagrophytes NCBITaxon:106739 NCBITaxon:165809 NCBITaxon:34476 GC_ID:1 PMID:17572334 jelly fungi ncbi_taxonomy NCBITaxon:5234 Tremellales jelly fungi GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:52564 Oesophagostomum GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:52651 Chabertiidae GC_ID:11 PMID:23606477 ncbi_taxonomy NCBITaxon:526524 Erysipelotrichia GC_ID:11 ncbi_taxonomy NCBITaxon:526525 Erysipelotrichales GC_ID:1 Hymenomycetes ncbi_taxonomy NCBITaxon:5302 Agaricomycotina Hymenomycetes GC_ID:1 Variola virus subsp. minor ncbi_taxonomy NCBITaxon:53258 Variola minor virus Variola virus subsp. minor GC_ID:11 Treponema pallidum endemicum ncbi_taxonomy NCBITaxon:53436 Treponema pallidum subsp. endemicum Treponema pallidum endemicum GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:53466 Mesocestoididae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:53467 Mesocestoides GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:53469 Ancylostomatinae GC_ID:1 Culex ncbi_taxonomy NCBITaxon:53527 Culex <subgenus> Culex GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:53549 Sabethini GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:53550 Culicini GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:53551 Sabethes GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:54281 Chrysomyini GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:54285 Oestrinae GC_ID:1 Yellow-necked field mouse ncbi_taxonomy Mus flavicollis Sylvaemus flavicollis NCBITaxon:54292 Apodemus flavicollis Yellow-necked field mouse Mus flavicollis Sylvaemus flavicollis GC_ID:11 PMID:10555323 PMID:10555334 PMID:16166704 PMID:27620848 ncbi_taxonomy Enterobacteraceae enterobacteria gamma-3 proteobacteria NCBITaxon:543 Enterobacteriaceae Enterobacteraceae enterobacteria gamma-3 proteobacteria GC_ID:1 PMID:30257078 ncbi_taxonomy NCBITaxon:543769 Rhizaria GC_ID:11 ncbi_taxonomy "Mollicutaeota" Oren et al. 2015 Mollicutota Tenericuteota Tenericutes NCBITaxon:544448 Mycoplasmatota "Mollicutaeota" Oren et al. 2015 Mollicutota Tenericuteota Tenericutes NCBITaxon:1535326 GC_ID:12 ncbi_taxonomy Torulopsis NCBITaxon:5475 Candida Torulopsis GC_ID:1 PMID:14654427 ncbi_taxonomy Candida glabrata Cryptococcus glabratus Torulopsis glabrata NCBITaxon:5478 Nakaseomyces glabratus Candida glabrata Cryptococcus glabratus Torulopsis glabrata GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:548681 Herpesvirales NCBITaxon:1685474 GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:5498 Cladosporium GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:5500 Coccidioides GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:5501 Coccidioides immitis NCBITaxon:140105 NCBITaxon:1634940 NCBITaxon:342329 NCBITaxon:40620 NCBITaxon:5126 GC_ID:1 PMID:23379853 PMID:30728601 PMID:31226019 PMID:33200960 ncbi_taxonomy Albonectria Bisifusarium Cyanonectria Fusarium sect. Setofusarium Geejayessia Gibberella Haematonectria Luteonectria Luteonectria Sand.-Den., L. Lombard, Schroers & Rossman, 2021 Neocosmospora Nothofusarium Rectifusarium Setofusarium NCBITaxon:5506 Fusarium Albonectria Bisifusarium Cyanonectria Fusarium sect. Setofusarium Geejayessia Gibberella Haematonectria Luteonectria Luteonectria Sand.-Den., L. Lombard, Schroers & Rossman, 2021 Neocosmospora Nothofusarium Rectifusarium Setofusarium GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:55193 Malassezia GC_ID:1 Pityriasis (Tinea) versicolor infection agent ncbi_taxonomy Microsporum furfur Pityrosporum orbiculare Pityrosporum ovale Saccharomyces ovalis NCBITaxon:55194 Malassezia furfur Pityriasis (Tinea) versicolor infection agent Microsporum furfur Pityrosporum orbiculare Pityrosporum ovale Saccharomyces ovalis NCBITaxon:1450542 GC_ID:1 ncbi_taxonomy Cryptococcus bacillisporus Cryptococcus bacillisporus VGIII Filobasidiella bacillispora Filobasidiella neoformans var. bacillispora NCBITaxon:552467 Cryptococcus gattii VGIII Cryptococcus bacillisporus Cryptococcus bacillisporus VGIII Filobasidiella bacillispora Filobasidiella neoformans var. bacillispora GC_ID:1 PMID:23020233 PMID:30257078 ncbi_taxonomy NCBITaxon:554915 Amoebozoa NCBITaxon:2081530 NCBITaxon:2564087 GC_ID:1 PMID:27783317 ncbi_taxonomy Bodinia Grubyella NCBITaxon:5550 Trichophyton Bodinia Grubyella NCBITaxon:106843 NCBITaxon:107448 NCBITaxon:165811 NCBITaxon:599816 GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:5552 Trichosporon GC_ID:1 ncbi_taxonomy Flabellinea NCBITaxon:555280 Discosea Flabellinea GC_ID:1 ncbi_taxonomy Pleurococcus beigelii NCBITaxon:5553 Trichosporon beigelii Pleurococcus beigelii GC_ID:1 PMID:23020233 ncbi_taxonomy NCBITaxon:555406 Archamoebae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:555407 Centramoebida GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:555864 unclassified Bornaviridae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:55746 Panagrolaimoidea GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:5579 Aureobasidium NCBITaxon:6403 GC_ID:1 leeches ncbi_taxonomy NCBITaxon:55824 Hirudinea leeches NCBITaxon:108021 NCBITaxon:52865 GC_ID:1 ncbi_taxonomy Nadsoniella Wangiella NCBITaxon:5583 Exophiala Nadsoniella Wangiella GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:5587 Rhinocladiella GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:55872 Dracunculoidea NCBITaxon:45490 GC_ID:1 ncbi_taxonomy Plectomycetes NCBITaxon:5592 Microascales Plectomycetes NCBITaxon:34396 GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:5593 Microascaceae GC_ID:1 PMID:18077629 ncbi_taxonomy Allescheria boydii Cephalosporium boydii Pseudallescheria boydii NCBITaxon:5597 Scedosporium boydii Allescheria boydii Cephalosporium boydii Pseudallescheria boydii NCBITaxon:645883 GC_ID:1 PMID:24014900 ncbi_taxonomy NCBITaxon:5598 Alternaria GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:5600 Phialophora GC_ID:11 PMID:19700542 ncbi_taxonomy NCBITaxon:561 Escherichia NCBITaxon:1637691 NCBITaxon:1806490 NCBITaxon:469598 NCBITaxon:662101 NCBITaxon:662104 GC_ID:11 PMID:10319482 E. coli Escherichia/Shigella coli ncbi_taxonomy Bacillus coli Bacterium coli Bacterium coli commune Enterococcus coli NCBITaxon:562 Escherichia coli E. coli Escherichia/Shigella coli Bacillus coli Bacterium coli Bacterium coli commune Enterococcus coli GC_ID:1 large vesper mouse ncbi_taxonomy NCBITaxon:56210 Calomys callosus large vesper mouse GC_ID:1 small vesper mouse ncbi_taxonomy NCBITaxon:56211 Calomys laucha small vesper mouse GC_ID:1 drylands vesper mouse ncbi_taxonomy NCBITaxon:56212 Calomys musculinus drylands vesper mouse GC_ID:1 kinetoplasts ncbi_taxonomy Kinetoplastida Protomonadida kinetoplastids NCBITaxon:5653 Kinetoplastea kinetoplasts Kinetoplastida Protomonadida kinetoplastids GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:5654 Trypanosomatidae BDBV GC_ID:1 Bundibugyo virus Ebolavirus bundibugyo ncbi_taxonomy NCBITaxon:565995 Bundibugyo ebolavirus BDBV Bundibugyo virus Ebolavirus bundibugyo GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:5690 Trypanosoma GC_ID:1 ncbi_taxonomy Trypanosoma (Trypanozoon) brucei Trypanosoma brucei subgroup NCBITaxon:5691 Trypanosoma brucei Trypanosoma (Trypanozoon) brucei Trypanosoma brucei subgroup GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:5693 Trypanosoma cruzi NCBITaxon:39823 GC_ID:11 PMID:10555350 PMID:11411716 PMID:12635932 ncbi_taxonomy Calymmatobacterium Donovania Hyalococcus NCBITaxon:570 Klebsiella Calymmatobacterium Donovania Hyalococcus GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:57077 Dicrocoelium GC_ID:1 PMID:20093080 parabasalians parabasalids ncbi_taxonomy Parabasalidea NCBITaxon:5719 Parabasalia parabasalians parabasalids Parabasalidea GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:5721 Trichomonas NCBITaxon:28848 GC_ID:1 ncbi_taxonomy Tritrichomonas vaginalis NCBITaxon:5722 Trichomonas vaginalis Tritrichomonas vaginalis NCBITaxon:1096019 NCBITaxon:1673140 NCBITaxon:1795825 NCBITaxon:585494 NCBITaxon:692338 NCBITaxon:875801 GC_ID:11 PMID:11411715 PMID:1581186 ncbi_taxonomy 'Klebsiella aerogenes' (Kruse) Taylor et al. 1956 Bacillus pneumoniae Bacterium pneumoniae crouposae Hyalococcus pneumoniae Klebsiella pneumoniae aerogenes NCBITaxon:573 Klebsiella pneumoniae 'Klebsiella aerogenes' (Kruse) Taylor et al. 1956 Bacillus pneumoniae Bacterium pneumoniae crouposae Hyalococcus pneumoniae Klebsiella pneumoniae aerogenes GC_ID:1 diplomonads ncbi_taxonomy diplomonads NCBITaxon:5738 Diplomonadida diplomonads diplomonads GC_ID:6 ncbi_taxonomy NCBITaxon:5739 Hexamitidae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:5740 Giardia GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:574145 Demodex brevis GC_ID:1 ncbi_taxonomy Lobosa NCBITaxon:5752 Heterolobosea Lobosa GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:5754 Acanthamoeba GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:5758 Entamoeba GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:5759 Entamoeba histolytica GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:5761 Naegleria GC_ID:1 brain-eating amoeba ncbi_taxonomy NCBITaxon:5763 Naegleria fowleri brain-eating amoeba GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:5765 Vahlkampfiidae GC_ID:11 ncbi_taxonomy unclassified Micrococcineae NCBITaxon:577468 Micrococcales incertae sedis unclassified Micrococcineae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:578835 Rhipicephalus sanguineus group GC_ID:1 apicomplexans ncbi_taxonomy apicomplexans NCBITaxon:5794 Apicomplexa apicomplexans apicomplexans GC_ID:1 ncbi_taxonomy coccidians NCBITaxon:5796 Coccidia coccidians GC_ID:1 ncbi_taxonomy Eimeriids NCBITaxon:5799 Eimeriidae Eimeriids GC_ID:1 vascular plants ncbi_taxonomy vascular plants NCBITaxon:58023 Tracheophyta vascular plants vascular plants GC_ID:1 seed plants ncbi_taxonomy seed plants NCBITaxon:58024 Spermatophyta seed plants seed plants GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:5806 Cryptosporidium NCBITaxon:2200815 NCBITaxon:2200816 NCBITaxon:2200817 NCBITaxon:2200818 NCBITaxon:2200819 NCBITaxon:2200820 NCBITaxon:2200821 NCBITaxon:2200822 NCBITaxon:2200823 NCBITaxon:2200824 NCBITaxon:2200825 NCBITaxon:2200826 GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:5807 Cryptosporidium parvum GC_ID:1 ncbi_taxonomy Sarcocystids NCBITaxon:5809 Sarcocystidae Sarcocystids GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:5810 Toxoplasma GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:5811 Toxoplasma gondii GC_ID:1 haemosporidians ncbi_taxonomy Haemosporina Haemospororida NCBITaxon:5819 Haemosporida haemosporidians Haemosporina Haemospororida GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:5820 Plasmodium GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:58262 Culicoidini GC_ID:11 PMID:26944634 Proteus ncbi_taxonomy Liquidobacterium NCBITaxon:583 Proteus <enterobacteria> Proteus Liquidobacterium GC_ID:1 malaria parasite P. falciparum ncbi_taxonomy Plasmodium (Laverania) falciparum NCBITaxon:5833 Plasmodium falciparum malaria parasite P. falciparum Plasmodium (Laverania) falciparum GC_ID:1 malaria parasite P. vivax ncbi_taxonomy Haemamoeba vivax Haemamoeba vivax Grassi and Feletti, 1890 NCBITaxon:5855 Plasmodium vivax malaria parasite P. vivax Haemamoeba vivax Haemamoeba vivax Grassi and Feletti, 1890 GC_ID:1 Piroplasmids ncbi_taxonomy NCBITaxon:5863 Piroplasmida Piroplasmids GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:5864 Babesia GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:5873 Theileria GC_ID:6 ciliates ncbi_taxonomy Ciliata ciliates NCBITaxon:5878 Ciliophora ciliates Ciliata ciliates NCBITaxon:27986 GC_ID:1 ncbi_taxonomy Septata intestinalis NCBITaxon:58839 Encephalitozoon intestinalis Septata intestinalis GC_ID:11 PMID:10319519 PMID:10939679 PMID:12072558 PMID:15653929 PMID:15653930 PMID:3231714 PMID:9731304 ncbi_taxonomy NCBITaxon:590 Salmonella GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:59140 Myzomyia GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:59142 funestus group GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:59263 Toxascaris GC_ID:1 ncbi_taxonomy Hormiscium dermatitidis Wangiella dermatitidis NCBITaxon:5970 Exophiala dermatitidis Hormiscium dermatitidis Wangiella dermatitidis GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:59848 Chrysopsini GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:5988 Litostomatea GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:600346 Portuninae NCBITaxon:6030 NCBITaxon:6031 GC_ID:1 PMID:10563021 PMID:12142484 PMID:12684019 PMID:17051209 PMID:28808018 PMID:9892676 microsporidians ncbi_taxonomy Microspora Microsporea Microsporida microsporidians NCBITaxon:6029 Microsporidia microsporidians Microspora Microsporea Microsporida microsporidians GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:6032 Apansporoblastina NCBITaxon:27985 GC_ID:1 ncbi_taxonomy Septata NCBITaxon:6033 Encephalitozoon Septata GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:6035 Encephalitozoon cuniculi GC_ID:1 broad fish tapeworm ncbi_taxonomy Diphyllobothrium latum NCBITaxon:60516 Dibothriocephalus latus broad fish tapeworm Diphyllobothrium latum GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:6072 Eumetazoa GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:607660 Ponginae true GC_ID:1 flatworm flatworms ncbi_taxonomy flatworms NCBITaxon:6157 Platyhelminthes flatworm flatworms flatworms GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:6178 Trematoda GC_ID:1 Digenea flukes ncbi_taxonomy NCBITaxon:6179 Digenea <flatworms> Digenea flukes GC_ID:1 ncbi_taxonomy Strigeida NCBITaxon:6180 Strigeidida Strigeida GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:6181 Schistosoma GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:6182 Schistosoma japonicum GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:6183 Schistosoma mansoni GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:6187 Schistosoma intercalatum GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:6193 Opisthorchiida GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:6194 Opisthorchiata GC_ID:1 tapeworms ncbi_taxonomy NCBITaxon:6199 Cestoda tapeworms GC_ID:11 PMID:26834722 ncbi_taxonomy NCBITaxon:620 Shigella GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:6200 Eucestoda GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:6201 Cyclophyllidea GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:6202 Taenia GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:6208 Taeniidae GC_ID:1 PMID:12377596 PMID:12964823 PMID:16352465 PMID:17156584 PMID:18180956 PMID:18338180 ncbi_taxonomy NCBITaxon:6209 Echinococcus GC_ID:11 PMID:16561743 ncbi_taxonomy NCBITaxon:621 Shigella boydii GC_ID:1 PMID:12377596 PMID:12964823 PMID:16352465 PMID:17156584 PMID:18180956 PMID:18338180 ncbi_taxonomy Echinococcus granulosus G1 strain Echinococcus granulosus G2 strain Echinococcus granulosus G3 strain Echinococcus granulosus Tasmanian sheep strain Echinococcus granulosus buffalo strain Echinococcus granulosus s. s. Echinococcus granulosus sensu stricto Echinococcus granulosus sheep strain NCBITaxon:6210 Echinococcus granulosus Echinococcus granulosus G1 strain Echinococcus granulosus G2 strain Echinococcus granulosus G3 strain Echinococcus granulosus Tasmanian sheep strain Echinococcus granulosus buffalo strain Echinococcus granulosus s. s. Echinococcus granulosus sensu stricto Echinococcus granulosus sheep strain GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:6211 Echinococcus multilocularis GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:6213 Echinococcus vogeli GC_ID:1 nematode nematodes roundworm roundworms ncbi_taxonomy Nemata nematodes NCBITaxon:6231 Nematoda nematode nematodes roundworm roundworms Nemata nematodes GC_ID:1 African malaria mosquito ncbi_taxonomy NCBITaxon:62324 Anopheles funestus African malaria mosquito NCBITaxon:33251 GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:6236 Rhabditida GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:6246 Strongyloididae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:6247 Strongyloides GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:6248 Strongyloides stercoralis NCBITaxon:33255 GC_ID:1 ncbi_taxonomy Ascaridida NCBITaxon:6249 Ascaridomorpha Ascaridida GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:6250 Ascarididae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:6251 Ascaris GC_ID:1 common roundworm ncbi_taxonomy NCBITaxon:6252 Ascaris lumbricoides common roundworm GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:6258 Baylisascaris GC_ID:1 raccoon roundworm ncbi_taxonomy NCBITaxon:6259 Baylisascaris procyonis raccoon roundworm GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:6264 Toxocara NCBITaxon:33257 GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:6267 Anisakidae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:6268 Anisakis GC_ID:1 herring worm ncbi_taxonomy Ascaris simplex NCBITaxon:6269 Anisakis simplex herring worm Ascaris simplex NCBITaxon:6294 GC_ID:1 ncbi_taxonomy Spirurida NCBITaxon:6274 Spirurina Spirurida GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:6281 Onchocerca GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:6282 Onchocerca volvulus GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:6286 Dirofilaria GC_ID:11 Yersinia ncbi_taxonomy NCBITaxon:629 Yersinia <enterobacteria> Yersinia GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:6295 Filarioidea NCBITaxon:33297 NCBITaxon:6297 GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:6296 Onchocercidae GC_ID:11 ncbi_taxonomy Bacterium enterocoliticum NCBITaxon:630 Yersinia enterocolitica Bacterium enterocoliticum GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:6300 Tylenchina GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:6308 Strongylida GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:6314 Trichostrongyloidea GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:6315 Trichostrongylidae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:6318 Trichostrongylus GC_ID:11 PMID:15084509 ncbi_taxonomy Bacillus pestis Bacterium pestis Pasteurella pestis Pestisella pestis Yersinia pseudotuberculosis subsp. pestis NCBITaxon:632 Yersinia pestis Bacillus pestis Bacterium pestis Pasteurella pestis Pestisella pestis Yersinia pseudotuberculosis subsp. pestis NCBITaxon:36085 NCBITaxon:6331 GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:6329 Trichinellida NCBITaxon:1161941 GC_ID:11 PMID:2223608 PMID:23919959 ncbi_taxonomy Bacillus pseudotuberkulosis Bacterium pseudotuberculosis Pasteurella lymphangitidis Pasteurella pseudotuberculosis Shigella pseudotuberculosis NCBITaxon:633 Yersinia pseudotuberculosis Bacillus pseudotuberkulosis Bacterium pseudotuberculosis Pasteurella lymphangitidis Pasteurella pseudotuberculosis Shigella pseudotuberculosis GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:6332 Trichinellidae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:6333 Trichinella NCBITaxon:45337 GC_ID:1 PMID:7701348 Equine morbillivirus Hendra virus ncbi_taxonomy NCBITaxon:63330 Hendra henipavirus Equine morbillivirus Hendra virus GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:6334 Trichinella spiralis GC_ID:1 annelid worms ncbi_taxonomy segmented worms NCBITaxon:6340 Annelida annelid worms segmented worms GC_ID:1 ncbi_taxonomy Ectotrichophyton verrucosum Favotrichophyton verrucosum NCBITaxon:63417 Trichophyton verrucosum Ectotrichophyton verrucosum Favotrichophyton verrucosum GC_ID:1 ncbi_taxonomy Achorion concentricum Aspergillus concentricum Endodermophyton concentricum Lepidophyton concentricum Mycoderma concentricum Oospora concentrica NCBITaxon:63419 Trichophyton concentricum Achorion concentricum Aspergillus concentricum Endodermophyton concentricum Lepidophyton concentricum Mycoderma concentricum Oospora concentrica GC_ID:1 turban shells ncbi_taxonomy NCBITaxon:63671 Turbinidae turban shells GC_ID:1 Turbo ncbi_taxonomy NCBITaxon:63672 Turbo <genus> Turbo GC_ID:1 ncbi_taxonomy Batillus cornutus Turbo (Batillus) cornutus Turbo (Taeniaturbo) cornutus NCBITaxon:63673 Turbo cornutus Batillus cornutus Turbo (Batillus) cornutus Turbo (Taeniaturbo) cornutus GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:640628 Poinae GC_ID:11 PMID:15143042 PMID:4954820 PMID:8427811 ncbi_taxonomy gamma-3 proteobacteria NCBITaxon:641 Vibrionaceae gamma-3 proteobacteria GC_ID:11 PMID:11155981 PMID:12067377 PMID:12807216 PMID:1380286 PMID:1380289 PMID:15388703 PMID:16560691 PMID:17012583 PMID:17158971 PMID:19567585 PMID:7520733 PMID:8347521 PMID:8934910 ncbi_taxonomy NCBITaxon:642 Aeromonas DCV GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:64279 Drosophila C virus DCV ZIKV GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:64320 Zika virus ZIKV NCBITaxon:1471787 NCBITaxon:1471788 NCBITaxon:329135 NCBITaxon:329140 NCBITaxon:346633 NCBITaxon:346634 NCBITaxon:582196 NCBITaxon:582198 NCBITaxon:582214 NCBITaxon:582215 NCBITaxon:582216 NCBITaxon:582217 NCBITaxon:582218 NCBITaxon:582219 NCBITaxon:582220 NCBITaxon:582221 NCBITaxon:582222 NCBITaxon:582223 NCBITaxon:582224 NCBITaxon:582225 NCBITaxon:582226 NCBITaxon:582228 NCBITaxon:582229 NCBITaxon:582231 NCBITaxon:582236 NCBITaxon:582237 NCBITaxon:582240 NCBITaxon:582250 NCBITaxon:582251 NCBITaxon:582253 NCBITaxon:582254 NCBITaxon:582265 NCBITaxon:582266 NCBITaxon:582267 NCBITaxon:582279 NCBITaxon:582282 NCBITaxon:582284 NCBITaxon:582286 NCBITaxon:582287 NCBITaxon:582289 NCBITaxon:582290 NCBITaxon:582291 NCBITaxon:582292 NCBITaxon:582295 NCBITaxon:582297 NCBITaxon:582299 NCBITaxon:582300 NCBITaxon:582302 NCBITaxon:582303 NCBITaxon:582304 NCBITaxon:582305 NCBITaxon:582306 NCBITaxon:582307 NCBITaxon:582308 NCBITaxon:582309 NCBITaxon:582310 NCBITaxon:582311 NCBITaxon:582312 NCBITaxon:582313 NCBITaxon:582314 NCBITaxon:582315 NCBITaxon:582316 NCBITaxon:582317 NCBITaxon:582318 NCBITaxon:582319 NCBITaxon:582320 NCBITaxon:582321 NCBITaxon:582322 NCBITaxon:582323 NCBITaxon:582324 NCBITaxon:98358 GC_ID:11 PMID:16560691 PMID:19965992 PMID:23485124 PMID:932684 ncbi_taxonomy Aeromonas dourgesi Aeromonas hydrophila (Chester 1901) Stanier 1943 (Approved Lists 1980) Aeromonas liquefaciens Bacillus hydrophilus fuscus Bacterium hydrophilum Proteus hydrophilus Proteus ichthyosmius Pseudomonas hydrophila NCBITaxon:644 Aeromonas hydrophila Aeromonas dourgesi Aeromonas hydrophila (Chester 1901) Stanier 1943 (Approved Lists 1980) Aeromonas liquefaciens Bacillus hydrophilus fuscus Bacterium hydrophilum Proteus hydrophilus Proteus ichthyosmius Pseudomonas hydrophila GC_ID:1 molluscs mollusks ncbi_taxonomy molluscs NCBITaxon:6447 Mollusca molluscs mollusks molluscs GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:644710 Anisakis simplex complex GC_ID:1 gastropods ncbi_taxonomy gastropods NCBITaxon:6448 Gastropoda gastropods gastropods NCBITaxon:1618316 GC_ID:11 PMID:10515907 PMID:10758897 PMID:16585709 PMID:24744012 PMID:27930271 PMID:28141502 PMID:30154058 PMID:30586413 PMID:31454394 PMID:31722850 PMID:31836459 PMID:32320380 PMID:35816828 PMID:36748499 PMID:7981102 PMID:8573491 PMID:8934900 PMID:8995795 PMID:9336916 Lyme Disease Borrelia ncbi_taxonomy Borrelia burgdorferi group Borrelia burgdorferi sensu lato NCBITaxon:64895 Borreliella Lyme Disease Borrelia Borrelia burgdorferi group Borrelia burgdorferi sensu lato GC_ID:1 Lujo virus ncbi_taxonomy NCBITaxon:649188 Lujo mammarenavirus Lujo virus GC_ID:11 Pseudomonas aeruginosa str. PA14 Pseudomonas aeruginosa strain PA14 ncbi_taxonomy NCBITaxon:652611 Pseudomonas aeruginosa PA14 Pseudomonas aeruginosa str. PA14 Pseudomonas aeruginosa strain PA14 GC_ID:1 paralysis tick ncbi_taxonomy NCBITaxon:65647 Ixodes holocyclus paralysis tick NCBITaxon:705 GC_ID:11 PMID:1371064 PMID:17978204 PMID:21057054 PMID:21296930 PMID:24409173 PMID:4935323 PMID:7520733 PMID:8590667 ncbi_taxonomy Beneckea Listonella Microspira Pacinia NCBITaxon:662 Vibrio Beneckea Listonella Microspira Pacinia GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:66225 Phaeoannellomyces GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:66360 Cochliomyia GC_ID:1 arthropods ncbi_taxonomy arthropods NCBITaxon:6656 Arthropoda arthropods arthropods GC_ID:1 crustaceans ncbi_taxonomy crustaceans NCBITaxon:6657 Crustacea crustaceans crustaceans NCBITaxon:140100 NCBITaxon:376726 GC_ID:11 PMID:1015934 PMID:9272984 ncbi_taxonomy Bacillo virgola del Koch Bacillus cholerae Bacillus cholerae-asiaticae Kommabacillus Liquidivibrio cholerae Microspira comma Pacinia cholerae-asiaticae Spirillum cholerae Spirillum cholerae-asiaticae Vibrio albensis Vibrio cholera Vibrio cholerae biovar albensis Vibrio cholerae bv. albensis Vibrio cholerae-asiaticae Vibrio comma NCBITaxon:666 Vibrio cholerae Bacillo virgola del Koch Bacillus cholerae Bacillus cholerae-asiaticae Kommabacillus Liquidivibrio cholerae Microspira comma Pacinia cholerae-asiaticae Spirillum cholerae Spirillum cholerae-asiaticae Vibrio albensis Vibrio cholera Vibrio cholerae biovar albensis Vibrio cholerae bv. albensis Vibrio cholerae-asiaticae Vibrio comma GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:6681 Malacostraca GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:6682 Eucarida GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:6683 Decapoda GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:6684 Dendrobranchiata GC_ID:1 penaeid shrimps ncbi_taxonomy NCBITaxon:6685 Penaeidae penaeid shrimps GC_ID:1 black tiger shrimp giant tiger prawn tiger prawn ncbi_taxonomy Penaeus (Penaeus) monodon Penaeus bubulus Penaeus carinatus Penaeus durbani NCBITaxon:6687 Penaeus monodon black tiger shrimp giant tiger prawn tiger prawn Penaeus (Penaeus) monodon Penaeus bubulus Penaeus carinatus Penaeus durbani GC_ID:1 brown shrimp ncbi_taxonomy Farfantepenaeus aztecus Penaeus (Farfantepenaeus) aztecus NCBITaxon:6690 Penaeus aztecus brown shrimp Farfantepenaeus aztecus Penaeus (Farfantepenaeus) aztecus GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:6692 Pleocyemata GC_ID:11 PMID:1015934 PMID:8186099 ncbi_taxonomy Beneckea vulnifica NCBITaxon:672 Vibrio vulnificus Beneckea vulnifica GC_ID:1 short-tailed crabs true crabs ncbi_taxonomy NCBITaxon:6752 Brachyura short-tailed crabs true crabs GC_ID:1 swimming crabs ncbi_taxonomy NCBITaxon:6757 Portunidae swimming crabs GC_ID:1 mangrove crabs mud crabs ncbi_taxonomy NCBITaxon:6760 Scylla mangrove crabs mud crabs GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:6774 Portunoidea GC_ID:11 ncbi_taxonomy CFB/Chlorobi group CFB/Green sulfur bacteria group Cytophagales/Green sulfur bacteria group NCBITaxon:68336 Bacteroidetes/Chlorobi group CFB/Chlorobi group CFB/Green sulfur bacteria group Cytophagales/Green sulfur bacteria group GC_ID:1 chelicerates ncbi_taxonomy NCBITaxon:6843 Chelicerata chelicerates GC_ID:6 ncbi_taxonomy NCBITaxon:68459 Giardiinae GC_ID:11 PMID:11837318 ncbi_taxonomy NCBITaxon:68525 delta/epsilon subdivisions GC_ID:1 arachnids ncbi_taxonomy arachnids NCBITaxon:6854 Arachnida arachnids arachnids GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:685953 Philophthalmus GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:69034 Rotaliidae GC_ID:1 mites and ticks ncbi_taxonomy Acarina mites & ticks NCBITaxon:6933 Acari mites and ticks Acarina mites & ticks GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:6934 Parasitiformes GC_ID:1 ticks ncbi_taxonomy NCBITaxon:6935 Ixodida ticks GC_ID:1 soft ticks softbacked ticks ncbi_taxonomy NCBITaxon:6936 Argasidae soft ticks softbacked ticks GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:693660 unclassified Primate lentivirus group GC_ID:1 relapsing fever ticks ncbi_taxonomy NCBITaxon:6937 Ornithodoros relapsing fever ticks GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:693762 Schizaeales GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:693766 Anemiaceae GC_ID:1 hard ticks hardbacked ticks scale ticks ncbi_taxonomy NCBITaxon:6939 Ixodidae hard ticks hardbacked ticks scale ticks GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:693995 Coronavirinae NCBITaxon:156438 NCBITaxon:446038 GC_ID:1 Coronavirus group 1 Group 1 species ncbi_taxonomy Coronavirus NCBITaxon:693996 Alphacoronavirus Coronavirus group 1 Group 1 species Coronavirus GC_ID:1 Alphacoronavirus-1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:693997 Alphacoronavirus 1 Alphacoronavirus-1 NCBITaxon:156439 GC_ID:1 Coronavirus group 2 Group 2 species ncbi_taxonomy Coronavirus NCBITaxon:694002 Betacoronavirus Coronavirus group 2 Group 2 species Coronavirus NCBITaxon:227859 NCBITaxon:311178 HCoV-SARS SARS SARSr-CoV SARSrCoV GC_ID:1 Human coronavirus (strain SARS) SARS-like coronavirus SARS-related coronavirus ncbi_taxonomy NCBITaxon:694009 Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus HCoV-SARS SARS SARSr-CoV SARSrCoV Human coronavirus (strain SARS) SARS-like coronavirus SARS-related coronavirus NCBITaxon:156440 GC_ID:1 Coronavirus group 3 Group 3 species ncbi_taxonomy Coronavirus NCBITaxon:694013 Gammacoronavirus Coronavirus group 3 Group 3 species Coronavirus ACoV GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:694014 Avian coronavirus ACoV GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:694017 Torovirinae NCBITaxon:34616 GC_ID:1 PMID:12386418 ncbi_taxonomy Aponomma NCBITaxon:6942 Amblyomma Aponomma GC_ID:1 Lone Star tick ncbi_taxonomy Haemalastor americanus NCBITaxon:6943 Amblyomma americanum Lone Star tick Haemalastor americanus GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:6944 Ixodes NCBITaxon:2528633 NCBITaxon:29929 GC_ID:1 black-legged tick blacklegged tick deer tick shoulder tick ncbi_taxonomy Ixodes dammini NCBITaxon:6945 Ixodes scapularis black-legged tick blacklegged tick deer tick shoulder tick Ixodes dammini GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:6946 Acariformes GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:6947 Prostigmata GC_ID:11 PMID:8590688 ncbi_taxonomy NCBITaxon:69474 Orientia NCBITaxon:41437 NCBITaxon:41440 NCBITaxon:41441 GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:6951 Astigmata GC_ID:1 insects ncbi_taxonomy Atelocerata Tracheata Uniramia hexapods NCBITaxon:6960 Hexapoda insects Atelocerata Tracheata Uniramia hexapods NCBITaxon:1195892 GC_ID:1 ncbi_taxonomy Citromyces glaber Citromyces glaber Wehmer, 1911 Penicillium frequentans NCBITaxon:69773 Penicillium glabrum Citromyces glaber Citromyces glaber Wehmer, 1911 Penicillium frequentans GC_ID:1 ncbi_taxonomy Argas savignyi NCBITaxon:69826 Ornithodoros savignyi Argas savignyi GC_ID:1 ncbi_taxonomy Oxyurida NCBITaxon:70426 Oxyuridomorpha Oxyurida GC_ID:1 butterflies and moths moths ncbi_taxonomy moths NCBITaxon:7088 Lepidoptera butterflies and moths moths moths GC_ID:1 kissing bugs ncbi_taxonomy NCBITaxon:70999 Triatominae kissing bugs GC_ID:11 PMID:10843050 PMID:15280320 PMID:15388716 PMID:17220461 PMID:2223605 PMID:29923825 ncbi_taxonomy NCBITaxon:712 Pasteurellaceae NCBITaxon:3399 GC_ID:1 PMID:25249442 PMID:26724406 ncbi_taxonomy Dicotyledoneae dicots dicotyledons eudicots NCBITaxon:71240 eudicotyledons Dicotyledoneae dicots dicotyledons eudicots GC_ID:1 PMID:12144762 Asteridae ncbi_taxonomy NCBITaxon:71274 asterids Asteridae GC_ID:1 ncbi_taxonomy Rosidae NCBITaxon:71275 rosids Rosidae GC_ID:11 PMID:15143001 PMID:1736960 ncbi_taxonomy NCBITaxon:713 Actinobacillus GC_ID:1 flies ncbi_taxonomy flies NCBITaxon:7147 Diptera flies flies GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:7148 Nematocera GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:715340 Pleosporineae GC_ID:1 mosquitos ncbi_taxonomy mosquitos NCBITaxon:7157 Culicidae mosquitos mosquitos GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:71583 Balantidiidae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:71584 Balantidium GC_ID:1 PMID:23556024 PMID:25185665 ncbi_taxonomy Balantidium coli Neobalantidium coli Paramecium coli NCBITaxon:71585 Balantioides coli Balantidium coli Neobalantidium coli Paramecium coli GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:715962 dothideomyceta GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:715989 sordariomyceta NCBITaxon:190384 GC_ID:1 ncbi_taxonomy Aedes triseriatus NCBITaxon:7162 Ochlerotatus triseriatus Aedes triseriatus GC_ID:1 Anopheles ncbi_taxonomy NCBITaxon:7164 Anopheles <genus> Anopheles NCBITaxon:377270 GC_ID:1 PMID:16076241 African malaria mosquito Anopheles gambiae sensu stricto ncbi_taxonomy Anopheles gambiae S NCBITaxon:7165 Anopheles gambiae African malaria mosquito Anopheles gambiae sensu stricto Anopheles gambiae S GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:716545 saccharomyceta GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:716546 leotiomyceta NCBITaxon:44555 GC_ID:1 Culex ncbi_taxonomy NCBITaxon:7174 Culex <genus> Culex GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:7178 Culex tritaeniorhynchus GC_ID:1 Haemagogus ncbi_taxonomy NCBITaxon:7180 Haemagogus <genus> Haemagogus GC_ID:1 sandflies and mothflies ncbi_taxonomy NCBITaxon:7197 Psychodidae sandflies and mothflies GC_ID:1 PMID:9835021 sand flies sandflies ncbi_taxonomy NCBITaxon:7198 Phlebotominae sand flies sandflies GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:7203 Brachycera GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:72041 Eumalacostraca GC_ID:1 deerflies horseflies horseflies and deerflies ncbi_taxonomy NCBITaxon:7205 Tabanidae deerflies horseflies horseflies and deerflies GC_ID:1 pomace flies ncbi_taxonomy NCBITaxon:7214 Drosophilidae pomace flies NCBITaxon:7326 GC_ID:1 Drosophila fruit flies fruit fly ncbi_taxonomy NCBITaxon:7215 Drosophila <flies,genus> Drosophila fruit flies fruit fly GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:721805 Amygdaleae NCBITaxon:721812 GC_ID:1 ncbi_taxonomy Pyreae Pyrodae NCBITaxon:721813 Maleae Pyreae Pyrodae NCBITaxon:2267365 GC_ID:1 fruit fly ncbi_taxonomy Sophophora melanogaster NCBITaxon:7227 Drosophila melanogaster fruit fly Sophophora melanogaster GC_ID:11 ncbi_taxonomy Thiomicrospira group Thiothrix/Francisella group NCBITaxon:72273 Thiotrichales Thiomicrospira group Thiothrix/Francisella group GC_ID:11 ncbi_taxonomy Pseudomonaceae/Moraxellaceae group gamma-3 proteobacteria NCBITaxon:72274 Pseudomonadales Pseudomonaceae/Moraxellaceae group gamma-3 proteobacteria GC_ID:11 PMID:16403855 PMID:29034857 ncbi_taxonomy Helicobacter group NCBITaxon:72293 Helicobacteraceae Helicobacter group GC_ID:11 PMID:29034857 ncbi_taxonomy Campylobacter group NCBITaxon:72294 Campylobacteraceae Campylobacter group GC_ID:11 ncbi_taxonomy Pasterella haemolytica var. ureae Pasteurella ureae NCBITaxon:723 Actinobacillus ureae Pasterella haemolytica var. ureae Pasteurella ureae GC_ID:11 PMID:1736960 ncbi_taxonomy NCBITaxon:724 Haemophilus GC_ID:11 ncbi_taxonomy Bacterium influenzae Coccobacillus pfeifferi Haemophilus meningitidis Influenza-bacillus Mycobacterium influenzae NCBITaxon:727 Haemophilus influenzae Bacterium influenzae Coccobacillus pfeifferi Haemophilus meningitidis Influenza-bacillus Mycobacterium influenzae GC_ID:11 ncbi_taxonomy Bacillus ulceris cancrosi Coccobacillus ducreyi Haemophilus ducreyi NCBITaxon:730 [Haemophilus] ducreyi Bacillus ulceris cancrosi Coccobacillus ducreyi Haemophilus ducreyi GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:73421 Dicrocoeliidae GC_ID:1 blow flies blow flly blow-fly blowflies blowflly bottle flies ncbi_taxonomy NCBITaxon:7371 Calliphoridae blow flies blow flly blow-fly blowflies blowflly bottle flies GC_ID:1 bot flies botflies warble flies ncbi_taxonomy NCBITaxon:7387 Oestridae bot flies botflies warble flies GC_ID:1 PMID:20093080 ncbi_taxonomy Trichomonadida Kirby, 1947, emend. Brugerolle and Patterson, 2001 NCBITaxon:740972 Tritrichomonadida Trichomonadida Kirby, 1947, emend. Brugerolle and Patterson, 2001 NCBITaxon:135586 GC_ID:1 ncbi_taxonomy Protrichomonadinae NCBITaxon:740973 Dientamoebidae Protrichomonadinae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:742845 Malasseziaceae GC_ID:11 PMID:1736960 ncbi_taxonomy NCBITaxon:745 Pasteurella GC_ID:11 PMID:15184562 ncbi_taxonomy Bacterium multocidum Micrococcus gallicidus Pasteurella cholerae-gallinarum Pasteurella gallicida NCBITaxon:747 Pasteurella multocida Bacterium multocidum Micrococcus gallicidus Pasteurella cholerae-gallinarum Pasteurella gallicida GC_ID:1 Pterygota winged insects ncbi_taxonomy NCBITaxon:7496 Pterygota <insects> Pterygota winged insects NCBITaxon:27416 NCBITaxon:7510 GC_ID:1 fleas ncbi_taxonomy fleas NCBITaxon:7509 Siphonaptera fleas fleas GC_ID:1 common fleas ncbi_taxonomy NCBITaxon:7511 Pulicidae common fleas GC_ID:1 PMID:7666451 ncbi_taxonomy bugs NCBITaxon:7524 Hemiptera bugs GC_ID:1 ncbi_taxonomy Eucoccidiida NCBITaxon:75739 Eucoccidiorida Eucoccidiida GC_ID:1 echinoderms ncbi_taxonomy echinoderms NCBITaxon:7586 Echinodermata echinoderms echinoderms NCBITaxon:1827202 GC_ID:1 PMID:23020233 ncbi_taxonomy NCBITaxon:75966 Trebouxiophyceae GC_ID:11 PMID:11760958 PMID:8240958 rickettsias ncbi_taxonomy alpha-1 proteobacteria NCBITaxon:766 Rickettsiales rickettsias alpha-1 proteobacteria GC_ID:12 ncbi_taxonomy NCBITaxon:766764 Debaryomycetaceae GC_ID:11 PMID:11760958 ncbi_taxonomy NCBITaxon:768 Anaplasma GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:76803 Arteriviridae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:76804 Nidovirales GC_ID:1 chordates ncbi_taxonomy chordates NCBITaxon:7711 Chordata chordates chordates GC_ID:11 PMID:8240958 ncbi_taxonomy Bartonella group NCBITaxon:772 Bartonellaceae Bartonella group NCBITaxon:802 GC_ID:11 PMID:10425758 PMID:11837299 PMID:12508871 PMID:35157842 PMID:7857789 PMID:8240958 PMID:8863415 ncbi_taxonomy "Bartonia" Strong et al. 1913 Grahamella Grahmia Rocha-Limae Rochalimaea NCBITaxon:773 Bartonella "Bartonia" Strong et al. 1913 Grahamella Grahmia Rocha-Limae Rochalimaea GC_ID:11 ncbi_taxonomy Bartonia bacilliformis NCBITaxon:774 Bartonella bacilliformis Bartonia bacilliformis GC_ID:1 Vertebrata vertebrates ncbi_taxonomy vertebrates NCBITaxon:7742 Vertebrata <vertebrates> Vertebrata vertebrates vertebrates GC_ID:11 PMID:11760958 PMID:2592342 PMID:8240958 ncbi_taxonomy NCBITaxon:775 Rickettsiaceae GC_ID:11 Coxiella ncbi_taxonomy Burnetia NCBITaxon:776 Coxiella <g-proteobacteria> Coxiella Burnetia GC_ID:11 PMID:15243089 PMID:29205127 Mycobacterium complex ncbi_taxonomy NCBITaxon:77643 Mycobacterium tuberculosis complex Mycobacterium complex GC_ID:11 PMID:9226923 ncbi_taxonomy Rickettsia burneti Rickettsia diaporica NCBITaxon:777 Coxiella burnetii Rickettsia burneti Rickettsia diaporica GC_ID:1 Gnathostomata jawed vertebrates ncbi_taxonomy NCBITaxon:7776 Gnathostomata <vertebrates> Gnathostomata jawed vertebrates GC_ID:1 cartilaginous fishes fish fishes ncbi_taxonomy cartilaginous fishes NCBITaxon:7777 Chondrichthyes cartilaginous fishes fish fishes cartilaginous fishes GC_ID:1 elasmobranchs ncbi_taxonomy sharks and rays NCBITaxon:7778 Elasmobranchii elasmobranchs sharks and rays GC_ID:11 PMID:11414267 PMID:11760958 PMID:1380292 PMID:1581187 heartwater rickettsia ncbi_taxonomy Cowdria ruminantium Kurlovia ruminantium Nicollea ruminantium Rickettsia ruminantium NCBITaxon:779 Ehrlichia ruminantium heartwater rickettsia Cowdria ruminantium Kurlovia ruminantium Nicollea ruminantium Rickettsia ruminantium GC_ID:11 PMID:10939649 PMID:11491333 PMID:14662925 PMID:9103608 ncbi_taxonomy NCBITaxon:780 Rickettsia GC_ID:11 PMID:15766388 PMID:15879256 ncbi_taxonomy Rickettsia conorii corrig. Brumpt 1932 (Approved Lists 1980) NCBITaxon:781 Rickettsia conorii Rickettsia conorii corrig. Brumpt 1932 (Approved Lists 1980) GC_ID:11 PMID:15879256 ncbi_taxonomy NCBITaxon:782 Rickettsia prowazekii GC_ID:11 ncbi_taxonomy Dermacentroxenus rickettsii NCBITaxon:783 Rickettsia rickettsii Dermacentroxenus rickettsii GC_ID:11 PMID:1906730 PMID:8590688 ncbi_taxonomy Rickettsia akamushi Rickettsia orientalis Rickettsia tsutsugamushi Theileria tsutsugamushi NCBITaxon:784 Orientia tsutsugamushi Rickettsia akamushi Rickettsia orientalis Rickettsia tsutsugamushi Theileria tsutsugamushi GC_ID:11 ncbi_taxonomy Dermacentroxenus typhi Rickettsia mooseri NCBITaxon:785 Rickettsia typhi Dermacentroxenus typhi Rickettsia mooseri GC_ID:1 euphyllophytes ncbi_taxonomy NCBITaxon:78536 Euphyllophyta euphyllophytes GC_ID:11 agent of rickettsialpox rickettsialpox ncbi_taxonomy Dermacentroxenus murinus Gamasoxenus muris NCBITaxon:786 Rickettsia akari agent of rickettsialpox rickettsialpox Dermacentroxenus murinus Gamasoxenus muris GC_ID:11 PMID:11034486 ncbi_taxonomy NCBITaxon:787 Rickettsia australis GC_ID:1 fish fishes ray-finned fishes ncbi_taxonomy Actinopterygi Osteichthyes bony fishes NCBITaxon:7898 Actinopterygii fish fishes ray-finned fishes Actinopterygi Osteichthyes bony fishes GC_ID:1 carps and others ncbi_taxonomy NCBITaxon:7952 Cypriniformes carps and others GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:7953 Cyprinidae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:7961 Cyprinus GC_ID:1 carp common carp fancy carp koi mirror carp ncbi_taxonomy NCBITaxon:7962 Cyprinus carpio carp common carp fancy carp koi mirror carp GC_ID:1 salmons and trouts ncbi_taxonomy NCBITaxon:8006 Salmoniformes salmons and trouts GC_ID:1 PMID:15062801 salmonids ncbi_taxonomy NCBITaxon:8015 Salmonidae salmonids GC_ID:1 ncbi_taxonomy Parasalmo NCBITaxon:8016 Oncorhynchus Parasalmo NCBITaxon:1311475 GC_ID:1 rainbow trout ncbi_taxonomy Oncorhynchus nerka mykiss Parasalmo mykiss Salmo mykiss NCBITaxon:8022 Oncorhynchus mykiss rainbow trout Oncorhynchus nerka mykiss Parasalmo mykiss Salmo mykiss NCBITaxon:62064 NCBITaxon:82302 GC_ID:1 ncbi_taxonomy Acantholingua Salmothymus NCBITaxon:8028 Salmo Acantholingua Salmothymus GC_ID:11 PMID:8240958 ncbi_taxonomy Burnetia (Rocha-limae) wolhynica Rickettsia pediculi Rickettsia quintana Rickettsia weigli Rickettsia wolhynica Rochalimaea quintana Wolhynia qintanae NCBITaxon:803 Bartonella quintana Burnetia (Rocha-limae) wolhynica Rickettsia pediculi Rickettsia quintana Rickettsia weigli Rickettsia wolhynica Rochalimaea quintana Wolhynia qintanae GC_ID:1 Atlantic salmon ncbi_taxonomy NCBITaxon:8030 Salmo salar Atlantic salmon GC_ID:1 cods and others ncbi_taxonomy NCBITaxon:8043 Gadiformes cods and others NCBITaxon:185742 GC_ID:1 cods tadpole cod ncbi_taxonomy Ranicipitidae NCBITaxon:8045 Gadidae cods tadpole cod Ranicipitidae NCBITaxon:48549 GC_ID:1 ncbi_taxonomy Theragra NCBITaxon:8048 Gadus Theragra GC_ID:1 Atlantic cod ncbi_taxonomy NCBITaxon:8049 Gadus morhua Atlantic cod GC_ID:11 PMID:16403855 ncbi_taxonomy Burkholderia/Oxalobacter/Ralstonia group NCBITaxon:80840 Burkholderiales Burkholderia/Oxalobacter/Ralstonia group GC_ID:11 PMID:10319462 PMID:10319506 PMID:11211261 PMID:11211265 PMID:25618261 ncbi_taxonomy NCBITaxon:809 Chlamydiaceae NCBITaxon:83553 GC_ID:11 PMID:10319462 PMID:11211265 PMID:21048221 PMID:21048222 PMID:23620152 PMID:25618261 PMID:9103632 PMID:9103637 ncbi_taxonomy "Prowazekia" Coles 1953 Bedsonia Chlamydophila Miyagawanella Rakeia Rickettsiaformis NCBITaxon:810 Chlamydia "Prowazekia" Coles 1953 Bedsonia Chlamydophila Miyagawanella Rakeia Rickettsiaformis GC_ID:11 PMID:10192388 PMID:10319462 PMID:8102247 PMID:8347519 ncbi_taxonomy Chlamydozoon trachomatis Rickettsia trachomae Rickettsia trachomatis NCBITaxon:813 Chlamydia trachomatis Chlamydozoon trachomatis Rickettsia trachomae Rickettsia trachomatis GC_ID:11 PMID:8300528 ncbi_taxonomy NCBITaxon:815 Bacteroidaceae GC_ID:11 ncbi_taxonomy Capsularis Ristella NCBITaxon:816 Bacteroides Capsularis Ristella GC_ID:11 ncbi_taxonomy NCBITaxon:81852 Enterococcaceae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:82105 Cladophialophora GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:8287 Sarcopterygii GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:83136 Trombidiformes GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:83137 Sarcoptiformes GC_ID:1 ncbi_taxonomy Anystides NCBITaxon:83138 Anystina Anystides GC_ID:1 velvet mites ncbi_taxonomy Parasitengonae NCBITaxon:83141 Parasitengona velvet mites Parasitengonae GC_ID:1 ncbi_taxonomy Eleutherengonides NCBITaxon:83145 Eleutherengona Eleutherengonides GC_ID:1 ncbi_taxonomy Listrophoroidea Psoroptoidea NCBITaxon:83158 Sarcoptoidea Listrophoroidea Psoroptoidea GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:84526 Heterophyidae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:84527 Metagonimus NCBITaxon:1193293 GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:84529 Metagonimus yokogawai GC_ID:1 sauropsids ncbi_taxonomy NCBITaxon:8457 Sauropsida sauropsids GC_ID:11 ncbi_taxonomy Aeromonas group NCBITaxon:84642 Aeromonadaceae Aeromonas group GC_ID:11 PMID:11931161 PMID:1715737 Fusibacterium ncbi_taxonomy NCBITaxon:848 Fusobacterium Fusibacterium GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:8492 Archosauria GC_ID:11 PMID:19244447 PMID:27446019 ncbi_taxonomy NCBITaxon:85004 Bifidobacteriales GC_ID:11 PMID:11837321 PMID:19244447 PMID:19542112 PMID:20190019 PMID:30186281 ncbi_taxonomy Micrococcineae NCBITaxon:85006 Micrococcales Micrococcineae NCBITaxon:1761 GC_ID:11 PMID:11837321 PMID:1736962 PMID:19244447 PMID:31157615 ncbi_taxonomy Corynebacteriales Corynebacteriales Goodfellow and Jones 2015 Corynebacterineae Mycobacteriales Janke 1924 (Approved Lists 1980) NCBITaxon:85007 Mycobacteriales Corynebacteriales Corynebacteriales Goodfellow and Jones 2015 Corynebacterineae Mycobacteriales Janke 1924 (Approved Lists 1980) NCBITaxon:182102 GC_ID:11 PMID:19244447 PMID:30186281 ncbi_taxonomy Williamsiaceae NCBITaxon:85025 Nocardiaceae Williamsiaceae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:85512 Dicondylia GC_ID:1 green mud crab ncbi_taxonomy NCBITaxon:85552 Scylla paramamosain green mud crab GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:85604 Amphiesmenoptera PCV2 GC_ID:1 Porcine circovirus Type II Porcine circovirus type 2 Porcine circovirus-2 ncbi_taxonomy NCBITaxon:85708 Porcine circovirus 2 PCV2 Porcine circovirus Type II Porcine circovirus type 2 Porcine circovirus-2 GC_ID:1 lice ncbi_taxonomy lice NCBITaxon:85819 Phthiraptera lice lice GC_ID:1 ncbi_taxonomy Ramichloridium mackenziei NCBITaxon:86056 Rhinocladiella mackenziei Ramichloridium mackenziei GC_ID:1 Mus ncbi_taxonomy NCBITaxon:862507 Mus <subgenus> Mus GC_ID:11 PMID:1715736 PMID:23475340 PMID:26373441 ncbi_taxonomy NCBITaxon:86661 Bacillus cereus group GC_ID:1 birds ncbi_taxonomy avian birds NCBITaxon:8782 Aves birds avian birds GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:8825 Neognathae GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:88456 Cyclospora cayetanensis GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:88770 Panarthropoda GC_ID:1 Craniata ncbi_taxonomy NCBITaxon:89593 Craniata <chordates> Craniata GC_ID:1 landfowls ncbi_taxonomy NCBITaxon:8976 Galliformes landfowls NCBITaxon:5590 GC_ID:1 ncbi_taxonomy Cladosporium bantianum Cladosporium trichoides Torula bantiana Xylohypha bantiana NCBITaxon:89940 Cladophialophora bantiana Cladosporium bantianum Cladosporium trichoides Torula bantiana Xylohypha bantiana GC_ID:1 unclassified Enteroviruses ncbi_taxonomy NCBITaxon:90010 unclassified Enterovirus unclassified Enteroviruses NCBITaxon:9099 GC_ID:1 turkeys ncbi_taxonomy NCBITaxon:9005 Phasianidae turkeys GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:9030 Gallus GC_ID:1 Gallus domesticus bantam chicken chickens ncbi_taxonomy Gallus gallus domesticus Phasianus gallus NCBITaxon:9031 Gallus gallus Gallus domesticus bantam chicken chickens Gallus gallus domesticus Phasianus gallus GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:90338 Rhinosporidium GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:90339 Rhinosporidium seeberi GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:9072 Phasianinae GC_ID:11 ncbi_taxonomy Staphylococcus group NCBITaxon:90964 Staphylococcaceae Staphylococcus group GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:9102 Meleagris GC_ID:1 common turkey turkey wild turkey ncbi_taxonomy NCBITaxon:9103 Meleagris gallopavo common turkey turkey wild turkey GC_ID:11 ncbi_taxonomy Bacillus/Lactobacillus/Streptococcus group Firmibacteria NCBITaxon:91061 Bacilli Bacillus/Lactobacillus/Streptococcus group Firmibacteria GC_ID:11 PMID:27620848 ncbi_taxonomy Enterobacteriaceae and related endosymbionts Enterobacteriaceae group Enterobacteriales gamma-3 proteobacteria NCBITaxon:91347 Enterobacterales Enterobacteriaceae and related endosymbionts Enterobacteriaceae group Enterobacteriales gamma-3 proteobacteria NCBITaxon:39952 GC_ID:1 ncbi_taxonomy Setosphaeria NCBITaxon:91493 Exserohilum Setosphaeria GC_ID:1 whales, hippos, ruminants, pigs, camels etc. ncbi_taxonomy Cetartiodactyla even-toed ungulates NCBITaxon:91561 Artiodactyla whales, hippos, ruminants, pigs, camels etc. Cetartiodactyla even-toed ungulates NCBITaxon:1437200 GC_ID:1 core eudicots core eudicotyledons ncbi_taxonomy NCBITaxon:91827 Gunneridae core eudicots core eudicotyledons NCBITaxon:41939 NCBITaxon:4293 GC_ID:1 ncbi_taxonomy eurosids I NCBITaxon:91835 fabids eurosids I NCBITaxon:41935 GC_ID:1 PMID:12144762 ncbi_taxonomy euasterids I NCBITaxon:91888 lamiids euasterids I GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:92088 Trombiculoidea GC_ID:1 chiggers harvest mites redbugs ncbi_taxonomy NCBITaxon:92251 Trombiculidae chiggers harvest mites redbugs NCBITaxon:134361 NCBITaxon:371109 GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:92860 Pleosporales GC_ID:1 eutherian mammals placental mammals placentals ncbi_taxonomy Placentalia placentals NCBITaxon:9347 Eutheria eutherian mammals placental mammals placentals Placentalia placentals GC_ID:11 PMID:11760958 ncbi_taxonomy NCBITaxon:942 Anaplasmataceae NCBITaxon:778 GC_ID:11 PMID:11414267 PMID:11760958 ncbi_taxonomy Cowdria Ehrlichia (subgen. Cowdria) Kurlovia Nicollea Rickettsia (subgen. Ehrlichia) possibly "Donatienella" Rousselot 1948 NCBITaxon:943 Ehrlichia Cowdria Ehrlichia (subgen. Cowdria) Kurlovia Nicollea Rickettsia (subgen. Ehrlichia) possibly "Donatienella" Rousselot 1948 GC_ID:1 primate ncbi_taxonomy Primata primates NCBITaxon:9443 Primates primate Primata primates GC_ID:11 PMID:11760958 PMID:1757557 ncbi_taxonomy NCBITaxon:945 Ehrlichia chaffeensis NCBITaxon:59888 NCBITaxon:75053 NCBITaxon:75115 NCBITaxon:946 GC_ID:11 PMID:1115421 PMID:11760958 PMID:12215262 PMID:8195363 agent of human granulocytic ehrlichiosis ncbi_taxonomy Anaplasma phagocytophila Cytoecetes bovis Cytoecetes phagocytophila Ehrlichia equi Ehrlichia phagocytophila (Foggie 1949) Philip 1962 (Approved Lists 1980) Ehrlichia sp. 'HGE agent' HGE agent Rickettsia phagocytophila ovis human granulocytic Ehrlichia NCBITaxon:948 Anaplasma phagocytophilum agent of human granulocytic ehrlichiosis Anaplasma phagocytophila Cytoecetes bovis Cytoecetes phagocytophila Ehrlichia equi Ehrlichia phagocytophila (Foggie 1949) Philip 1962 (Approved Lists 1980) Ehrlichia sp. 'HGE agent' HGE agent Rickettsia phagocytophila ovis human granulocytic Ehrlichia GC_ID:11 PMID:11594628 PMID:11760958 PMID:1736961 ncbi_taxonomy Ehrlichia sennetsu Rickettsia sennetsu NCBITaxon:951 Neorickettsia sennetsu Ehrlichia sennetsu Rickettsia sennetsu GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:9526 Catarrhini GC_ID:1 Old World monkeys monkey monkeys ncbi_taxonomy NCBITaxon:9527 Cercopithecidae Old World monkeys monkey monkeys GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:9528 Cercopithecinae GC_ID:1 macaque macaques ncbi_taxonomy NCBITaxon:9539 Macaca macaque macaques GC_ID:1 baboons ncbi_taxonomy NCBITaxon:9554 Papio baboons GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:9592 Gorilla NCBITaxon:317028 NCBITaxon:445518 GC_ID:1 chimpanzees ncbi_taxonomy NCBITaxon:9596 Pan chimpanzees GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:9599 Pongo GC_ID:1 great apes ncbi_taxonomy Pongidae NCBITaxon:9604 Hominidae great apes Pongidae GC_ID:1 humans ncbi_taxonomy NCBITaxon:9605 Homo humans GC_ID:1 human ncbi_taxonomy NCBITaxon:9606 Homo sapiens human GC_ID:1 dog, coyote, wolf, fox ncbi_taxonomy NCBITaxon:9608 Canidae dog, coyote, wolf, fox GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:9611 Canis GC_ID:1 gray wolf grey wolf ncbi_taxonomy NCBITaxon:9612 Canis lupus gray wolf grey wolf GC_ID:1 dog dogs ncbi_taxonomy Canis canis Canis domesticus Canis familiaris NCBITaxon:9615 Canis lupus familiaris dog dogs Canis canis Canis domesticus Canis familiaris GC_ID:1 bears ncbi_taxonomy NCBITaxon:9632 Ursidae bears NCBITaxon:29068 GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:9639 Ursus GC_ID:1 raccoon, coati & olingo ncbi_taxonomy NCBITaxon:9647 Procyonidae raccoon, coati & olingo GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:9653 Procyon GC_ID:1 PMID:14745111 PMID:18275614 weasel, mink, badger, martens and others ncbi_taxonomy NCBITaxon:9655 Mustelidae weasel, mink, badger, martens and others GC_ID:11 PMID:19625415 ncbi_taxonomy NCBITaxon:967 Spirillum GC_ID:1 cat family ncbi_taxonomy NCBITaxon:9681 Felidae cat family GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:9682 Felis NCBITaxon:36475 GC_ID:1 PMID:17600185 PMID:8581300 PMID:8603894 cat cats domestic cat ncbi_taxonomy Felis domesticus Felis silvestris catus NCBITaxon:9685 Felis catus cat cats domestic cat Felis domesticus Felis silvestris catus NCBITaxon:171554 GC_ID:11 PMID:11541229 PMID:11542017 PMID:28066339 BCF group Bacteroides-Cytophaga-Flexibacter group CFB group Cytophaga-Flexibacter-Bacteroides phylum ncbi_taxonomy "Bacteroidota" Whitman et al. 2018 Bacteroidetes CFB group bacteria Sphingobacteria NCBITaxon:976 Bacteroidota BCF group Bacteroides-Cytophaga-Flexibacter group CFB group Cytophaga-Flexibacter-Bacteroides phylum "Bacteroidota" Whitman et al. 2018 Bacteroidetes CFB group bacteria Sphingobacteria GC_ID:1 odd-toed ungulates ncbi_taxonomy odd-toed ungulates NCBITaxon:9787 Perissodactyla odd-toed ungulates odd-toed ungulates GC_ID:1 horses ncbi_taxonomy NCBITaxon:9788 Equidae horses NCBITaxon:1225530 NCBITaxon:35506 NCBITaxon:35507 NCBITaxon:35508 NCBITaxon:35509 NCBITaxon:35510 NCBITaxon:475184 GC_ID:1 ncbi_taxonomy Amerhippus Asinus Dolichohippus Equus subg. Amerhippus Equus subg. Asinus Equus subg. Dolichohippus Equus subg. Equus Equus subg. Hemionus Equus subg. Hippotigris Equus subgen. Sussemionus Hemionus Hippotigris Sussemionus NCBITaxon:9789 Equus Amerhippus Asinus Dolichohippus Equus subg. Amerhippus Equus subg. Asinus Equus subg. Dolichohippus Equus subg. Equus Equus subg. Hemionus Equus subg. Hippotigris Equus subgen. Sussemionus Hemionus Hippotigris Sussemionus NCBITaxon:9797 GC_ID:1 African ass African wild ass Somali wild ass ass domestic ass donkey ncbi_taxonomy NCBITaxon:9793 Equus asinus African ass African wild ass Somali wild ass ass domestic ass donkey GC_ID:1 domestic horse equine horse ncbi_taxonomy Equus przewalskii f. caballus Equus przewalskii forma caballus NCBITaxon:9796 Equus caballus domestic horse equine horse Equus przewalskii f. caballus Equus przewalskii forma caballus NCBITaxon:39423 GC_ID:1 boars pigs ncbi_taxonomy NCBITaxon:9821 Suidae boars pigs GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:9822 Sus GC_ID:1 pig pigs swine wild boar ncbi_taxonomy NCBITaxon:9823 Sus scrofa pig pigs swine wild boar GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:9845 Ruminantia GC_ID:1 deer ncbi_taxonomy NCBITaxon:9850 Cervidae deer GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:9895 Bovidae GC_ID:1 oxen, cattle ncbi_taxonomy NCBITaxon:9903 Bos oxen, cattle NCBITaxon:272461 GC_ID:1 bovine cattle cow dairy cow domestic cattle domestic cow ox oxen ncbi_taxonomy Bos bovis Bos primigenius taurus NCBITaxon:9913 Bos taurus bovine cattle cow dairy cow domestic cattle domestic cow ox oxen Bos bovis Bos primigenius taurus GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:9922 Capra NCBITaxon:57076 GC_ID:1 domestic goat goat goats ncbi_taxonomy Capra aegagrus hircus NCBITaxon:9925 Capra hircus domestic goat goat goats Capra aegagrus hircus GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:9935 Ovis NCBITaxon:9936 GC_ID:1 domestic sheep lambs sheep wild sheep ncbi_taxonomy Ovis ammon aries Ovis orientalis aries Ovis ovis NCBITaxon:9940 Ovis aries domestic sheep lambs sheep wild sheep Ovis ammon aries Ovis orientalis aries Ovis ovis GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:9963 Caprinae GC_ID:1 ncbi_taxonomy rabbits & hares NCBITaxon:9975 Lagomorpha rabbits & hares GC_ID:1 rabbits and hares ncbi_taxonomy NCBITaxon:9979 Leporidae rabbits and hares GC_ID:1 ncbi_taxonomy NCBITaxon:9984 Oryctolagus NCBITaxon:34833 NCBITaxon:9985 GC_ID:1 European rabbit Japanese white rabbit domestic rabbit rabbit rabbits ncbi_taxonomy Lepus cuniculus NCBITaxon:9986 Oryctolagus cuniculus European rabbit Japanese white rabbit domestic rabbit rabbit rabbits Lepus cuniculus GC_ID:1 rodent ncbi_taxonomy rodents NCBITaxon:9989 Rodentia rodent rodents